Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5Y8M4

Protein Details
Accession A0A2C5Y8M4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-34ETFHPETSRSRSRPRERKRRASSATDGQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-25SRSRPRERKRR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MAAEDETFHPETSRSRSRPRERKRRASSATDGQDGYAKRRHMDYRSSHGPTRLSESPEGPLTTYKTPKERKASVTQEDKKRGQRLFGGLLSTLSQTNSSSQQRRRQEIERRQLDKLQQQTAQDEKKLAERRAAAERTRLCEQITWEERVMRNRHAKELKLAQFLQTSSRPQIYFLPWRLSRSQEDEIDNQIRDTKARIARELENFKSHKEDHVTRYGPASKSEALSTEKRHDLAQEAEPVAEAEPELESKHEATQTHKTDSGLEHDAEAQSLADVPQSPKSCSTNTATIAGEIEGQPMTHPLNNDDLQDDLGDILVEAEEDMVIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.48
3 0.59
4 0.69
5 0.79
6 0.85
7 0.88
8 0.89
9 0.94
10 0.93
11 0.93
12 0.89
13 0.87
14 0.84
15 0.82
16 0.76
17 0.69
18 0.59
19 0.49
20 0.47
21 0.39
22 0.36
23 0.32
24 0.28
25 0.26
26 0.32
27 0.38
28 0.39
29 0.47
30 0.49
31 0.52
32 0.59
33 0.63
34 0.6
35 0.58
36 0.55
37 0.48
38 0.48
39 0.44
40 0.39
41 0.37
42 0.35
43 0.34
44 0.34
45 0.33
46 0.26
47 0.24
48 0.24
49 0.27
50 0.31
51 0.32
52 0.39
53 0.45
54 0.53
55 0.58
56 0.6
57 0.61
58 0.65
59 0.69
60 0.68
61 0.72
62 0.73
63 0.73
64 0.75
65 0.75
66 0.73
67 0.72
68 0.65
69 0.58
70 0.54
71 0.5
72 0.47
73 0.42
74 0.36
75 0.28
76 0.27
77 0.24
78 0.2
79 0.15
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.11
84 0.17
85 0.23
86 0.3
87 0.37
88 0.45
89 0.52
90 0.57
91 0.61
92 0.63
93 0.67
94 0.7
95 0.73
96 0.74
97 0.71
98 0.67
99 0.66
100 0.63
101 0.58
102 0.54
103 0.47
104 0.41
105 0.38
106 0.39
107 0.41
108 0.38
109 0.32
110 0.28
111 0.24
112 0.29
113 0.34
114 0.32
115 0.29
116 0.29
117 0.31
118 0.37
119 0.41
120 0.34
121 0.35
122 0.36
123 0.37
124 0.37
125 0.35
126 0.27
127 0.25
128 0.26
129 0.28
130 0.29
131 0.26
132 0.25
133 0.27
134 0.29
135 0.33
136 0.34
137 0.32
138 0.37
139 0.36
140 0.43
141 0.43
142 0.42
143 0.41
144 0.47
145 0.45
146 0.41
147 0.4
148 0.33
149 0.31
150 0.3
151 0.28
152 0.22
153 0.19
154 0.16
155 0.19
156 0.18
157 0.17
158 0.2
159 0.21
160 0.25
161 0.26
162 0.31
163 0.29
164 0.32
165 0.33
166 0.33
167 0.31
168 0.31
169 0.32
170 0.29
171 0.3
172 0.29
173 0.32
174 0.31
175 0.29
176 0.23
177 0.22
178 0.18
179 0.16
180 0.17
181 0.19
182 0.21
183 0.23
184 0.25
185 0.27
186 0.31
187 0.39
188 0.43
189 0.38
190 0.4
191 0.39
192 0.38
193 0.39
194 0.34
195 0.31
196 0.31
197 0.34
198 0.32
199 0.4
200 0.41
201 0.37
202 0.41
203 0.42
204 0.36
205 0.33
206 0.32
207 0.24
208 0.24
209 0.24
210 0.22
211 0.21
212 0.24
213 0.26
214 0.28
215 0.29
216 0.28
217 0.28
218 0.27
219 0.26
220 0.26
221 0.25
222 0.24
223 0.23
224 0.22
225 0.21
226 0.21
227 0.17
228 0.13
229 0.1
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.11
238 0.14
239 0.15
240 0.2
241 0.29
242 0.33
243 0.36
244 0.36
245 0.34
246 0.34
247 0.35
248 0.35
249 0.29
250 0.25
251 0.21
252 0.21
253 0.21
254 0.18
255 0.17
256 0.11
257 0.07
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.09
262 0.11
263 0.18
264 0.2
265 0.22
266 0.26
267 0.3
268 0.3
269 0.32
270 0.36
271 0.35
272 0.35
273 0.37
274 0.33
275 0.3
276 0.29
277 0.25
278 0.21
279 0.15
280 0.14
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.14
287 0.15
288 0.15
289 0.22
290 0.24
291 0.25
292 0.24
293 0.22
294 0.2
295 0.19
296 0.17
297 0.1
298 0.09
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04