Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XPT5

Protein Details
Accession A0A2C5XPT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
275-302DIDAVQRQMPRRTRRRRQRPDDSWEEYIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-291RTRRRR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF13428  TPR_14  
Amino Acid Sequences MPGSTTPPWPRLPTTPPASATSTSAPWPSCRPRTTSATGAATFGSGSLYAACLRLVPHRKFTFAKLWLMAAQLEVRQGDVAAARKLLGRAIGMCPKDKLFTAYLDLERKLFDFDRCRKLHQKHVEFNAANCQAWIRFAQLEQALDDVDRARAIFELAVAQPQLDMPELLWKAYIDFEDDEGQHQRTRALYERLLDKTHHVKVWISYAHFEINFAEPQQHPDDQDELPVSDDAKARARAIFQRAHDGFRARDAPDERAQLLSAWLAFEKTHGSPTDIDAVQRQMPRRTRRRRQRPDDSWEEYIDYVFPADHDDQARGLANLLAKAQQWKQTGGGLSAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.53
3 0.51
4 0.51
5 0.5
6 0.45
7 0.42
8 0.37
9 0.32
10 0.29
11 0.3
12 0.27
13 0.26
14 0.33
15 0.39
16 0.44
17 0.45
18 0.49
19 0.51
20 0.58
21 0.61
22 0.58
23 0.55
24 0.52
25 0.49
26 0.44
27 0.37
28 0.3
29 0.23
30 0.18
31 0.12
32 0.06
33 0.06
34 0.05
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.07
39 0.08
40 0.09
41 0.18
42 0.27
43 0.3
44 0.39
45 0.4
46 0.46
47 0.47
48 0.51
49 0.51
50 0.46
51 0.47
52 0.38
53 0.38
54 0.34
55 0.33
56 0.28
57 0.19
58 0.16
59 0.12
60 0.13
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.1
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.12
75 0.1
76 0.11
77 0.15
78 0.21
79 0.21
80 0.22
81 0.23
82 0.23
83 0.23
84 0.22
85 0.21
86 0.16
87 0.17
88 0.19
89 0.21
90 0.24
91 0.26
92 0.26
93 0.23
94 0.22
95 0.2
96 0.2
97 0.17
98 0.19
99 0.25
100 0.32
101 0.41
102 0.42
103 0.48
104 0.54
105 0.58
106 0.63
107 0.64
108 0.66
109 0.64
110 0.67
111 0.7
112 0.61
113 0.57
114 0.55
115 0.46
116 0.37
117 0.29
118 0.25
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.1
131 0.09
132 0.1
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.15
174 0.18
175 0.2
176 0.2
177 0.22
178 0.26
179 0.27
180 0.28
181 0.26
182 0.25
183 0.27
184 0.29
185 0.27
186 0.23
187 0.22
188 0.22
189 0.27
190 0.25
191 0.2
192 0.18
193 0.18
194 0.19
195 0.18
196 0.17
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.13
202 0.11
203 0.15
204 0.18
205 0.18
206 0.17
207 0.18
208 0.21
209 0.18
210 0.2
211 0.17
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.17
220 0.18
221 0.18
222 0.19
223 0.22
224 0.24
225 0.29
226 0.32
227 0.29
228 0.37
229 0.38
230 0.39
231 0.39
232 0.36
233 0.32
234 0.31
235 0.33
236 0.24
237 0.29
238 0.29
239 0.32
240 0.33
241 0.35
242 0.31
243 0.29
244 0.28
245 0.22
246 0.2
247 0.16
248 0.11
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.11
255 0.11
256 0.15
257 0.15
258 0.17
259 0.17
260 0.2
261 0.26
262 0.23
263 0.23
264 0.22
265 0.24
266 0.27
267 0.3
268 0.32
269 0.34
270 0.42
271 0.52
272 0.61
273 0.69
274 0.75
275 0.83
276 0.89
277 0.92
278 0.94
279 0.95
280 0.93
281 0.92
282 0.9
283 0.85
284 0.77
285 0.67
286 0.59
287 0.47
288 0.38
289 0.29
290 0.2
291 0.13
292 0.1
293 0.08
294 0.12
295 0.13
296 0.16
297 0.17
298 0.18
299 0.18
300 0.21
301 0.22
302 0.17
303 0.16
304 0.14
305 0.15
306 0.15
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.22
311 0.26
312 0.31
313 0.32
314 0.33
315 0.34
316 0.37
317 0.37