Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X6Y1

Protein Details
Accession A0A2C5X6Y1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-257LFSDRPTRRSRNRSASPRREARDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-201RRRQQQGQARYRDRDRHGHGHKHGPGRPRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDLDIEMGDAAPEAAHVANLPSADDILQPDEPEEPGELTDKDLDGLDNPSLVPEKLHLCGLDTLHTDDVRAYVNSYYGAVERIEWIDDTSANLVFPSDLVARDALSALSAIQVTDASALSVGELLPAKALADKPDISLQLRLALESDRKQAGAALRSRYYLIHPEHDPEEKRRRQQQGQARYRDRDRHGHGHKHGPGRPRRHSDDEAETFDAAMYDDAPRTGDARSWSENRGKELFSDRPTRRSRNRSASPRREARDEAYMDVEPPICTQNTSNRAFSRSLKRHMANATYKQPKELFPTRAPGRGGQLDQLERSIGSATLQEDDMPKIVSTPQTGIFNIRGFASRHTQSPTSPTGSGGFAIKGTATNTRQGLPVKTGIGRGGGWGGGGGGGEGGGGGGSTAAAGTDTGFRARAIRGGGNAGKELLDPARSKTRSKAHNLLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.06
4 0.07
5 0.08
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.14
14 0.15
15 0.14
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.11
22 0.12
23 0.14
24 0.14
25 0.15
26 0.16
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.12
32 0.15
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.12
37 0.14
38 0.13
39 0.12
40 0.12
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.17
45 0.17
46 0.21
47 0.21
48 0.22
49 0.21
50 0.22
51 0.23
52 0.23
53 0.2
54 0.17
55 0.17
56 0.16
57 0.14
58 0.13
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.1
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.13
119 0.13
120 0.15
121 0.18
122 0.2
123 0.19
124 0.2
125 0.18
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.15
130 0.16
131 0.18
132 0.19
133 0.22
134 0.18
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.21
139 0.23
140 0.25
141 0.26
142 0.26
143 0.27
144 0.28
145 0.26
146 0.24
147 0.26
148 0.24
149 0.23
150 0.24
151 0.26
152 0.27
153 0.32
154 0.32
155 0.33
156 0.41
157 0.43
158 0.49
159 0.55
160 0.6
161 0.61
162 0.68
163 0.69
164 0.7
165 0.73
166 0.76
167 0.73
168 0.7
169 0.69
170 0.68
171 0.63
172 0.6
173 0.57
174 0.57
175 0.59
176 0.63
177 0.61
178 0.62
179 0.64
180 0.63
181 0.6
182 0.59
183 0.59
184 0.6
185 0.64
186 0.62
187 0.62
188 0.62
189 0.62
190 0.57
191 0.58
192 0.52
193 0.47
194 0.41
195 0.34
196 0.27
197 0.23
198 0.19
199 0.11
200 0.07
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.08
210 0.1
211 0.13
212 0.16
213 0.18
214 0.21
215 0.26
216 0.28
217 0.29
218 0.29
219 0.26
220 0.24
221 0.28
222 0.29
223 0.27
224 0.35
225 0.33
226 0.4
227 0.45
228 0.51
229 0.55
230 0.59
231 0.64
232 0.65
233 0.73
234 0.75
235 0.8
236 0.82
237 0.82
238 0.81
239 0.75
240 0.69
241 0.62
242 0.54
243 0.5
244 0.41
245 0.34
246 0.28
247 0.26
248 0.22
249 0.2
250 0.18
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.17
258 0.24
259 0.27
260 0.3
261 0.3
262 0.33
263 0.35
264 0.4
265 0.43
266 0.42
267 0.45
268 0.49
269 0.49
270 0.51
271 0.52
272 0.54
273 0.5
274 0.49
275 0.52
276 0.53
277 0.52
278 0.51
279 0.49
280 0.44
281 0.44
282 0.46
283 0.43
284 0.37
285 0.46
286 0.45
287 0.48
288 0.47
289 0.4
290 0.38
291 0.35
292 0.33
293 0.28
294 0.29
295 0.26
296 0.25
297 0.24
298 0.19
299 0.15
300 0.15
301 0.12
302 0.08
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.15
319 0.17
320 0.18
321 0.19
322 0.21
323 0.22
324 0.21
325 0.2
326 0.18
327 0.18
328 0.17
329 0.2
330 0.24
331 0.23
332 0.25
333 0.29
334 0.3
335 0.28
336 0.33
337 0.34
338 0.31
339 0.3
340 0.28
341 0.25
342 0.25
343 0.24
344 0.2
345 0.16
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.1
351 0.17
352 0.17
353 0.22
354 0.23
355 0.24
356 0.28
357 0.3
358 0.31
359 0.28
360 0.3
361 0.28
362 0.28
363 0.28
364 0.25
365 0.24
366 0.21
367 0.18
368 0.16
369 0.13
370 0.11
371 0.09
372 0.08
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.02
382 0.02
383 0.02
384 0.02
385 0.02
386 0.02
387 0.02
388 0.02
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.07
393 0.09
394 0.1
395 0.11
396 0.11
397 0.14
398 0.15
399 0.18
400 0.19
401 0.21
402 0.21
403 0.28
404 0.31
405 0.3
406 0.3
407 0.27
408 0.24
409 0.21
410 0.22
411 0.17
412 0.2
413 0.19
414 0.24
415 0.33
416 0.36
417 0.39
418 0.45
419 0.52
420 0.56
421 0.63