Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YBT0

Protein Details
Accession A0A2C5YBT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-151HQQQQQQRQQQQQQQQQQHRQKQVAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 6, mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR039779  RFX-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MEQEHLQLAAAVRGTTSAAATQPATRAQSRASTASVNSAMDHSGFSDGSAMYGGQWVPKDMASASQMDDMLLAAASQMHSSHEFGMESSGNNNSNPSMSAPMPHTTAHGPLSYNQPSQHSHIQHHHHQQQQQQRQQQQQQQQQQHRQKQVAGTRHPLPNEQHFTAANASFTDGDIHMMDRDEEGDAESVMGALNASRPTTSRSSANNELEMKQLFRANEHRDLQDVAQELHGNERGPNSERTRQVFAMLWINSVCARGRGSVPRGRVYANYASRCATERITVLNPASFGKLVRVLFPGLKTRRLGVRGESKYHYVNFSLAEDQPDPKDVQPVASQPQPEAKSASRGPSQTNGTARHVPLPPIQVVNKSDGSSEPPSLGSQLHSFYNLPELTNIENIRSTSAKTIRELAIPCDEDSEINKSDVLMLPPIEDYLPSGTDPDAAKSLSALYRSHCTSLLECIRYCRQKTFFHLYTSFQGTLTMPVQKLLAHEALAPWIEGCDYVLYQRMMLILSALTLQVLPKPVLDTMRNVSERLVPHIRESFQGQPQHVIAAKEAPAAVFAGLLDRAMRVNLTAHAAANMLSNPANRDVMYYDWISLIRTRKIAETVPTRAMDDLVDLLLSEVRDLIDPQSVPWEIECLSIYGDIASRSKPIGAGPERENPEANVLEKWVKFIRSLPQRFPYASPSDLVWGIERVGTAVMRELTLNHGKSFGSWWVTKTWLDEMSWFIFEQGGFMKPKVTRRVAVNTGADTAKEASSHNTGCDTSRSSASSAPEIKEASNSQSQPERAPFPPPPGNSQLQKGMAATSATPMTSTADPHDDSGIGMRTPDEEYTMHKFSFAGPDTMRMMNVAELGVAAGGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.12
7 0.13
8 0.15
9 0.17
10 0.21
11 0.25
12 0.25
13 0.26
14 0.27
15 0.32
16 0.34
17 0.34
18 0.32
19 0.31
20 0.29
21 0.33
22 0.33
23 0.27
24 0.23
25 0.21
26 0.2
27 0.17
28 0.17
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.11
35 0.1
36 0.11
37 0.1
38 0.07
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.14
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.14
48 0.17
49 0.16
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.17
55 0.17
56 0.13
57 0.11
58 0.09
59 0.07
60 0.04
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.15
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.19
80 0.16
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.16
86 0.19
87 0.21
88 0.22
89 0.23
90 0.22
91 0.23
92 0.2
93 0.23
94 0.22
95 0.21
96 0.2
97 0.2
98 0.28
99 0.31
100 0.32
101 0.31
102 0.33
103 0.34
104 0.39
105 0.45
106 0.4
107 0.42
108 0.48
109 0.53
110 0.58
111 0.65
112 0.67
113 0.66
114 0.67
115 0.68
116 0.71
117 0.74
118 0.73
119 0.72
120 0.72
121 0.75
122 0.79
123 0.79
124 0.79
125 0.78
126 0.79
127 0.8
128 0.82
129 0.83
130 0.85
131 0.85
132 0.83
133 0.77
134 0.71
135 0.69
136 0.67
137 0.65
138 0.61
139 0.58
140 0.57
141 0.57
142 0.55
143 0.52
144 0.49
145 0.5
146 0.51
147 0.46
148 0.42
149 0.37
150 0.38
151 0.37
152 0.32
153 0.23
154 0.16
155 0.16
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.14
186 0.18
187 0.2
188 0.23
189 0.27
190 0.34
191 0.42
192 0.44
193 0.44
194 0.43
195 0.41
196 0.4
197 0.36
198 0.29
199 0.23
200 0.24
201 0.19
202 0.2
203 0.27
204 0.3
205 0.37
206 0.39
207 0.37
208 0.36
209 0.38
