FuNGI

A0A2C5Y9T0

Protein Details

Accession

A0A2C5Y9T0

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MSLRTLGLSKRQRPRPLLNFVA	Hydrophilic
148-168	LPRRARITRKYGDKKSKRAGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
151-165	RARITRKYGDKKSKR
212-219	SGSKKSKF

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 5.5, cyto_mito 5.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MSLRTLGLSKRQRPRPLLNFVASRPRKIHNERNIDDPPMSSDDEEDTSEHVSQSCSRTNSPLGPGQDEGTRSSYRQGDIQSTTFGSSRQVMREQRGVRRSSERLSSNTVRDATPPCQKRQRVDQTSAEGREEDNNSPTNHDMTEQPFLPRRARITRKYGDKKSKRAGLGLIVPPSIAKSPVQHSSTKNLRVPPVLPAKDNTSCTEPEKGKASGSKKSKFRPRVAQDEPPSPCRPLFKVPLELSEIESRTDNANQVKDSSDVSHNEVGDDFDQSPIIALQESKPEEPKCPWCGKVVDKKLLDNFFQGKHMKVQMQMRFCQMHKKHTAVEAWQSRGYPDIDWKTLVSRFAVHRKFLLDIIHGEKSFFRAMQAHKIATGQARTVLKEGNLNPGYYGPRGFDMMCDYLGEEYKNELKDRARSDRVIAGRGVAAFVQTVLVAELAVQLIKDDMGVSDEEAREILEDSKALGDLVHTEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.82
3	0.81
4	0.79
5	0.76
6	0.72
7	0.66
8	0.69
9	0.61
10	0.58
11	0.52
12	0.51
13	0.55
14	0.59
15	0.65
16	0.65
17	0.72
18	0.69
19	0.73
20	0.7
21	0.64
22	0.55
23	0.46
24	0.4
25	0.32
26	0.32
27	0.24
28	0.21
29	0.2
30	0.21
31	0.21
32	0.17
33	0.15
34	0.16
35	0.17
36	0.16
37	0.14
38	0.15
39	0.18
40	0.22
41	0.27
42	0.28
43	0.29
44	0.33
45	0.36
46	0.38
47	0.39
48	0.4
49	0.37
50	0.36
51	0.36
52	0.33
53	0.32
54	0.29
55	0.27
56	0.25
57	0.24
58	0.22
59	0.26
60	0.27
61	0.25
62	0.28
63	0.28
64	0.29
65	0.31
66	0.32
67	0.29
68	0.26
69	0.27
70	0.23
71	0.21
72	0.18
73	0.18
74	0.2
75	0.22
76	0.29
77	0.32
78	0.36
79	0.45
80	0.48
81	0.53
82	0.57
83	0.55
84	0.53
85	0.55
86	0.55
87	0.51
88	0.52
89	0.47
90	0.43
91	0.49
92	0.49
93	0.45
94	0.45
95	0.42
96	0.35
97	0.35
98	0.36
99	0.34
100	0.38
101	0.4
102	0.42
103	0.5
104	0.54
105	0.56
106	0.62
107	0.68
108	0.66
109	0.68
110	0.66
111	0.64
112	0.66
113	0.62
114	0.52
115	0.41
116	0.35
117	0.33
118	0.31
119	0.25
120	0.21
121	0.23
122	0.22
123	0.24
124	0.25
125	0.21
126	0.18
127	0.17
128	0.17
129	0.17
130	0.21
131	0.19
132	0.21
133	0.26
134	0.28
135	0.3
136	0.3
137	0.33
138	0.39
139	0.46
140	0.5
141	0.54
142	0.58
143	0.66
144	0.73
145	0.77
146	0.79
147	0.79
148	0.81
149	0.8
150	0.8
151	0.7
152	0.63
153	0.54
154	0.47
155	0.45
156	0.39
157	0.32
158	0.25
159	0.23
160	0.2
161	0.2
162	0.16
163	0.11
164	0.08
165	0.1
166	0.13
167	0.2
168	0.23
169	0.26
170	0.28
171	0.35
172	0.41
173	0.45
174	0.45
175	0.42
176	0.41
177	0.39
178	0.38
179	0.36
180	0.39
181	0.34
182	0.31
183	0.3
184	0.33
185	0.34
186	0.35
187	0.3
188	0.24
189	0.24
190	0.25
191	0.3
192	0.26
193	0.24
194	0.26
195	0.25
196	0.23
197	0.28
198	0.29
199	0.31
200	0.38
201	0.43
202	0.45
203	0.52
204	0.61
205	0.63
206	0.66
207	0.69
208	0.67
209	0.69
210	0.68
211	0.69
212	0.62
213	0.61
214	0.57
215	0.51
216	0.47
217	0.39
218	0.35
219	0.29
220	0.28
221	0.26
222	0.3
223	0.28
224	0.33
225	0.32
226	0.33
227	0.34
228	0.31
229	0.28
230	0.25
231	0.22
232	0.16
233	0.15
234	0.14
235	0.13
236	0.14
237	0.15
238	0.14
239	0.15
240	0.15
241	0.16
242	0.16
243	0.15
244	0.15
245	0.14
246	0.15
247	0.15
248	0.18
249	0.19
250	0.18
251	0.17
252	0.17
253	0.15
254	0.13
255	0.13
256	0.1
257	0.07
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.06
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.11
267	0.13
268	0.14
269	0.19
270	0.2
271	0.22
272	0.26
273	0.31
274	0.32
275	0.35
276	0.35
277	0.34
278	0.37
279	0.42
280	0.48
281	0.49
282	0.51
283	0.49
284	0.5
285	0.52
286	0.5
287	0.44
288	0.37
289	0.33
290	0.26
291	0.3
292	0.28
293	0.24
294	0.25
295	0.28
296	0.25
297	0.28
298	0.34
299	0.35
300	0.38
301	0.39
302	0.39
303	0.39
304	0.37
305	0.43
306	0.38
307	0.41
308	0.42
309	0.43
310	0.41
311	0.43
312	0.45
313	0.37
314	0.44
315	0.4
316	0.38
317	0.37
318	0.34
319	0.3
320	0.3
321	0.28
322	0.19
323	0.22
324	0.23
325	0.22
326	0.23
327	0.23
328	0.24
329	0.25
330	0.25
331	0.18
332	0.18
333	0.22
334	0.31
335	0.35
336	0.32
337	0.32
338	0.33
339	0.34
340	0.32
341	0.29
342	0.21
343	0.21
344	0.24
345	0.26
346	0.24
347	0.24
348	0.22
349	0.23
350	0.22
351	0.19
352	0.16
353	0.18
354	0.21
355	0.3
356	0.34
357	0.31
358	0.3
359	0.31
360	0.31
361	0.3
362	0.28
363	0.19
364	0.22
365	0.23
366	0.23
367	0.24
368	0.24
369	0.2
370	0.25
371	0.26
372	0.3
373	0.3
374	0.28
375	0.27
376	0.28
377	0.3
378	0.25
379	0.25
380	0.16
381	0.16
382	0.18
383	0.17
384	0.16
385	0.18
386	0.18
387	0.17
388	0.16
389	0.15
390	0.15
391	0.16
392	0.16
393	0.11
394	0.14
395	0.19
396	0.21
397	0.22
398	0.25
399	0.28
400	0.35
401	0.42
402	0.47
403	0.48
404	0.48
405	0.5
406	0.54
407	0.52
408	0.48
409	0.4
410	0.33
411	0.28
412	0.26
413	0.24
414	0.16
415	0.13
416	0.1
417	0.09
418	0.08
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.07
436	0.08
437	0.09
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.14
443	0.13
444	0.14
445	0.14
446	0.1
447	0.1
448	0.11
449	0.12
450	0.12
451	0.11
452	0.1
453	0.09

A0A2C5Y9T0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer