Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5Y6J8

Protein Details
Accession A0A2C5Y6J8    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-51ASETTEQRAKRLRKEARRRLRVTWKPEAEHydrophilic
480-507GESHQHTKDGRRKKTLPPHKPVNKALIGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-43RAKRLRKEARRRLR
490-495RRKKTL
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9, pero 7, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041367  Znf-CCCH_4  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF18044  zf-CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MQRKPEPAAEATSSTKDGKEADASETTEQRAKRLRKEARRRLRVTWKPEAELVQVKVFEKDDDEDEGRDVNMIRDAADDRSEGMMLKRRANEAFDEDDDDAPLRSWRMLTRMDTSRLSEEARSKNYVTRGGLVTFTTEEQKRMAEREQQELMVIYTDPNDIPPTPKSPPLEAAQLDKAARILHLAHEDGALNEVHLRWKELDQLGPYSILGRLNQSGSSSAGLQASGSGQAATAGTTLTTVANNNVAFVRGPAVESEILAILGCNSWRDTRSILIDTAHVPQYTEQEVVLSIQIIEKVTGSLAGKPYPAIAPHDWMINDEERRRTEEERAKAEVEANSLRAAAAASAAASAGSSNGQDWSAYFTPQNQAYAPYLALLQQMSGGPQQVQQQQAALAPPPPPQPPTLAHVAPSSGTPTLSQIPDSQLHSILAAINQPGQAQQSSVGAYELAFPAHTQNSTIQAHTGERERDWERGEGSSNRGESHQHTKDGRRKKTLPPHKPVNKALIGTKPCTFWQQGKCARGDKCTFRHD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.29
3 0.26
4 0.24
5 0.23
6 0.25
7 0.24
8 0.25
9 0.27
10 0.29
11 0.31
12 0.32
13 0.32
14 0.32
15 0.3
16 0.32
17 0.38
18 0.43
19 0.48
20 0.57
21 0.65
22 0.71
23 0.82
24 0.87
25 0.89
26 0.92
27 0.88
28 0.87
29 0.88
30 0.86
31 0.83
32 0.83
33 0.77
34 0.69
35 0.67
36 0.6
37 0.54
38 0.51
39 0.45
40 0.38
41 0.35
42 0.33
43 0.32
44 0.3
45 0.25
46 0.21
47 0.21
48 0.19
49 0.23
50 0.24
51 0.22
52 0.22
53 0.22
54 0.19
55 0.18
56 0.17
57 0.12
58 0.14
59 0.13
60 0.12
61 0.13
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.13
70 0.15
71 0.22
72 0.24
73 0.3
74 0.31
75 0.34
76 0.36
77 0.37
78 0.37
79 0.33
80 0.35
81 0.3
82 0.31
83 0.29
84 0.27
85 0.25
86 0.22
87 0.17
88 0.13
89 0.13
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.16
95 0.2
96 0.23
97 0.29
98 0.34
99 0.37
100 0.38
101 0.39
102 0.37
103 0.34
104 0.33
105 0.3
106 0.32
107 0.34
108 0.36
109 0.37
110 0.36
111 0.38
112 0.4
113 0.42
114 0.35
115 0.33
116 0.31
117 0.28
118 0.28
119 0.23
120 0.21
121 0.17
122 0.16
123 0.18
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.19
128 0.19
129 0.21
130 0.24
131 0.27
132 0.29
133 0.34
134 0.35
135 0.33
136 0.31
137 0.29
138 0.25
139 0.17
140 0.14
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.09
148 0.12
149 0.14
150 0.18
151 0.2
152 0.25
153 0.27
154 0.27
155 0.3
156 0.3
157 0.33
158 0.29
159 0.3
160 0.27
161 0.27
162 0.25
163 0.21
164 0.2
165 0.14
166 0.13
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.09
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.18
187 0.18
188 0.21
189 0.19
190 0.21
191 0.2
192 0.19
193 0.18
194 0.13
195 0.13
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.06
238 0.07
239 0.06
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.11
258 0.14
259 0.15
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.1
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.06
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.1
295 0.11
296 0.13
297 0.12
298 0.14
299 0.15
300 0.17
301 0.16
302 0.16
303 0.17
304 0.17
305 0.19
306 0.19
307 0.23
308 0.23
309 0.26
310 0.29
311 0.29
312 0.34
313 0.39
314 0.42
315 0.42
316 0.44
317 0.41
318 0.38
319 0.39
320 0.3
321 0.26
322 0.21
323 0.17
324 0.14
325 0.13
326 0.13
327 0.1
328 0.09
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.12
347 0.13
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.19
352 0.2
353 0.22
354 0.15
355 0.17
356 0.18
357 0.18
358 0.16
359 0.13
360 0.12
361 0.11
362 0.12
363 0.09
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.11
372 0.17
373 0.2
374 0.22
375 0.21
376 0.21
377 0.21
378 0.22
379 0.2
380 0.15
381 0.14
382 0.13
383 0.16
384 0.19
385 0.21
386 0.21
387 0.21
388 0.24
389 0.24
390 0.26
391 0.29
392 0.26
393 0.26
394 0.25
395 0.24
396 0.21
397 0.19
398 0.17
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.12
403 0.16
404 0.16
405 0.17
406 0.16
407 0.2
408 0.23
409 0.25
410 0.23
411 0.2
412 0.2
413 0.19
414 0.17
415 0.14
416 0.12
417 0.11
418 0.1
419 0.11
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.12
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.09
432 0.09
433 0.11
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.11
439 0.13
440 0.13
441 0.13
442 0.14
443 0.21
444 0.23
445 0.23
446 0.21
447 0.21
448 0.23
449 0.24
450 0.28
451 0.24
452 0.23
453 0.29
454 0.3
455 0.32
456 0.33
457 0.33
458 0.29
459 0.29
460 0.34
461 0.31
462 0.33
463 0.35
464 0.33
465 0.31
466 0.3
467 0.31
468 0.3
469 0.38
470 0.38
471 0.4
472 0.45
473 0.54
474 0.62
475 0.69
476 0.73
477 0.73
478 0.73
479 0.77
480 0.82
481 0.83
482 0.85
483 0.84
484 0.86
485 0.85
486 0.88
487 0.84
488 0.81
489 0.75
490 0.68
491 0.63
492 0.61
493 0.57
494 0.52
495 0.49
496 0.43
497 0.39
498 0.42
499 0.41
500 0.4
501 0.44
502 0.5
503 0.56
504 0.59
505 0.63
506 0.65
507 0.64
508 0.64
509 0.64
510 0.63