210 0.34
211 0.3
212 0.25
213 0.18
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.16
218 0.18
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.17
223 0.19
224 0.26
225 0.29
226 0.34
227 0.39
228 0.42
229 0.46
230 0.43
231 0.42
232 0.37
233 0.33
234 0.33
235 0.28
236 0.24
237 0.19
238 0.19
239 0.17
240 0.17
241 0.15
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.15
246 0.2
247 0.26
248 0.3
249 0.33
250 0.35
251 0.35
252 0.35
253 0.33
254 0.32
255 0.34
256 0.36
257 0.35
258 0.33
259 0.32
260 0.32
261 0.33
262 0.3
263 0.22
264 0.17
265 0.16
266 0.18
267 0.19
268 0.2
269 0.19
270 0.17
271 0.17
272 0.16
273 0.16
274 0.13
275 0.11
276 0.1
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.15
281 0.16
282 0.17
283 0.19
284 0.26
285 0.24
286 0.28
287 0.27
288 0.28
289 0.31
290 0.32
291 0.32
292 0.29
293 0.37
294 0.37
295 0.41
296 0.4
297 0.38
298 0.37
299 0.37
300 0.32
301 0.23
302 0.2
303 0.17
304 0.16
305 0.16
306 0.14
307 0.16
308 0.15
309 0.16
310 0.15
311 0.16
312 0.16
313 0.14
314 0.17
315 0.15
316 0.16
317 0.16
318 0.19
319 0.2
320 0.21
321 0.21
322 0.17
323 0.24
324 0.24
325 0.23
326 0.24
327 0.21
328 0.24
329 0.25
330 0.29
331 0.26
332 0.26
333 0.27
334 0.28
335 0.3
336 0.29
337 0.32
338 0.31
339 0.31
340 0.34
341 0.32
342 0.32
343 0.3
344 0.28
345 0.27
346 0.26
347 0.23
348 0.22
349 0.22
350 0.21
351 0.21
352 0.23
353 0.21
354 0.19
355 0.18
356 0.16
357 0.2
358 0.19
359 0.18
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.1
366 0.09
367 0.11
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.15
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.15
379 0.15
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.13
384 0.12
385 0.12
386 0.14
387 0.18
388 0.19
389 0.19
390 0.22
391 0.21
392 0.25
393 0.24
394 0.21
395 0.21
396 0.21
397 0.2
398 0.18
399 0.17
400 0.13
401 0.14
402 0.16
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.1
407 0.11
408 0.12
409 0.11
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.07
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.1
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.1
435 0.13
436 0.14
437 0.15
438 0.15
439 0.14
440 0.13
441 0.19
442 0.22
443 0.21
444 0.2
445 0.23
446 0.28
447 0.32
448 0.33
449 0.33
450 0.34
451 0.35
452 0.42
453 0.48
454 0.45
455 0.44
456 0.44
457 0.41
458 0.39
459 0.38
460 0.32
461 0.22
462 0.2
463 0.16
464 0.16
465 0.15
466 0.15
467 0.11
468 0.11
469 0.12
470 0.11
471 0.12
472 0.12
473 0.11
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.09
479 0.08
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.05
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.09
509 0.12
510 0.13
511 0.15
512 0.16
513 0.22
514 0.23
515 0.22
516 0.22
517 0.23
518 0.23
519 0.27
520 0.29
521 0.23
522 0.25
523 0.28
524 0.28
525 0.25
526 0.28
527 0.27
528 0.28
529 0.32
530 0.29
