FuNGI

A0A2C5YCW3

Protein Details

Accession

A0A2C5YCW3

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
96-121	DTRGKNTTRSTKPAKNRGHKTTPEPD	Hydrophilic
126-149	CSPLSKDQPWRKFKSPSKAKGDTT	Hydrophilic
289-314	PDSPRATSKPPPRKKAVRKNPQTVTA	Hydrophilic
341-367	VKTAKGQPRKRAAKPRGKKKNLPAKPM	Basic
643-684	KEKEAKASRARDKKPKTCKPKDKEAKRSKTIGRQPRKPHGDD	Basic
709-735	LESNGPETRKKRRPGRRAKPSLAQDGA	Hydrophilic
763-783	TPSPPRKTRLALKSRRQELES	Hydrophilic
905-924	KKSVCCLWRLNLRRQERRRL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
293-307	RATSKPPPRKKAVRK
344-365	AKGQPRKRAAKPRGKKKNLPAK
632-681	RARPGMTESKTKEKEAKASRARDKKPKTCKPKDKEAKRSKTIGRQPRKPH
717-728	RKKRRPGRRAKP
749-777	RGAKKRAGRGGKDATPSPPRKTRLALKSR

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4

Amino Acid Sequences

MATPDAFMSSPARGTRNPSLAASTSSPDLPSLHELLARNPKQPVLKSGSNAVSIPENATAAFASAGTLWKSLCHNDAAPSNVVEVAENTDAPVIQDTRGKNTTRSTKPAKNRGHKTTPEPDAEEPCSPLSKDQPWRKFKSPSKAKGDTTAEPCQFAGIITVSSSPFGKAVHSHYFQTPETPTRSRTEIPQHKAQDEALNLEPAMNRRLSWTPPVPGSVVILDSDDGPADSSGSRQGHSVSQGTFGSILAPFRCCENLQQSTLVNSDESSANGKKRKSIEPTPGIGIHVPDSPRATSKPPPRKKAVRKNPQTVTALATAAYRSAIQVDDSCQDAELVQVAEVKTAKGQPRKRAAKPRGKKKNLPAKPMLLSPTAALRQVARQDFIFGTSSQLVRSESPSLPRNLEASRRPSSQLDQVDLETPINSDALESVERRRTLWDAGARDEDGELFDFELNNMPDGSRQRVQESDPFGYMRGHDEAFLLPHLAAHSNGDTEDLFVPVVAPRVSPRREATNVQKNCIAANPLTAIGVEADPHELAVPHMPARANQDQTLEAALQVVPKVTRAAPSGSSYDLFSDAQLSKQIADYGFKPIKRRTAMIALLEQCQQGKSAATPQGIRSASTLAKEMPKVASRARPGMTESKTKEKEAKASRARDKKPKTCKPKDKEAKRSKTIGRQPRKPHGDDGAKIQEPPPSAQPIPGPEEVSRSDLESNGPETRKKRRPGRRAKPSLAQDGAVQKQVPANQQSETRGAKKRAGRGGKDATPSPPRKTRLALKSRRQELESLEDEFEEMLDLELDQVDSSWWSESTFSDSGPCDLSLTMDEDTTVLHQSSSEQQAMLFRYMSKAVTSAPRTNDAANPSWHDKILLYDPIVIEDLAAWLNSGQLTRVGCDDEVSLDEVKKWCEKKSVCCLWRLNLRRQERRRL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.39
3	0.43
4	0.44
5	0.41
6	0.42
7	0.4
8	0.42
9	0.37
10	0.31
11	0.27
12	0.25
13	0.24
14	0.21
15	0.2
16	0.19
17	0.21
18	0.21
19	0.2
20	0.23
21	0.23
22	0.3
23	0.4
24	0.39
25	0.39
26	0.38
27	0.42
28	0.45
29	0.47
30	0.47
31	0.45
32	0.48
33	0.46
34	0.52
35	0.5
36	0.46
37	0.43
38	0.36
39	0.31
40	0.27
41	0.26
42	0.19
43	0.16
44	0.14
45	0.15
46	0.13
47	0.1
48	0.09
49	0.07
50	0.07
51	0.07
52	0.1
53	0.1
54	0.11
55	0.1
56	0.13
57	0.16
58	0.18
59	0.2
60	0.21
61	0.22
62	0.25
63	0.29
64	0.31
65	0.3
66	0.27
67	0.26
68	0.23
69	0.22
70	0.17
71	0.14
72	0.14
73	0.14
74	0.13
75	0.12
76	0.12
77	0.12
78	0.12
79	0.14
80	0.11
81	0.12
82	0.17
83	0.19
84	0.25
85	0.31
86	0.32
87	0.33
88	0.41
