Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XW85

Protein Details
Accession A0A2C5XW85    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MPNTKSNKRRRRHGHSRGQSHPSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-15NKRRRRHGH
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007209  RNaseL-inhib-like_metal-bd_dom  
IPR022968  Tsr3-like  
IPR007177  Tsr3_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0106388  F:18S rRNA aminocarboxypropyltransferase activity  
GO:1904047  F:S-adenosyl-L-methionine binding  
GO:0000455  P:enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04034  Ribo_biogen_C  
PF04068  RLI  
Amino Acid Sequences MPNTKSNKRRRRHGHSRGQSHPSSATAHAEFKAACWDLGHCDPKRCSGKRLMRLGLMRQLSLGQHHNGVIITPNGKLLLSPADRQIMDQYGAAVVECSWARTHEVQWSKVGGGKMERLLPYLVAANTVNYGKPWRLNCAEALAAAFYICGHADWAAQVLEPFAYGSAFLQINAAILDRYAACTDAADIKKTESEWMARLQCEYTKSREYNDDDIWMSGNTNRMPMAMSDDDGDGDGNDNDDAQSHHSDTRDGIYLGKGPLGTRPTPSLPTLDHALPHYLASTDQDQEQDDDALMQDIRRRVLASKSFSSPTSDFGSTSANRTRPTTIPRPQQRHQYRADLDIQPDLDHELVSNHSSVSHNSASDNDEEFDRIIEATPVTDKIGLAKLEKERRQATVTSRTYSSNFVSAPGRC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.92
3 0.92
4 0.9
5 0.87
6 0.78
7 0.7
8 0.61
9 0.52
10 0.45
11 0.38
12 0.35
13 0.3
14 0.31
15 0.28
16 0.28
17 0.26
18 0.22
19 0.28
20 0.23
21 0.2
22 0.18
23 0.19
24 0.22
25 0.29
26 0.37
27 0.33
28 0.4
29 0.42
30 0.5
31 0.59
32 0.57
33 0.56
34 0.59
35 0.66
36 0.67
37 0.75
38 0.69
39 0.66
40 0.67
41 0.66
42 0.63
43 0.54
44 0.45
45 0.36
46 0.34
47 0.28
48 0.27
49 0.26
50 0.2
51 0.2
52 0.2
53 0.21
54 0.19
55 0.18
56 0.16
57 0.15
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.16
66 0.18
67 0.2
68 0.22
69 0.26
70 0.26
71 0.27
72 0.28
73 0.23
74 0.21
75 0.19
76 0.17
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.09
81 0.06
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.14
88 0.15
89 0.17
90 0.23
91 0.28
92 0.29
93 0.31
94 0.31
95 0.28
96 0.3
97 0.29
98 0.22
99 0.2
100 0.21
101 0.21
102 0.23
103 0.23
104 0.21
105 0.2
106 0.18
107 0.17
108 0.16
109 0.14
110 0.12
111 0.12
112 0.1
113 0.12
114 0.12
115 0.11
116 0.09
117 0.12
118 0.12
119 0.17
120 0.18
121 0.22
122 0.24
123 0.26
124 0.26
125 0.26
126 0.24
127 0.19
128 0.18
129 0.12
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.17
183 0.18
184 0.17
185 0.18
186 0.17
187 0.17
188 0.19
189 0.2
190 0.19
191 0.23
192 0.24
193 0.25
194 0.3
195 0.32
196 0.33
197 0.32
198 0.29
199 0.24
200 0.23
201 0.22
202 0.16
203 0.13
204 0.09
205 0.12
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.13
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.05
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.09
231 0.1
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.15
237 0.14
238 0.13
239 0.12
240 0.11
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.1
246 0.13
247 0.17
248 0.17
249 0.16
250 0.19
251 0.2
252 0.23
253 0.23
254 0.22
255 0.19
256 0.2
257 0.22
258 0.19
259 0.18
260 0.17
261 0.18
262 0.16
263 0.15
264 0.13
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.13
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.15
287 0.16
288 0.24
289 0.3
290 0.32
291 0.34
292 0.37
293 0.38
294 0.38
295 0.42
296 0.34
297 0.31
298 0.3
299 0.26
300 0.23
301 0.22
302 0.27
303 0.22
304 0.26
305 0.3
306 0.28
307 0.28
308 0.31
309 0.34
310 0.34
311 0.41
312 0.46
313 0.49
314 0.56
315 0.65
316 0.7
317 0.71
318 0.78
319 0.78
320 0.76
321 0.73
322 0.72
323 0.64
324 0.61
325 0.63
326 0.55
327 0.48
328 0.44
329 0.39
330 0.29
331 0.27
332 0.24
333 0.17
334 0.13
335 0.11
336 0.09
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.09
341 0.11
342 0.13
343 0.14
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.19
348 0.21
349 0.22
350 0.23
351 0.24
352 0.19
353 0.18
354 0.18
355 0.17
356 0.16
357 0.14
358 0.12
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.12
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.15
369 0.2
370 0.2
371 0.2
372 0.26
373 0.34
374 0.43
375 0.48
376 0.53
377 0.52
378 0.54
379 0.56
380 0.55
381 0.54
382 0.54
383 0.54
384 0.5
385 0.49
386 0.48
387 0.46
388 0.45
389 0.4
390 0.34
391 0.29
392 0.28