Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5X985

Protein Details
Accession A0A2C5X985    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-248AGTGGKTKRERERKVKQMIDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-112GARVRGGRGSRRPREH
234-241TKRERERK
257-297RTRGGSRGGSRGTRGGRGGERGGGDRGGDRGRGSSFRGGRG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSHVASQNRFAYLGNDSDGEEKPVVPVKTVDKSTSRTTKRNVEPQAPQGPARGTGGNRRNLPRGNEGAFRDRGAGSDRNHGRSTEEVPRDVPRGGYGARVRGGRGSRRPREHDDRHPSRTGGHGGSDKQAAHSWGATEGDAELKDEEAGEAIAQTERKDALAEDGAGEEAAEAEDKSMSYQDYLAQQAEKKLALDSGFKVREANEGSKLDKKWANAKALEKEEEEFIAGTGGKTKRERERKVKQMIDFDPRFVEPERTRGGSRGGSRGTRGGRGGERGGGDRGGDRGRGSSFRGGRGGRDNAAASLNPNDESAFPTLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.17
4 0.2
5 0.2
6 0.21
7 0.19
8 0.17
9 0.18
10 0.24
11 0.23
12 0.21
13 0.24
14 0.26
15 0.33
16 0.35
17 0.37
18 0.35
19 0.39
20 0.47
21 0.53
22 0.54
23 0.54
24 0.58
25 0.64
26 0.68
27 0.74
28 0.72
29 0.69
30 0.69
31 0.7
32 0.71
33 0.63
34 0.55
35 0.49
36 0.43
37 0.37
38 0.34
39 0.29
40 0.23
41 0.31
42 0.37
43 0.41
44 0.46
45 0.48
46 0.52
47 0.54
48 0.56
49 0.53
50 0.52
51 0.49
52 0.48
53 0.48
54 0.48
55 0.44
56 0.39
57 0.34
58 0.28
59 0.26
60 0.25
61 0.27
62 0.23
63 0.31
64 0.35
65 0.37
66 0.39
67 0.38
68 0.35
69 0.32
70 0.36
71 0.35
72 0.34
73 0.3
74 0.31
75 0.34
76 0.34
77 0.31
78 0.26
79 0.17
80 0.17
81 0.16
82 0.21
83 0.2
84 0.21
85 0.23
86 0.24
87 0.23
88 0.26
89 0.3
90 0.31
91 0.39
92 0.46
93 0.52
94 0.59
95 0.65
96 0.69
97 0.74
98 0.74
99 0.75
100 0.76
101 0.74
102 0.72
103 0.68
104 0.6
105 0.51
106 0.47
107 0.4
108 0.3
109 0.25
110 0.22
111 0.21
112 0.22
113 0.23
114 0.2
115 0.17
116 0.18
117 0.16
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.07
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.13
177 0.11
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.19
184 0.19
185 0.19
186 0.19
187 0.18
188 0.22
189 0.24
190 0.24
191 0.22
192 0.23
193 0.26
194 0.31
195 0.31
196 0.31
197 0.3
198 0.3
199 0.33
200 0.37
201 0.4
202 0.39
203 0.44
204 0.45
205 0.47
206 0.47
207 0.4
208 0.35
209 0.3
210 0.26
211 0.21
212 0.14
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.13
218 0.14
219 0.18
220 0.21
221 0.28
222 0.37
223 0.47
224 0.57
225 0.61
226 0.7
227 0.75
228 0.82
229 0.83
230 0.78
231 0.76
232 0.72
233 0.72
234 0.62
235 0.53
236 0.46
237 0.39
238 0.37
239 0.3
240 0.33
241 0.24
242 0.3
243 0.33
244 0.33
245 0.34
246 0.33
247 0.36
248 0.34
249 0.36
250 0.37
251 0.37
252 0.36
253 0.37
254 0.42
255 0.4
256 0.37
257 0.35
258 0.34
259 0.33
260 0.35
261 0.34
262 0.31
263 0.3
264 0.29
265 0.29
266 0.24
267 0.21
268 0.18
269 0.2
270 0.19
271 0.18
272 0.16
273 0.17
274 0.2
275 0.22
276 0.25
277 0.3
278 0.31
279 0.34
280 0.4
281 0.38
282 0.4
283 0.45
284 0.46
285 0.39
286 0.39
287 0.36
288 0.31
289 0.32
290 0.28
291 0.22
292 0.22
293 0.22
294 0.19
295 0.19
296 0.18
297 0.16
298 0.19
299 0.2
300 0.16