89	0.49
90	0.51
91	0.59
92	0.6
93	0.65
94	0.73
95	0.79
96	0.81
97	0.82
98	0.84
99	0.85
100	0.86
101	0.83
102	0.81
103	0.8
104	0.76
105	0.7
106	0.65
107	0.59
108	0.55
109	0.53
110	0.46
111	0.38
112	0.33
113	0.3
114	0.26
115	0.26
116	0.26
117	0.31
118	0.4
119	0.48
120	0.57
121	0.64
122	0.71
123	0.75
124	0.79
125	0.79
126	0.81
127	0.81
128	0.81
129	0.81
130	0.81
131	0.76
132	0.74
133	0.71
134	0.67
135	0.63
136	0.62
137	0.53
138	0.46
139	0.44
140	0.35
141	0.29
142	0.22
143	0.17
144	0.09
145	0.09
146	0.08
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.11
151	0.09
152	0.1
153	0.1
154	0.11
155	0.12
156	0.19
157	0.26
158	0.28
159	0.3
160	0.32
161	0.36
162	0.34
163	0.35
164	0.33
165	0.3
166	0.34
167	0.34
168	0.35
169	0.34
170	0.38
171	0.36
172	0.39
173	0.45
174	0.49
175	0.52
176	0.58
177	0.59
178	0.55
179	0.55
180	0.5
181	0.44
182	0.35
183	0.33
184	0.25
185	0.22
186	0.21
187	0.2
188	0.2
189	0.17
190	0.19
191	0.15
192	0.13
193	0.16
194	0.2
195	0.21
196	0.27
197	0.29
198	0.31
199	0.31
200	0.33
201	0.3
202	0.27
203	0.26
204	0.19
205	0.15
206	0.11
207	0.1
208	0.09
209	0.08
210	0.08
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.13
219	0.14
220	0.14
221	0.14
222	0.16
223	0.17
224	0.2
225	0.23
226	0.17
227	0.19
228	0.18
229	0.18
230	0.17
231	0.14
232	0.12
233	0.1
234	0.12
235	0.1
236	0.11
237	0.1
238	0.12
239	0.14
240	0.13
241	0.17
242	0.23
243	0.27
244	0.27
245	0.29
246	0.28
247	0.28
248	0.28
249	0.24
250	0.17
251	0.12
252	0.12
253	0.11
254	0.11
255	0.14
256	0.16
257	0.21
258	0.26
259	0.27
260	0.31
261	0.35
262	0.42
263	0.45
264	0.5
265	0.54
266	0.56
267	0.58
268	0.55
269	0.51
270	0.44
271	0.37
272	0.29
273	0.21
274	0.18
275	0.15
276	0.14
277	0.15
278	0.15
279	0.17
280	0.18
281	0.21
282	0.27
283	0.37
284	0.46
285	0.54
286	0.6
287	0.67
288	0.75
289	0.82
290	0.85
291	0.86
292	0.86
293	0.86
294	0.88
295	0.84
296	0.8
297	0.71
298	0.61
299	0.53
300	0.43
301	0.33
302	0.24
303	0.2
304	0.13
305	0.11
306	0.1
307	0.07
308	0.05
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.07
313	0.09
314	0.09
315	0.11
316	0.11
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.08
321	0.07
322	0.06
323	0.05
324	0.08
325	0.07
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.14
331	0.2
332	0.27
333	0.33
334	0.4
335	0.51
336	0.59
337	0.66
338	0.72
339	0.77
340	0.79
341	0.83
342	0.86
343	0.86
344	0.86
345	0.85
346	0.85
347	0.85
348	0.82
349	0.79
350	0.73
351	0.67
352	0.61
353	0.55
354	0.47
355	0.37
356	0.3
357	0.23
358	0.21
359	0.17
360	0.15
361	0.13
362	0.11
363	0.13
364	0.18
365	0.18
366	0.16
367	0.15
368	0.17
369	0.17
370	0.18
371	0.17
372	0.11
373	0.13
374	0.13
375	0.13
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.13
381	0.15
382	0.15
383	0.19
384	0.22
385	0.23
386	0.23
387	0.23
388	0.24
389	0.21
390	0.26
391	0.26
392	0.29
393	0.31
394	0.32
395	0.33
396	0.32
397	0.33
398	0.34
399	0.31
400	0.27
401	0.24
402	0.23
403	0.22
404	0.21
405	0.18
406	0.11
407	0.1
408	0.08
409	0.07
410	0.06
411	0.04
412	0.04
413	0.05
414	0.06
415	0.07
416	0.1
417	0.14
418	0.15
419	0.15
420	0.17
421	0.17
422	0.17
423	0.21
424	0.23
425	0.2
426	0.22
427	0.23
428	0.21
429	0.2
430	0.18
431	0.14
432	0.09
433	0.08
434	0.06
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.09
445	0.11
446	0.15
447	0.16
448	0.16
449	0.18
450	0.19
451	0.21
452	0.23
453	0.26
454	0.23
455	0.21
456	0.2
457	0.19
458	0.19
459	0.17
460	0.15
461	0.12
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.09
468	0.07
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.06
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.08
491	0.14
492	0.16
493	0.19
494	0.2
495	0.25
496	0.28
497	0.32
498	0.4
499	0.44
500	0.44
501	0.43
502	0.43
503	0.37
504	0.34
505	0.31
506	0.23
507	0.13
508	0.12
509	0.11
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.08
514	0.06
515	0.06
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.07
526	0.07
527	0.09
528	0.09
529	0.1
530	0.17
531	0.22
532	0.22
533	0.22
534	0.23
535	0.22
536	0.22
537	0.22
538	0.15
539	0.1
540	0.09
541	0.08
542	0.07
543	0.06
544	0.07
545	0.06
546	0.06
547	0.08
548	0.08
549	0.1
550	0.11
551	0.13
552	0.14
553	0.16
554	0.17
555	0.17
556	0.17
557	0.15
558	0.14
559	0.14
560	0.12
561	0.1
562	0.12
563	0.11
564	0.11
565	0.13
566	0.12
567	0.11
568	0.11
569	0.13
570	0.1
571	0.11
572	0.12
573	0.18
574	0.22
575	0.23
576	0.28
577	0.3
578	0.37
579	0.38
580	0.39
581	0.34
582	0.38
583	0.39
584	0.36
585	0.38
586	0.31
587	0.31
588	0.3
589	0.26
590	0.2
591	0.17
592	0.15
593	0.11
594	0.1
595	0.09
596	0.14
597	0.18
598	0.19
599	0.21
600	0.21
601	0.28
602	0.27
603	0.27
604	0.22
605	0.21
606	0.2
607	0.19
608	0.2
609	0.14
610	0.17
611	0.17
612	0.18
613	0.18
614	0.19
615	0.21
616	0.23
617	0.28
618	0.28
619	0.32
620	0.32
621	0.3
622	0.31
623	0.37
624	0.36
625	0.38
626	0.39
627	0.44
628	0.46
629	0.47
630	0.5
631	0.44
632	0.5
633	0.5
634	0.57
635	0.55
636	0.62
637	0.69
638	0.72
639	0.77
640	0.78
641	0.8
642	0.79
643	0.82
644	0.83
645	0.85
646	0.86
647	0.9
648	0.87
649	0.88
650	0.89
651	0.89
652	0.9
653	0.9
654	0.88
655	0.84
656	0.84
657	0.79
658	0.79
659	0.78
660	0.77
661	0.76
662	0.76
663	0.79
664	0.81
665	0.82
666	0.75
667	0.7
668	0.69
669	0.66
670	0.58
671	0.57
672	0.55
673	0.47
674	0.45
675	0.41
676	0.35
677	0.29
678	0.3
679	0.25
680	0.23
681	0.23
682	0.24
683	0.26
684	0.26
685	0.3
686	0.29
687	0.28
688	0.23
689	0.26
690	0.25
691	0.26
692	0.22
693	0.19
694	0.18
695	0.16
696	0.17
697	0.16
698	0.18
699	0.21
700	0.22
701	0.26
702	0.31
703	0.4
704	0.48
705	0.55
706	0.62
707	0.68
708	0.77
709	0.83
710	0.89
711	0.9
712	0.92
713	0.89
714	0.87
715	0.83
716	0.8
717	0.7
718	0.59
719	0.52
720	0.48
721	0.43
722	0.37
723	0.3
724	0.23
725	0.24
726	0.27
727	0.29
728	0.26
729	0.26
730	0.26
731	0.29
732	0.31
733	0.35
734	0.36
735	0.38
736	0.42
737	0.44
738	0.48
739	0.51
740	0.56
741	0.6
742	0.64
743	0.61
744	0.62
745	0.66
746	0.64
747	0.62
748	0.56
749	0.53
750	0.54
751	0.55
752	0.54
753	0.54
754	0.52
755	0.53
756	0.57
757	0.6
758	0.61
759	0.67
760	0.7
761	0.72
762	0.79
763	0.82
764	0.8
765	0.72
766	0.65
767	0.58
768	0.56
769	0.48
770	0.41
771	0.33
772	0.29
773	0.27
774	0.23
775	0.19
776	0.11
777	0.09
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.06
784	0.05
785	0.05
786	0.05
787	0.06
788	0.07
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.09
793	0.1
794	0.17
795	0.16
796	0.16
797	0.18
798	0.19
799	0.2
800	0.21
801	0.2
802	0.14
803	0.14
804	0.15
805	0.13
806	0.14
807	0.13
808	0.11
809	0.11
810	0.1
811	0.11
812	0.11
813	0.11
814	0.09
815	0.08
816	0.08
817	0.11
818	0.17
819	0.22
820	0.21
821	0.2
822	0.2
823	0.25
824	0.27
825	0.27
826	0.21
827	0.17
828	0.19
829	0.2
830	0.2
831	0.17
832	0.15
833	0.17
834	0.25
835	0.3
836	0.34
837	0.36
838	0.4
839	0.41
840	0.42
841	0.43
842	0.4
843	0.38
844	0.36
845	0.38
846	0.39
847	0.39
848	0.37
849	0.34
850	0.29
851	0.29
852	0.3
853	0.29
854	0.25
855	0.26
856	0.25
857	0.26
858	0.27
859	0.21
860	0.16
861	0.12
862	0.11
863	0.09
864	0.08
865	0.07
866	0.06
867	0.07
868	0.08
869	0.08
870	0.08
871	0.11
872	0.12
873	0.13
874	0.15
875	0.17
876	0.16
877	0.17
878	0.17
879	0.15
880	0.15
881	0.17
882	0.17
883	0.15
884	0.19
885	0.2
886	0.23
887	0.3
888	0.31
889	0.33
890	0.41
891	0.47
892	0.52
893	0.61
894	0.68
895	0.64
896	0.69
897	0.7
898	0.68
899	0.73
900	0.71
901	0.7
902	0.69
903	0.76
904	0.79

A0A2C5YCW3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer