Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YIP4

Protein Details
Accession A0A2C5YIP4    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
438-458ELKETVSKKRNKRLNSQEFDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9, cyto 7.5, mito 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR011015  LEM/LEM-like_dom_sf  
IPR018996  MSC  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MGDSDDYLEQGFDPRSVTVPRLRSILVTHNIDYPSTAKKPQLVQLVTDHVLPHAAKLRAQRAKAKRSSMGIVNAGSTQDVKAWSDHDLLPPPPSARRSQSPRKSSARGVALDAEPEPLAAPRSVKRTARSASRQLPREADEAPQAPKSTRRSLRSATPRIKVESEEDQSSTDQTQDSSDEESVFTNDNPFQSGTPPVPRMLTNRPQPASAQTVRRVSPLARHQEPPVNRATASRSLEGSLPRHTSPTWGHELEPGEEFTPDQQLELERAARQGELPIPRNVSPGQTRQRNVKSPLIVLLLALLSSYAAWYRQEKISVGYCGIGKPAKSLFSPEISVPNFALSWVQPQCETCPPHAYCFEDFSVSCESDFLLKPHPLSLGGLIPLPPSCEPDGEKARRVQAVANKAVEELRQRRADFECGARADGNGDQPISAAVSEEELKETVSKKRNKRLNSQEFDDLWASAIGDVKSRDEVVIQVDTTESVMQATERPIPPAFQQDSHQPLSLVFRSLAPSSVPSGSDWQDIDSQLDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.17
3 0.19
4 0.24
5 0.27
6 0.31
7 0.33
8 0.34
9 0.34
10 0.32
11 0.34
12 0.38
13 0.38
14 0.38
15 0.37
16 0.39
17 0.39
18 0.37
19 0.35
20 0.29
21 0.28
22 0.28
23 0.31
24 0.29
25 0.34
26 0.38
27 0.43
28 0.5
29 0.44
30 0.43
31 0.44
32 0.47
33 0.42
34 0.38
35 0.32
36 0.22
37 0.25
38 0.22
39 0.21
40 0.22
41 0.22
42 0.24
43 0.31
44 0.41
45 0.45
46 0.5
47 0.56
48 0.58
49 0.67
50 0.72
51 0.71
52 0.66
53 0.64
54 0.64
55 0.6
56 0.55
57 0.48
58 0.41
59 0.36
60 0.31
61 0.27
62 0.22
63 0.17
64 0.12
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.13
70 0.15
71 0.18
72 0.2
73 0.21
74 0.24
75 0.24
76 0.26
77 0.27
78 0.26
79 0.28
80 0.3
81 0.31
82 0.33
83 0.41
84 0.48
85 0.57
86 0.65
87 0.68
88 0.73
89 0.75
90 0.74
91 0.7
92 0.69
93 0.64
94 0.55
95 0.5
96 0.45
97 0.38
98 0.34
99 0.29
100 0.22
101 0.16
102 0.14
103 0.12
104 0.09
105 0.1
106 0.09
107 0.12
108 0.14
109 0.2
110 0.26
111 0.3
112 0.33
113 0.39
114 0.43
115 0.49
116 0.53
117 0.57
118 0.6
119 0.65
120 0.66
121 0.62
122 0.61
123 0.54
124 0.49
125 0.4
126 0.33
127 0.3
128 0.27
129 0.26
130 0.25
131 0.23
132 0.22
133 0.28
134 0.31
135 0.36
136 0.41
137 0.44
138 0.48
139 0.51
140 0.59
141 0.63
142 0.67
143 0.65
144 0.63
145 0.61
146 0.59
147 0.56
148 0.48
149 0.42
150 0.39
151 0.36
152 0.31
153 0.29
154 0.26
155 0.25
156 0.25
157 0.21
158 0.15
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.15
180 0.15
181 0.18
182 0.19
183 0.18
184 0.19
185 0.2
186 0.23
187 0.29
188 0.34
189 0.37
190 0.43
191 0.43
192 0.43
193 0.42
194 0.41
195 0.4
196 0.36
197 0.34
198 0.31
199 0.35
200 0.34
201 0.34
202 0.32
203 0.26
204 0.29
205 0.32
206 0.34
207 0.34
208 0.35
209 0.36
210 0.42
211 0.43
212 0.38
213 0.34
214 0.27
215 0.24
216 0.24
217 0.25
