Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5Y5A1

Protein Details
Accession A0A2C5Y5A1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-161LEPYLADRRKLRRRRRDNKAELAFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-153RRKLRRRRRD
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 13, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKPDVIYADARRFLDERGSSADLAPNGLNPATIMEKAVRDRIVESYFYKEQCFALNEADIIDRVVDHVSFIGGTHGAAQKPSPFLCLAFKLLQLAPSDAILQQYLEYGGQHYKYLRALACFYIRLTRPAVDVYRTLEPYLADRRKLRRRRRDNKAELAFVDEFVDDLLNKERVCATSLWKMPKREALEDAEVLEPRVSPLGDLDEQLSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.31
4 0.28
5 0.29
6 0.31
7 0.29
8 0.29
9 0.31
10 0.22
11 0.23
12 0.2
13 0.15
14 0.14
15 0.14
16 0.12
17 0.09
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.15
24 0.18
25 0.22
26 0.2
27 0.19
28 0.2
29 0.23
30 0.24
31 0.24
32 0.23
33 0.26
34 0.29
35 0.29
36 0.28
37 0.25
38 0.23
39 0.24
40 0.24
41 0.19
42 0.17
43 0.16
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.11
48 0.09
49 0.07
50 0.05
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.04
61 0.04
62 0.07
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.13
69 0.14
70 0.13
71 0.11
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.11
84 0.1
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.05
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.1
102 0.13
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.15
109 0.15
110 0.17
111 0.17
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.16
116 0.18
117 0.19
118 0.16
119 0.16
120 0.18
121 0.2
122 0.2
123 0.19
124 0.17
125 0.16
126 0.18
127 0.27
128 0.26
129 0.27
130 0.32
131 0.41
132 0.51
133 0.61
134 0.68
135 0.7
136 0.78
137 0.85
138 0.9
139 0.92
140 0.91
141 0.91
142 0.86
143 0.78
144 0.67
145 0.62
146 0.51
147 0.4
148 0.32
149 0.21
150 0.15
151 0.12
152 0.12
153 0.06
154 0.07
155 0.11
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.16
160 0.16
161 0.19
162 0.18
163 0.2
164 0.26
165 0.32
166 0.41
167 0.45
168 0.47
169 0.49
170 0.56
171 0.56
172 0.51
173 0.5
174 0.46
175 0.45
176 0.42
177 0.4
178 0.35
179 0.29
180 0.26
181 0.22
182 0.16
183 0.13
184 0.14
185 0.12
186 0.1
187 0.11
188 0.16
189 0.16
190 0.17