Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P2Z5

Protein Details
Accession J3P2Z5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-329KPEKAAKAGGPPKPKRRKSKGGTTTPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-323KPEKAAKAGGPPKPKRRKSKG
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR016612  Mediator_Med6_fun  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MDNKTEQLLDEIQWSSPQSVVNFQGIHSNSVLYYLAESPFFDRTSNNAVVFNQAVRNQSMLHIVATREAFEGRLREMAGLEYMVAQEPAETGPGAGTGVWVIRKQTRRKVKAADGTPLPDELEVHADYFVMGENIYMAPSLSDVLSSRIATISSAISKLFPAVSAIQTWTPALGHGYATPAAAAAAPRPRGLESKEPTPMPDSLTPAAGAGAASKAPPPSARTERSAPDARMAEEAFAIHTRYGGEYMDENPITGKPGEFHLSSTGRKDKLTVPVLGGPGGAAVSLPVLKTLPDSSPLSKDIKPEKAAKAGGPPKPKRRKSKGGTTTPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.18
3 0.18
4 0.2
5 0.17
6 0.21
7 0.23
8 0.26
9 0.24
10 0.23
11 0.3
12 0.28
13 0.29
14 0.24
15 0.22
16 0.17
17 0.19
18 0.19
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.14
26 0.16
27 0.17
28 0.15
29 0.14
30 0.18
31 0.24
32 0.28
33 0.26
34 0.25
35 0.25
36 0.27
37 0.28
38 0.25
39 0.22
40 0.21
41 0.22
42 0.21
43 0.22
44 0.19
45 0.19
46 0.2
47 0.17
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.16
59 0.13
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.12
66 0.1
67 0.09
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.09
89 0.16
90 0.24
91 0.31
92 0.41
93 0.5
94 0.55
95 0.62
96 0.67
97 0.69
98 0.7
99 0.66
100 0.62
101 0.53
102 0.49
103 0.43
104 0.36
105 0.28
106 0.19
107 0.16
108 0.11
109 0.12
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.19
179 0.26
180 0.25
181 0.29
182 0.33
183 0.32
184 0.32
185 0.32
186 0.29
187 0.24
188 0.23
189 0.22
190 0.18
191 0.19
192 0.18
193 0.15
194 0.14
195 0.1
196 0.08
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.09
205 0.11
206 0.18
207 0.25
208 0.28
209 0.31
210 0.35
211 0.37
212 0.43
213 0.45
214 0.38
215 0.37
216 0.35
217 0.32
218 0.3
219 0.28
220 0.21
221 0.16
222 0.15
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.16
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.15
242 0.14
243 0.09
244 0.13
245 0.17
246 0.16
247 0.17
248 0.21
249 0.25
250 0.26
251 0.32
252 0.35
253 0.33
254 0.33
255 0.35
256 0.33
257 0.39
258 0.41
259 0.36
260 0.33
261 0.35
262 0.36
263 0.33
264 0.28
265 0.18
266 0.14
267 0.12
268 0.08
269 0.04
270 0.03
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.09
278 0.11
279 0.12
280 0.16
281 0.2
282 0.23
283 0.27
284 0.3
285 0.32
286 0.32
287 0.39
288 0.42
289 0.46
290 0.48
291 0.52
292 0.54
293 0.56
294 0.57
295 0.51
296 0.53
297 0.54
298 0.56
299 0.59
300 0.64
301 0.68
302 0.76
303 0.84
304 0.85
305 0.86
306 0.9
307 0.88
308 0.9
309 0.9