Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YKI8

Protein Details
Accession A0A2C5YKI8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
330-349AKLSTKSVSRKNRRDLRENLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-25KTVSRKARKSG
455-466RRPRPSAKSRKR
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 12, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039777  IFRD  
IPR007701  Interferon-rel_develop_reg_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF05004  IFRD  
Amino Acid Sequences MMNHARVKALKGDGKTVSRKARKSGRASGALTPQGTSPAASLLTSPVQSASHSRVPSDASDEEEDADFEFDDVASSVHSLGSGAESPEDSTGTFDVKALIDGLQDRKHHNSEVREQFLDVYIKVMRTRYSAETHHWLDDAALTLAEMFLKDANRSATASERLLNLKAYCLTVATVELDLFEGGYKTLKQVLSDDDDQDCQVHAIYALCMTVLYGGGGEEAALELMEFLVEIVQTDGESINAHDSVVVVSAALRGWAFVASHVEDYSDFADAAMDAFVDQLDSADVEIQSLAGHCIALIYESSREHERETGEPFQLPYDPQRLAGRLSELAKLSTKSVSRKNRRDLRENLVSVVTSLERGVGPYYSTALYIPEKDMHVPSSLRQDDGTAEYGYRCKLRLGNHSTRIDSWSLYSRVSMMKIIFRGGLQNHVFVNPVVMECLEDADWDESHASDYHDRRPRPSAKSRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.55
3 0.57
4 0.6
5 0.63
6 0.65
7 0.68
8 0.73
9 0.75
10 0.76
11 0.78
12 0.76
13 0.75
14 0.74
15 0.7
16 0.67
17 0.62
18 0.54
19 0.44
20 0.36
21 0.31
22 0.28
23 0.22
24 0.15
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.13
34 0.13
35 0.15
36 0.18
37 0.21
38 0.26
39 0.26
40 0.26
41 0.27
42 0.29
43 0.29
44 0.3
45 0.25
46 0.23
47 0.25
48 0.25
49 0.24
50 0.22
51 0.21
52 0.15
53 0.15
54 0.11
55 0.08
56 0.08
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.11
83 0.1
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.12
89 0.16
90 0.19
91 0.22
92 0.25
93 0.3
94 0.32
95 0.36
96 0.39
97 0.41
98 0.46
99 0.53
100 0.54
101 0.48
102 0.46
103 0.42
104 0.39
105 0.34
106 0.24
107 0.18
108 0.15
109 0.15
110 0.17
111 0.17
112 0.15
113 0.16
114 0.2
115 0.21
116 0.24
117 0.26
118 0.29
119 0.35
120 0.36
121 0.34
122 0.3
123 0.27
124 0.22
125 0.2
126 0.17
127 0.1
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.09
139 0.1
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.15
144 0.17
145 0.18
146 0.17
147 0.18
148 0.19
149 0.19
150 0.2
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.15
178 0.19
179 0.21
180 0.22
181 0.18
182 0.18
183 0.18
184 0.17
185 0.14
186 0.09
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.09
252 0.09
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.04
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.06
287 0.07
288 0.1
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.17
293 0.18
294 0.19
295 0.24
296 0.25
297 0.24
298 0.24
299 0.23
300 0.22
301 0.2
302 0.19
303 0.17
304 0.18
305 0.17
306 0.18
307 0.2
308 0.2
309 0.21
310 0.21
311 0.2
312 0.19
313 0.21
314 0.21
315 0.19
316 0.2
317 0.2
318 0.2
319 0.19
320 0.19
321 0.21
322 0.25
323 0.34
324 0.43
325 0.52
326 0.6
327 0.7
328 0.75
329 0.78
330 0.81
331 0.78
332 0.76
333 0.75
334 0.66
335 0.58
336 0.49
337 0.42
338 0.33
339 0.28
340 0.19
341 0.1
342 0.09
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.1
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.11
355 0.13
356 0.14
357 0.16
358 0.16
359 0.17
360 0.19
361 0.21
362 0.19
363 0.21
364 0.2
365 0.2
366 0.28
367 0.28
368 0.26
369 0.25
370 0.24
371 0.23
372 0.25
373 0.26
374 0.16
375 0.16
376 0.16
377 0.18
378 0.2
379 0.19
380 0.17
381 0.18
382 0.21
383 0.27
384 0.36
385 0.44
386 0.52
387 0.59
388 0.63
389 0.62
390 0.59
391 0.56
392 0.47
393 0.38
394 0.32
395 0.3
396 0.27
397 0.25
398 0.24
399 0.22
400 0.24
401 0.24
402 0.25
403 0.19
404 0.23
405 0.24
406 0.25
407 0.23
408 0.21
409 0.26
410 0.23
411 0.3
412 0.26
413 0.27
414 0.27
415 0.26
416 0.27
417 0.21
418 0.22
419 0.14
420 0.13
421 0.12
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.12
426 0.1
427 0.09
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.13
432 0.13
433 0.11
434 0.13
435 0.14
436 0.16
437 0.22
438 0.26
439 0.34
440 0.43
441 0.45
442 0.48
443 0.57
444 0.62
445 0.63
446 0.71