FuNGI

A0A2C5X876

Protein Details

Accession

A0A2C5X876

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-39	SNGVARPPKPNPLRPMRRKPRPANPLVAPSR	Hydrophilic
178-204	APVAKDNAPKRPKKQKEEKTVFNRAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-39	ARPPKPNPLRPMRRKPRPANPLVAPSR
184-196	NAPKRPKKQKEEK
495-503	KKPKSLKRA
519-521	KKM
668-673	RLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 10.5, cyto_mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPRASNGVARPPKPNPLRPMRRKPRPANPLVAPSRKPAPTTGQKQTSVSSRPQGPSLEELRKQYGGWSEPPPQYQYSDIPIMTTKKALVEGIRYHMMKFTQPKVNDKPVDPTDQDAFARPVTLHRRDARQPPPGRMVKETQPEPPQVDDKDAERLAQIKAEREAQRAIDQAKIAPVAKDNAPKRPKKQKEEKTVFNRAPKSDMAKKEADIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSEANVAFVIDKSVFRMIPLEKWYKFTSKPPFQPLTLDQAEAFMNRKMDVGRWVMKDEERKAGQSEMEATRRMLYGRGQMIKTESDTFKAASRLEKLDHDELDISGDEFQDDDEAPHFERNDDEDVKETKERIRREQLGANLFGEGDEQVVDKELQEQLKEELERQKYGKATKKALIKRDREDIYESDQSEENPWISSSDDDSSDDEEGEGGEEEKKDSETKESVNDSKDKLKSAGPKGNTTPLAKQKPQTDADKKPKSLKRAGSPALSDSSGNESSRKKMRKTVAPASGSRGATPLPQGNSQRRPKVAGVGAGSDGEVTAGEMSDGAAPRAKAKIATGKAASSKGTPSASRAGSPNAASIGRAPSPSQVNGGIEPWEILEKIPMDGIAIGDLIKPFQGRVGDRPGQMPKAEWIKLVKQLCDYGSDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.59
3	0.67
4	0.67
5	0.67
6	0.66
7	0.69
8	0.77
9	0.81
10	0.88
11	0.89
12	0.91
13	0.94
14	0.94
15	0.93
16	0.93
17	0.89
18	0.87
19	0.82
20	0.81
21	0.79
22	0.76
23	0.68
24	0.62
25	0.62
26	0.56
27	0.51
28	0.45
29	0.46
30	0.49
31	0.56
32	0.61
33	0.6
34	0.61
35	0.61
36	0.61
37	0.58
38	0.53
39	0.5
40	0.47
41	0.47
42	0.46
43	0.48
44	0.46
45	0.42
46	0.43
47	0.45
48	0.46
49	0.43
50	0.45
51	0.46
52	0.45
53	0.41
54	0.39
55	0.38
56	0.33
57	0.34
58	0.35
59	0.39
60	0.42
61	0.45
62	0.45
63	0.4
64	0.38
65	0.37
66	0.34
67	0.31
68	0.31
69	0.28
70	0.26
71	0.28
72	0.29
73	0.27
74	0.26
75	0.21
76	0.19
77	0.2
78	0.21
79	0.19
80	0.22
81	0.24
82	0.28
83	0.33
84	0.32
85	0.31
86	0.32
87	0.31
88	0.31
89	0.34
90	0.36
91	0.39
92	0.42
93	0.5
94	0.55
95	0.63
96	0.61
97	0.57
98	0.58
99	0.53
100	0.57
101	0.49
102	0.45
103	0.38
104	0.36
105	0.35
106	0.29
107	0.27
108	0.21
109	0.21
110	0.17
111	0.22
112	0.28
113	0.32
114	0.37
115	0.4
116	0.47
117	0.53
118	0.62
119	0.63
120	0.65
121	0.64
122	0.63
123	0.68
124	0.67
125	0.63
126	0.58
127	0.55
128	0.53
129	0.56
130	0.52
131	0.49
132	0.48
133	0.48
134	0.46
135	0.44
136	0.42
137	0.35
138	0.36
139	0.31
140	0.27
141	0.31
142	0.28
143	0.25
144	0.21
145	0.22
146	0.19
147	0.21
148	0.21
149	0.17
150	0.2
151	0.27
152	0.29
153	0.29
154	0.31
155	0.29
156	0.3
157	0.31
158	0.3
159	0.25
160	0.23
161	0.21
162	0.2
163	0.2
164	0.18
165	0.15
166	0.16
167	0.16
168	0.19
169	0.27
170	0.28
171	0.35
172	0.44
173	0.5
174	0.57
175	0.66
176	0.72
177	0.74
178	0.83
179	0.83
180	0.86
181	0.87
182	0.88
183	0.86
184	0.86
185	0.8
186	0.77
187	0.71
188	0.61
189	0.56
190	0.49
191	0.47
192	0.46
193	0.45
194	0.42
195	0.39
196	0.39
197	0.45
198	0.45
199	0.4
200	0.34
201	0.32
202	0.29
203	0.28
204	0.28
205	0.19
206	0.19
207	0.17
208	0.14
209	0.12
210	0.1
211	0.09
212	0.11
213	0.12
214	0.14
215	0.13
216	0.13
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.11
221	0.09
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.07
237	0.05
238	0.06
239	0.07
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.13
244	0.12
245	0.16
246	0.21
247	0.26
248	0.25
249	0.29
250	0.31
251	0.31
252	0.33
253	0.37
254	0.42
255	0.44
256	0.49
257	0.53
258	0.53
259	0.5
260	0.52
261	0.45
262	0.43
263	0.35
264	0.3
265	0.22
266	0.2
267	0.2
268	0.17
269	0.16
