Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2C5Y6N6

Protein Details
Accession A0A2C5Y6N6    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-115ADGDAPKKPREGRREKKRRDHDQDIPMDQBasic
121-141AAKMPRRSRRAPEGERRRAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-105KATKRKRADGDAPKKPREGRREKKRR
123-145KMPRRSRRAPEGERRRAKANTPP
155-182PEERRRRAIDRALDAAIKKPGGGKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDMGPPASPAADELGLGDEPVDDGQQGEYEDGVAAADSDRESDMLSEIDENQFEDYDPETANIEDRPVEIDEDIARTLKATKRKRADGDAPKKPREGRREKKRRDHDQDIPMDQDVEAEAAKMPRRSRRAPEGERRRAKANTPPEQEKEEDLSPEERRRRAIDRALDAAIKKPGGGKRRRKDEIDLEDEIDEQLANLKVQMERACQADNTARESGQPALHKLKLLPDVTGILNRNNVQHAVLDPDTNFLQHVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFMALTRLNIEKEALLSSGIGKVVLFYTRSRKPEPVIKRMAERLLGEWSRPILKRTDDYKKRHVETREFDHQAAKMAQRQKSQLNLTQRPVQSARDAFLAPQGGNNQARMASLPSSYTIAPKSTFDGSRSQDHRPLGASGMEAFRRMTQKTKKRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.12
4 0.12
5 0.11
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.08
10 0.05
11 0.06
12 0.07
13 0.08
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.07
20 0.07
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.11
36 0.13
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.13
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.14
61 0.14
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.16
66 0.19
67 0.28
68 0.35
69 0.44
70 0.53
71 0.61
72 0.66
73 0.7
74 0.75
75 0.77
76 0.78
77 0.79
78 0.79
79 0.74
80 0.73
81 0.72
82 0.7
83 0.7
84 0.71
85 0.71
86 0.74
87 0.82
88 0.87
89 0.91
90 0.93
91 0.93
92 0.92
93 0.9
94 0.88
95 0.86
96 0.82
97 0.73
98 0.65
99 0.54
100 0.44
101 0.35
102 0.26
103 0.16
104 0.1
105 0.08
106 0.06
107 0.07
108 0.09
109 0.12
110 0.16
111 0.2
112 0.27
113 0.34
114 0.4
115 0.46
116 0.54
117 0.61
118 0.67
119 0.74
120 0.77
121 0.81
122 0.83
123 0.79
124 0.74
125 0.66
126 0.61
127 0.59
128 0.57
129 0.56
130 0.55
131 0.58
132 0.55
133 0.56
134 0.53
135 0.47
136 0.4
137 0.32
138 0.26
139 0.22
140 0.23
141 0.23
142 0.3
143 0.33
144 0.3
145 0.32
146 0.35
147 0.38
148 0.41
149 0.45
150 0.43
151 0.42
152 0.43
153 0.41
154 0.39
155 0.35
156 0.3
157 0.25
158 0.18
159 0.15
160 0.17
161 0.2
162 0.28
163 0.37
164 0.45
165 0.52
166 0.62
167 0.67
168 0.65
169 0.67
170 0.67
171 0.64
172 0.59
173 0.52
174 0.43
175 0.38
176 0.35
177 0.29
178 0.19
179 0.11
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.12
194 0.14
195 0.16
196 0.16
197 0.18
198 0.17
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.19
210 0.21
211 0.23
212 0.23
213 0.2
214 0.16
215 0.18
216 0.17
217 0.2
218 0.17
219 0.13
220 0.15
221 0.15
222 0.16
223 0.15
224 0.15
225 0.12
226 0.11
227 0.1
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.16
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.09
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.18
288 0.24
289 0.29
290 0.32
291 0.35
292 0.38
293 0.46
294 0.52
295 0.54
296 0.56
297 0.54
298 0.55
299 0.56
300 0.54
301 0.47
302 0.4
303 0.32
304 0.32
305 0.3
306 0.26
307 0.23
308 0.22
309 0.26
310 0.26
311 0.26
312 0.22
313 0.25
314 0.32
315 0.38
316 0.47
317 0.51
318 0.57
319 0.65
320 0.7
321 0.7
322 0.71
323 0.71
324 0.69
325 0.67
326 0.68
327 0.68
328 0.62
329 0.59
330 0.55
331 0.48
332 0.44
333 0.4
334 0.34
335 0.32
336 0.36
337 0.4
338 0.42
339 0.46
340 0.46
341 0.5
342 0.53
343 0.52
344 0.55
345 0.57
346 0.57
347 0.61
348 0.57
349 0.56
350 0.52
351 0.48
352 0.45
353 0.4
354 0.36
355 0.31
356 0.3
357 0.24
358 0.26
359 0.26
360 0.19
361 0.2
362 0.2
363 0.24
364 0.25
365 0.25
366 0.22
367 0.2
368 0.2
369 0.19
370 0.2
371 0.15
372 0.14
373 0.14
374 0.15
375 0.17
376 0.17
377 0.19
378 0.18
379 0.2
380 0.2
381 0.21
382 0.23
383 0.27
384 0.29
385 0.27
386 0.33
387 0.34
388 0.43
389 0.45
390 0.48
391 0.48
392 0.48
393 0.48
394 0.42
395 0.4
396 0.33
397 0.3
398 0.25
399 0.21
400 0.25
401 0.23
402 0.22
403 0.21
404 0.24
405 0.27
406 0.29
407 0.36
408 0.42