531 0.28
532 0.27
533 0.28
534 0.26
535 0.21
536 0.16
537 0.15
538 0.14
539 0.13
540 0.13
541 0.1
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.05
546 0.04
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.04
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.06
557 0.07
558 0.1
559 0.1
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.09
566 0.07
567 0.08
568 0.08
569 0.09
570 0.11
571 0.12
572 0.11
573 0.12
574 0.12
575 0.13
576 0.15
577 0.14
578 0.13
579 0.13
580 0.13
581 0.13
582 0.15
583 0.18
584 0.18
585 0.19
586 0.2
587 0.21
588 0.23
589 0.25
590 0.28
591 0.29
592 0.31
593 0.34
594 0.33
595 0.32
596 0.3
597 0.27
598 0.21
599 0.15
600 0.11
601 0.07
602 0.06
603 0.05
604 0.05
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.06
611 0.07
612 0.08
613 0.1
614 0.1
615 0.1
616 0.14
617 0.14
618 0.14
619 0.13
620 0.14
621 0.11
622 0.12
623 0.12
624 0.09
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.08
629 0.08
630 0.08
631 0.09
632 0.09
633 0.1
634 0.1
635 0.11
636 0.11
637 0.11
638 0.19
639 0.22
640 0.26
641 0.29
642 0.37
643 0.41
644 0.42
645 0.41
646 0.33
647 0.33
648 0.29
649 0.26
650 0.19
651 0.17
652 0.21
653 0.2
654 0.23
655 0.22
656 0.22
657 0.21
658 0.24
659 0.31
660 0.37
661 0.43
662 0.46
663 0.49
664 0.51
665 0.52
666 0.51
667 0.48
668 0.42
669 0.37
670 0.31
671 0.26
672 0.25
673 0.24
674 0.22
675 0.17
676 0.13
677 0.12
678 0.12
679 0.11
680 0.09
681 0.09
682 0.08
683 0.07
684 0.1
685 0.1
686 0.09
687 0.1
688 0.1
689 0.15
690 0.22
691 0.23
692 0.21
693 0.22
694 0.21
695 0.22
696 0.24
697 0.22
698 0.2
699 0.2
700 0.22
701 0.23
702 0.26
703 0.26
704 0.26
705 0.25
706 0.22
707 0.21
708 0.21
709 0.22
710 0.22
711 0.22
712 0.19
713 0.16
714 0.15
715 0.14
716 0.14
717 0.12
718 0.14
719 0.14
720 0.15
721 0.2
722 0.22
723 0.3
724 0.38
725 0.41
726 0.42
727 0.46
728 0.54
729 0.54
730 0.57
731 0.52
732 0.45
733 0.44
734 0.39
735 0.33
736 0.26
737 0.23
738 0.17
739 0.14
740 0.14
741 0.15
742 0.2
743 0.21
744 0.2
745 0.21
746 0.21
747 0.22
748 0.25
749 0.25
750 0.23
751 0.25
752 0.26
753 0.25
754 0.28
755 0.29
756 0.33
757 0.33
758 0.32
759 0.32
760 0.31
761 0.3
762 0.31
763 0.3
764 0.28
765 0.31
766 0.3
767 0.31
768 0.36
769 0.38
770 0.38
771 0.42
772 0.42
773 0.35
774 0.42
775 0.42
776 0.43
777 0.5
778 0.47
779 0.49
780 0.5
781 0.55
782 0.52
783 0.53
784 0.51
785 0.45
786 0.44
787 0.37
788 0.32
789 0.27
790 0.24
791 0.2
792 0.16
793 0.15
794 0.13
795 0.13
796 0.12
797 0.14
798 0.14
799 0.16
800 0.16
801 0.2
802 0.21
803 0.22
804 0.23
805 0.2
806 0.19
807 0.21
808 0.2
809 0.16
810 0.15
811 0.14
812 0.14
813 0.17
814 0.17
815 0.15
816 0.13
817 0.19
818 0.26
819 0.29
820 0.27
821 0.25
822 0.25
823 0.25
824 0.34
825 0.31
826 0.3
827 0.26
828 0.31
829 0.34
830 0.35
831 0.32
832 0.23
833 0.22
834 0.17
835 0.17
836 0.13
837 0.09
838 0.08
839 0.08