Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YHQ7

Protein Details
Accession A0A2C5YHQ7    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-103PSSPDKWYRVWQKYKREHDAAHydrophilic
326-347ANKFGRRPSKPQIDFKPHNRPSHydrophilic
383-410SPTPLVSAPKRKRKAVDHFIRPKKNRTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-410PKRKRKAVDHFIRPKKNRTG
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPLKSLFELATSACLQHIKEINSIGDFLPYPTMRHILTKIESANQLHQIELNSPQIQGETGEIWTKIIENDFPLEYRANTYLPSSPDKWYRVWQKYKREHDAALKQSEEQLKSALLGLQEDKEKNVSKIVERKHLPPAGRTKRFPSRDAGTSRLTFASGSRTKTHNGSSVMKRVRREVQEIATIHGALSRAVRAPIRSAAAKPPASAASATAMAYHGRRDGPSRATVLNSDDEDNIGYGDTKSVASDAAKKRIVNSAKVSLLKKKPEAVGGITSASKTLPARTHAQNGNTVAVRCQDQAQDRGKAQGMDKYVATTKMTGRGAATLANKFGRRPSKPQIDFKPHNRPSALDAQDDEDLGMVSVPSSTTPLGEQMTCIDTLAAMSPTPLVSAPKRKRKAVDHFIRPKKNRTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.22
4 0.27
5 0.26
6 0.28
7 0.31
8 0.31
9 0.3
10 0.32
11 0.24
12 0.21
13 0.19
14 0.17
15 0.2
16 0.19
17 0.2
18 0.21
19 0.24
20 0.22
21 0.26
22 0.27
23 0.27
24 0.29
25 0.32
26 0.32
27 0.33
28 0.37
29 0.36
30 0.38
31 0.39
32 0.37
33 0.32
34 0.32
35 0.29
36 0.26
37 0.27
38 0.28
39 0.21
40 0.21
41 0.21
42 0.19
43 0.18
44 0.16
45 0.14
46 0.1
47 0.1
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.18
64 0.18
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.2
69 0.22
70 0.27
71 0.26
72 0.29
73 0.35
74 0.37
75 0.38
76 0.42
77 0.5
78 0.54
79 0.62
80 0.66
81 0.7
82 0.78
83 0.84
84 0.84
85 0.78
86 0.73
87 0.72
88 0.72
89 0.68
90 0.62
91 0.53
92 0.45
93 0.46
94 0.47
95 0.38
96 0.3
97 0.24
98 0.19
99 0.19
100 0.19
101 0.16
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.16
107 0.16
108 0.16
109 0.19
110 0.21
111 0.2
112 0.23
113 0.23
114 0.25
115 0.32
116 0.36
117 0.4
118 0.41
119 0.44
120 0.48
121 0.5
122 0.46
123 0.45
124 0.51
125 0.53
126 0.57
127 0.56
128 0.55
129 0.61
130 0.63
131 0.59
132 0.54
133 0.49
134 0.49
135 0.5
136 0.47
137 0.42
138 0.38
139 0.37
140 0.31
141 0.26
142 0.19
143 0.16
144 0.21
145 0.2
146 0.22
147 0.24
148 0.26
149 0.27
150 0.3
151 0.32
152 0.28
153 0.29
154 0.33
155 0.34
156 0.41
157 0.45
158 0.46
159 0.45
160 0.44
161 0.47
162 0.43
163 0.44
164 0.39
165 0.35
166 0.38
167 0.37
168 0.34
169 0.28
170 0.24
171 0.19
172 0.17
173 0.14
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.18
187 0.23
188 0.23
189 0.21
190 0.21
191 0.19
192 0.19
193 0.18
194 0.13
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.12
207 0.15
208 0.17
209 0.19
210 0.21
211 0.2
212 0.2
213 0.21
214 0.2
215 0.18
216 0.16
217 0.15
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.15
234 0.19
235 0.25
236 0.27
237 0.27
238 0.29
239 0.36
240 0.38
241 0.35
242 0.35
243 0.34
244 0.35
245 0.4
246 0.4
247 0.41
248 0.44
249 0.45
250 0.42
251 0.41
252 0.39
253 0.38
254 0.38
255 0.31
256 0.28
257 0.23
258 0.22
259 0.18
260 0.17
261 0.14
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.13
266 0.14
267 0.17
268 0.23
269 0.26
270 0.34
271 0.36
272 0.38
273 0.39
274 0.37
275 0.37
276 0.34
277 0.31
278 0.24
279 0.21
280 0.21
281 0.17
282 0.17
283 0.18
284 0.2
285 0.28
286 0.32
287 0.35
288 0.34
289 0.36
290 0.36
291 0.34
292 0.32
293 0.29
294 0.27
295 0.24
296 0.23
297 0.22
298 0.23
299 0.22
300 0.22
301 0.19
302 0.18
303 0.24
304 0.24
305 0.22
306 0.21
307 0.21
308 0.2
309 0.22
310 0.24
311 0.18
312 0.21
313 0.24
314 0.25
315 0.24
316 0.31
317 0.36
318 0.38
319 0.45
320 0.52
321 0.59
322 0.66
323 0.74
324 0.77
325 0.78
326 0.81
327 0.82
328 0.83
329 0.77
330 0.76
331 0.67
332 0.59
333 0.54
334 0.56
335 0.5
336 0.4
337 0.36
338 0.33
339 0.32
340 0.31
341 0.24
342 0.14
343 0.12
344 0.09
345 0.08
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.09
355 0.12
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.17
361 0.16
362 0.15
363 0.12
364 0.1
365 0.1
366 0.12
367 0.1
368 0.08
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.13
375 0.2
376 0.31
377 0.41
378 0.52
379 0.59
380 0.65
381 0.73
382 0.78
383 0.82
384 0.82
385 0.82
386 0.83
387 0.87
388 0.9
389 0.92
390 0.88