Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XJK9

Protein Details
Accession A0A2C5XJK9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
369-393LDNFTKPGKRTSKKSKAQTGLQQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-297RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 10, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MARSKWINKKTAQHFTLVHRPQNDPLIHDSDAPAMVLNPTQPKPGSSELRRPDALASQMGVDATSIRVNEGEAASYGVYFDDSEYDYMQHLRDLGQAGGQVVFVEATTGNKDKGKRSKTLAESLRDMDLKPKASDALDEEILPSKNLTRVTYEAQQNVPDSIRGFQPDMDPRLREVLEALDDDAYVEGEDDDFFQQLAKDGRELDDVEFEQTQFDEDEGWESDRTARPGDGHMEKIPQLVAAQTEKPQEGPSQDWLEDFEKFKRDQKSGKAPVAPSQSELQSTWTATTNGGRRKKRKGALTDASSFSMTSSSLVRTEQLRFLDARYERMYEKFNEDAEDDMESVSAVSTASSVAGPLRRDFDGAIDHFLDNFTKPGKRTSKKSKAQTGLQQLDEIRRDLGPARIRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.63
3 0.67
4 0.64
5 0.6
6 0.53
7 0.55
8 0.53
9 0.57
10 0.5
11 0.43
12 0.42
13 0.41
14 0.38
15 0.36
16 0.32
17 0.26
18 0.25
19 0.21
20 0.16
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.13
25 0.18
26 0.18
27 0.23
28 0.23
29 0.24
30 0.28
31 0.35
32 0.41
33 0.42
34 0.51
35 0.52
36 0.58
37 0.58
38 0.54
39 0.48
40 0.43
41 0.4
42 0.31
43 0.25
44 0.19
45 0.19
46 0.18
47 0.15
48 0.11
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.11
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.09
95 0.1
96 0.12
97 0.16
98 0.19
99 0.27
100 0.36
101 0.4
102 0.43
103 0.48
104 0.55
105 0.57
106 0.63
107 0.61
108 0.56
109 0.54
110 0.5
111 0.47
112 0.38
113 0.33
114 0.29
115 0.27
116 0.26
117 0.23
118 0.22
119 0.2
120 0.19
121 0.2
122 0.18
123 0.18
124 0.16
125 0.15
126 0.15
127 0.17
128 0.17
129 0.16
130 0.13
131 0.1
132 0.13
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.17
137 0.21
138 0.28
139 0.3
140 0.29
141 0.29
142 0.29
143 0.27
144 0.26
145 0.22
146 0.16
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.16
154 0.2
155 0.23
156 0.24
157 0.24
158 0.23
159 0.25
160 0.24
161 0.2
162 0.16
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.12
190 0.13
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.11
210 0.13
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.14
216 0.19
217 0.18
218 0.19
219 0.18
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.17
224 0.12
225 0.1
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.12
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.16
237 0.17
238 0.19
239 0.2
240 0.2
241 0.19
242 0.21
243 0.21
244 0.21
245 0.21
246 0.19
247 0.2
248 0.21
249 0.27
250 0.3
251 0.33
252 0.37
253 0.44
254 0.52
255 0.56
256 0.6
257 0.58
258 0.53
259 0.55
260 0.56
261 0.47
262 0.38
263 0.33
264 0.29
265 0.26
266 0.25
267 0.22
268 0.17
269 0.17
270 0.16
271 0.15
272 0.15
273 0.14
274 0.19
275 0.23
276 0.3
277 0.39
278 0.46
279 0.52
280 0.61
281 0.7
282 0.72
283 0.74
284 0.73
285 0.75
286 0.75
287 0.74
288 0.69
289 0.61
290 0.56
291 0.47
292 0.39
293 0.29
294 0.2
295 0.14
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.12
302 0.15
303 0.17
304 0.21
305 0.21
306 0.22
307 0.21
308 0.22
309 0.28
310 0.26
311 0.29
312 0.26
313 0.28
314 0.28
315 0.3
316 0.33
317 0.27
318 0.32
319 0.29
320 0.28
321 0.27
322 0.26
323 0.25
324 0.22
325 0.2
326 0.15
327 0.12
328 0.11
329 0.09
330 0.08
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.08
341 0.12
342 0.14
343 0.16
344 0.2
345 0.2
346 0.21
347 0.21
348 0.2
349 0.24
350 0.23
351 0.25
352 0.24
353 0.23
354 0.22
355 0.23
356 0.22
357 0.15
358 0.17
359 0.17
360 0.19
361 0.21
362 0.3
363 0.4
364 0.47
365 0.56
366 0.66
367 0.72
368 0.78
369 0.86
370 0.87
371 0.85
372 0.86
373 0.85
374 0.84
375 0.8
376 0.71
377 0.65
378 0.57
379 0.56
380 0.49
381 0.41
382 0.32
383 0.25
384 0.26
385 0.25
386 0.31
387 0.32