218 0.26
219 0.27
220 0.25
221 0.22
222 0.22
223 0.24
224 0.25
225 0.23
226 0.19
227 0.19
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.2
232 0.2
233 0.22
234 0.24
235 0.22
236 0.22
237 0.24
238 0.25
239 0.23
240 0.21
241 0.17
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.08
246 0.1
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.09
260 0.12
261 0.15
262 0.18
263 0.19
264 0.21
265 0.22
266 0.24
267 0.23
268 0.22
269 0.21
270 0.26
271 0.32
272 0.36
273 0.37
274 0.44
275 0.49
276 0.52
277 0.54
278 0.51
279 0.44
280 0.39
281 0.39
282 0.32
283 0.26
284 0.19
285 0.15
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.05
296 0.07
297 0.1
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.16
302 0.19
303 0.19
304 0.18
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.15
309 0.14
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.13
315 0.17
316 0.17
317 0.18
318 0.19
319 0.18
320 0.22
321 0.21
322 0.22
323 0.18
324 0.17
325 0.14
326 0.13
327 0.13
328 0.08
329 0.13
330 0.13
331 0.14
332 0.14
333 0.15
334 0.18
335 0.24
336 0.26
337 0.22
338 0.29
339 0.3
340 0.33
341 0.34
342 0.35
343 0.29
344 0.31
345 0.29
346 0.23
347 0.21
348 0.21
349 0.21
350 0.18
351 0.16
352 0.13
353 0.12
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.16
359 0.17
360 0.18
361 0.19
362 0.16
363 0.16
364 0.16
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.12
372 0.11
373 0.12
374 0.13
375 0.14
376 0.16
377 0.22
378 0.32
379 0.34
380 0.37
381 0.38
382 0.41
383 0.41
384 0.4
385 0.38
386 0.36
387 0.4
388 0.41
389 0.38
390 0.34
391 0.33
392 0.33
393 0.3
394 0.31
395 0.28
396 0.3
397 0.35
398 0.35
399 0.38
400 0.4
401 0.43
402 0.38
403 0.37
404 0.36
405 0.31
406 0.32
407 0.29
408 0.26
409 0.23
410 0.22
411 0.21
412 0.16
413 0.15
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.12
418 0.1
419 0.07
420 0.05
421 0.07
422 0.09
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.12
428 0.15
429 0.22
430 0.3
431 0.38
432 0.47
433 0.56
434 0.64
435 0.69
436 0.77
437 0.8
438 0.82
439 0.8
440 0.76
441 0.74
442 0.66
443 0.63
444 0.54
445 0.42
446 0.32
447 0.25
448 0.19
449 0.13
450 0.15
451 0.12
452 0.14
453 0.15
454 0.15
455 0.17
456 0.17
457 0.16
458 0.14
459 0.15
460 0.15
461 0.17
462 0.15
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.13
468 0.09
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.1
473 0.12
474 0.19
475 0.2
476 0.23
477 0.24
478 0.26
479 0.28
480 0.35
481 0.36
482 0.31
483 0.33
484 0.38
485 0.44
486 0.45
487 0.43
488 0.34
489 0.32
490 0.36
491 0.35
492 0.29
493 0.23
494 0.22
495 0.24
496 0.25
497 0.25
498 0.19
499 0.19
500 0.2
501 0.22
502 0.21
503 0.19
504 0.23
505 0.25
506 0.27
507 0.25
508 0.24
509 0.25
510 0.25