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.14
277	0.17
278	0.2
279	0.21
280	0.22
281	0.23
282	0.25
283	0.3
284	0.28
285	0.3
286	0.26
287	0.26
288	0.26
289	0.25
290	0.23
291	0.18
292	0.2
293	0.17
294	0.18
295	0.17
296	0.16
297	0.16
298	0.16
299	0.16
300	0.13
301	0.11
302	0.15
303	0.18
304	0.22
305	0.21
306	0.21
307	0.23
308	0.22
309	0.22
310	0.2
311	0.16
312	0.14
313	0.15
314	0.15
315	0.15
316	0.16
317	0.15
318	0.14
319	0.16
320	0.16
321	0.17
322	0.18
323	0.2
324	0.21
325	0.2
326	0.18
327	0.16
328	0.14
329	0.14
330	0.12
331	0.08
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.07
343	0.09
344	0.09
345	0.08
346	0.09
347	0.11
348	0.15
349	0.15
350	0.14
351	0.16
352	0.17
353	0.2
354	0.2
355	0.19
356	0.19
357	0.25
358	0.28
359	0.31
360	0.38
361	0.41
362	0.43
363	0.47
364	0.47
365	0.44
366	0.42
367	0.35
368	0.27
369	0.22
370	0.18
371	0.14
372	0.08
373	0.05
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.07
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.11
386	0.15
387	0.15
388	0.16
389	0.21
390	0.23
391	0.26
392	0.25
393	0.28
394	0.28
395	0.35
396	0.41
397	0.4
398	0.42
399	0.45
400	0.53
401	0.55
402	0.61
403	0.63
404	0.61
405	0.59
406	0.62
407	0.59
408	0.52
409	0.5
410	0.42
411	0.39
412	0.37
413	0.33
414	0.27
415	0.26
416	0.24
417	0.22
418	0.21
419	0.15
420	0.11
421	0.11
422	0.09
423	0.1
424	0.1
425	0.1
426	0.11
427	0.11
428	0.12
429	0.13
430	0.14
431	0.13
432	0.13
433	0.1
434	0.09
435	0.08
436	0.07
437	0.06
438	0.05
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.09
444	0.1
445	0.11
446	0.15
447	0.16
448	0.17
449	0.21
450	0.25
451	0.28
452	0.3
453	0.33
454	0.31
455	0.36
456	0.36
457	0.34
458	0.31
459	0.33
460	0.38
461	0.43
462	0.47
463	0.42
464	0.45
465	0.46
466	0.51
467	0.5
468	0.44
469	0.43
470	0.45
471	0.5
472	0.49
473	0.51
474	0.5
475	0.53
476	0.55
477	0.57
478	0.56
479	0.58
480	0.66
481	0.7
482	0.68
483	0.71
484	0.72
485	0.7
486	0.7
487	0.67
488	0.65
489	0.66
490	0.66
491	0.6
492	0.57
493	0.51
494	0.45
495	0.38
496	0.29
497	0.21
498	0.23
499	0.22
500	0.21
501	0.22
502	0.22
503	0.27
504	0.36
505	0.42
506	0.39
507	0.45
508	0.53
509	0.59
510	0.66
511	0.69
512	0.69
513	0.67
514	0.65
515	0.63
516	0.62
517	0.52
518	0.43
519	0.35
520	0.26
521	0.23
522	0.26
523	0.24
524	0.2
525	0.26
526	0.33
527	0.41
528	0.5
529	0.57
530	0.6
531	0.57
532	0.59
533	0.55
534	0.56
535	0.5
536	0.45
537	0.38
538	0.33
539	0.32
540	0.27
541	0.25
542	0.17
543	0.13
544	0.08
545	0.06
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.05
552	0.07
553	0.08
554	0.08
555	0.11
556	0.11
557	0.14
558	0.16
559	0.16
560	0.14
561	0.18
562	0.27
563	0.27
564	0.34
565	0.33
566	0.35
567	0.37
568	0.38
569	0.35
570	0.28
571	0.27
572	0.25
573	0.27
574	0.24
575	0.25
576	0.3
577	0.3
578	0.3
579	0.31
580	0.3
581	0.31
582	0.31
583	0.29
584	0.24
585	0.23
586	0.21
587	0.21
588	0.21
589	0.2
590	0.2
591	0.19
592	0.22
593	0.26
594	0.27
595	0.27
596	0.25
597	0.25
598	0.25
599	0.25
600	0.22
601	0.18
602	0.17
603	0.15
604	0.14
605	0.12
606	0.11
607	0.13
608	0.12
609	0.13
610	0.13
611	0.12
612	0.11
613	0.11
614	0.11
615	0.08
616	0.07
617	0.07
618	0.08
619	0.09
620	0.08
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.13
625	0.18
626	0.2
627	0.26
628	0.35
629	0.4
630	0.41
631	0.47
632	0.5
633	0.48
634	0.46
635	0.42
636	0.4
637	0.42
638	0.42
639	0.39
640	0.39
641	0.4
642	0.47
643	0.49
644	0.45
645	0.4
646	0.43
647	0.4
648	0.41
649	0.39
650	0.38
651	0.43
652	0.48
653	0.51

A0A2C5X876

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer