Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X9W0

Protein Details
Accession A0A2C5X9W0    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-209AEVKDPKRIRHPTKRQARCVDVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MASGPRSGGRVVHQDYIARIRFSNALPPPPNPPKLLELANTGLASGQYTTPGFAWRLAREQPLNIEADGELGMPLNLVGMPGVFDGDEGSIQAPAQQPPVHARDRPLLRPMAALGKPKVAESNVSFLRRTEYISSSTATAKRPDASSHTPALMPRQVVRPPRPAPQAAASTPQAIKRKLDAAFDAAAAEVKDPKRIRHPTKRQARCVDVLPLVPDLDGFPDSGAYVTVKFLTNPVPSSAHYDERLLSGMLRPIERTATEEAVYEAALAAHEQDPATYAKPQNLMNYDFYLAHTLAAAQAFRQKFDVADAQRDSDHLYTHRASGRGFFQFNRVRAYETVQETELDHPTKYDDEVILSFDDAAVYYYPVMQRSSIRPQRTKNIARVTGFTQEGDDQIVDQLDITVEEPTDEMRQVICAYKEQPLGLHQAGELDDEDGDAEQQEQQQQQQQQQAETTDATADSDTMANDNGDAPDQNDEHQATKTPDDDQDAEGEEDVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.39
3 0.45
4 0.43
5 0.36
6 0.32
7 0.3
8 0.33
9 0.32
10 0.37
11 0.34
12 0.39
13 0.41
14 0.43
15 0.5
16 0.54
17 0.57
18 0.5
19 0.48
20 0.43
21 0.45
22 0.46
23 0.39
24 0.35
25 0.34
26 0.34
27 0.3
28 0.26
29 0.21
30 0.18
31 0.16
32 0.13
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.15
39 0.15
40 0.18
41 0.22
42 0.22
43 0.28
44 0.3
45 0.37
46 0.36
47 0.37
48 0.37
49 0.35
50 0.34
51 0.29
52 0.26
53 0.19
54 0.18
55 0.15
56 0.11
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.05
61 0.05
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.03
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.09
80 0.11
81 0.12
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.24
86 0.29
87 0.31
88 0.3
89 0.33
90 0.38
91 0.42
92 0.45
93 0.44
94 0.42
95 0.38
96 0.37
97 0.35
98 0.34
99 0.31
100 0.33
101 0.29
102 0.3
103 0.3
104 0.3
105 0.3
106 0.23
107 0.24
108 0.21
109 0.27
110 0.28
111 0.29
112 0.29
113 0.27
114 0.3
115 0.26
116 0.27
117 0.24
118 0.21
119 0.22
120 0.24
121 0.24
122 0.22
123 0.26
124 0.26
125 0.24
126 0.25
127 0.24
128 0.25
129 0.25
130 0.26
131 0.29
132 0.32
133 0.34
134 0.33
135 0.32
136 0.31
137 0.3
138 0.32
139 0.28
140 0.23
141 0.21
142 0.24
143 0.28
144 0.35
145 0.39
146 0.44
147 0.44
148 0.5
149 0.53
150 0.49
151 0.46
152 0.44
153 0.43
154 0.35
155 0.36
156 0.3
157 0.28
158 0.28
159 0.31
160 0.31
161 0.28
162 0.28
163 0.26
164 0.31
165 0.29
166 0.3
167 0.25
168 0.23
169 0.22
170 0.21
171 0.18
172 0.13
173 0.12
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.17
179 0.18
180 0.2
181 0.29
182 0.39
183 0.49
184 0.55
185 0.66
186 0.69
187 0.79
188 0.86
189 0.85
190 0.81
191 0.76
192 0.67
193 0.59
194 0.53
195 0.43
196 0.35
197 0.27
198 0.21
199 0.17
200 0.14
201 0.11
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.21
225 0.23
226 0.21
227 0.21
228 0.2
229 0.19
230 0.18
231 0.18
232 0.12
233 0.09
234 0.08
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.11
264 0.12
265 0.14
266 0.17
267 0.18
268 0.2
269 0.22
270 0.24
271 0.22
272 0.22
273 0.21
274 0.19
275 0.18
276 0.17
277 0.14
278 0.11
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.05
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.15
292 0.22
293 0.17
294 0.23
295 0.23
296 0.23
297 0.23
298 0.23
299 0.23
300 0.16
301 0.16
302 0.12
303 0.15
304 0.15
305 0.19
306 0.21
307 0.2
308 0.2
309 0.21
310 0.24
311 0.24
312 0.25
313 0.22
314 0.28
315 0.33
316 0.34
317 0.36
318 0.32
319 0.31
320 0.3
321 0.34
322 0.31
323 0.28
324 0.28
325 0.24
326 0.24
327 0.22
328 0.24
329 0.24
330 0.19
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.14
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.13
341 0.12
342 0.11
343 0.1
344 0.08
345 0.08
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.07
352 0.09
353 0.1
354 0.11
355 0.12
356 0.15
357 0.2
358 0.31
359 0.37
360 0.44
361 0.49
362 0.54
363 0.62
364 0.69
365 0.7
366 0.68
367 0.7
368 0.68
369 0.63
370 0.61
371 0.54
372 0.49
373 0.43
374 0.35
375 0.27
376 0.21
377 0.2
378 0.18
379 0.15
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.08
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.1
399 0.11
400 0.15
401 0.15
402 0.17
403 0.18
404 0.24
405 0.26
406 0.25
407 0.25
408 0.23
409 0.29
410 0.26
411 0.24
412 0.18
413 0.18
414 0.18
415 0.18
416 0.16
417 0.1
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.08
426 0.1
427 0.15
428 0.16
429 0.2
430 0.27
431 0.32
432 0.37
433 0.42
434 0.42
435 0.4
436 0.41
437 0.39
438 0.34
439 0.3
440 0.25
441 0.19
442 0.16
443 0.15
444 0.12
445 0.11
446 0.09
447 0.1
448 0.09
449 0.09
450 0.1
451 0.09
452 0.09
453 0.11
454 0.1
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.16
459 0.16
460 0.17
461 0.21
462 0.22
463 0.23
464 0.24
465 0.28
466 0.26
467 0.29
468 0.29
469 0.28
470 0.29
471 0.33
472 0.34
473 0.3
474 0.29
475 0.29
476 0.28