Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P935

Protein Details
Accession J3P935    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-302EDVAAKKRKARTAKNGDDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-293KKRKAR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPAKKRRTTRSSKAVVEEEPVAVKAPTPDETAVTDEPMNTDEPAKPSDEATAAIPEEPSAPAATGSRSEDPAPAAEASAEAEAEADTQSAAEKAADRMARFRALQERAKKSSDQNLKAATAESRRLATDPTQLTALHRRHAIASHKILKADVEDAGGDFERKRAWDWTVEESEQWDKRMKKKESARDNNAFQDFRQEAQKIYKRQLKNMPPDLERYASDKMAAINKAAAAGTLDIVETEDGELIAVDRDGSFYSTADSTSFANNRPDKAAIDRLVNDMKKAEDVAAKKRKARTAKNGDDDDVTYINDKNKQFNQKLSRFYNKYTAEIRESFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.72
3 0.63
4 0.57
5 0.48
6 0.39
7 0.31
8 0.26
9 0.2
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.15
14 0.16
15 0.18
16 0.19
17 0.19
18 0.21
19 0.25
20 0.23
21 0.23
22 0.21
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.17
27 0.13
28 0.14
29 0.15
30 0.17
31 0.19
32 0.2
33 0.19
34 0.19
35 0.2
36 0.19
37 0.17
38 0.16
39 0.17
40 0.15
41 0.15
42 0.14
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.1
52 0.12
53 0.15
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.19
60 0.19
61 0.15
62 0.13
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.05
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.12
83 0.14
84 0.14
85 0.17
86 0.2
87 0.22
88 0.21
89 0.24
90 0.27
91 0.31
92 0.38
93 0.44
94 0.49
95 0.5
96 0.52
97 0.52
98 0.48
99 0.51
100 0.54
101 0.49
102 0.46
103 0.44
104 0.42
105 0.4
106 0.37
107 0.3
108 0.23
109 0.22
110 0.18
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.18
115 0.16
116 0.21
117 0.19
118 0.19
119 0.19
120 0.18
121 0.2
122 0.27
123 0.27
124 0.22
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.26
129 0.29
130 0.27
131 0.32
132 0.36
133 0.37
134 0.36
135 0.35
136 0.31
137 0.27
138 0.21
139 0.15
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.15
154 0.18
155 0.22
156 0.24
157 0.24
158 0.22
159 0.22
160 0.25
161 0.21
162 0.2
163 0.22
164 0.22
165 0.29
166 0.39
167 0.41
168 0.45
169 0.53
170 0.61
171 0.66
172 0.73
173 0.74
174 0.7
175 0.7
176 0.66
177 0.61
178 0.52
179 0.4
180 0.37
181 0.3
182 0.25
183 0.26
184 0.22
185 0.2
186 0.28
187 0.35
188 0.31
189 0.38
190 0.45
191 0.43
192 0.49
193 0.57
194 0.57
195 0.6
196 0.65
197 0.63
198 0.56
199 0.58
200 0.54
201 0.46
202 0.39
203 0.33
204 0.27
205 0.22
206 0.21
207 0.17
208 0.17
209 0.19
210 0.19
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.1
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.14
248 0.16
249 0.17
250 0.26
251 0.28
252 0.3
253 0.32
254 0.32
255 0.29
256 0.32
257 0.37
258 0.31
259 0.32
260 0.32
261 0.33
262 0.39
263 0.37
264 0.33
265 0.27
266 0.25
267 0.22
268 0.22
269 0.2
270 0.18
271 0.22
272 0.32
273 0.4
274 0.44
275 0.49
276 0.55
277 0.61
278 0.65
279 0.71
280 0.71
281 0.73
282 0.78
283 0.81
284 0.78
285 0.72
286 0.64
287 0.55
288 0.47
289 0.37
290 0.28
291 0.21
292 0.2
293 0.22
294 0.26
295 0.27
296 0.32
297 0.39
298 0.49
299 0.52
300 0.59
301 0.66
302 0.66
303 0.73
304 0.74
305 0.77
306 0.71
307 0.71
308 0.7
309 0.63
310 0.61
311 0.58
312 0.55
313 0.51
314 0.48
315 0.48
316 0.44
317 0.44
318 0.39