Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XAS7

Protein Details
Accession A0A2C5XAS7    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-82IETEKLKKRRDEKSSAARKAREKBasic
279-308YLTPSEIKVKKPKKKKKNTRRKQVDDDEDSBasic
353-377MIQRRNALKKRRKIKPQDIAKQLKEHydrophilic
606-625GKGKTEKKLKQIEDEKRREABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-83KLKKRRDEKSSAARKAREKA
286-300KVKKPKKKKKNTRRK
357-367RNALKKRRKIK
605-614SGKGKTEKKL
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 11.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAATIHETNRIRLSLGMKPLPVPGAQQAESSHSSDSDGEQASTLETRQAKAYDNYNKHIETEKLKKRRDEKSSAARKAREKAQRFALIQGKGLADTQDGQDDAKSWLMGLKKRQKKVAEARKLEEELAAAEAAAAQNIQYTSKDLAGLKVAHDTSAFLEGGEQILTLKDATIDENEEQGDELENINLREEEKLQNRLDLKKMRPGYNPNDDNQDEQRGILSQYDEEINGKKTTRFTLDSDGAIAEMSDVMGQSAPKTNKLQNINLDDIVGNMPISSDYLTPSEIKVKKPKKKKKNTRRKQVDDDEDSLFPVQPVNKATADAMDIDSKDDMASRKRKAEADDLDDDDLQASLMIQRRNALKKRRKIKPQDIAKQLKEQVDEPDHDTGAEDGGLIIGDTSEFVAGLSKHIDQDEEIAAKKRTMEREAATRGSPDDEDAWMEDADGYEVGGAHKPEPPEPGANVPEDGFDDEKAVGQGMGAALSLLRERGLIEESQGNDRHSNFRQQQEFLLRKKELEEELEAKARQQRERDRANGKLDRMSRADREDYARQQNAWRDQQLSRRMADLISAHYRPSVALRYTDEHGRHLGQKEAFKHLSHQFHGKGSGKGKTEKKLKQIEDEKRREAQSLFDASQGGGMNAATTQQLKKRKEAGVRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.38
4 0.38
5 0.35
6 0.35
7 0.37
8 0.35
9 0.31
10 0.27
11 0.25
12 0.27
13 0.27
14 0.28
15 0.27
16 0.3
17 0.33
18 0.32
19 0.26
20 0.2
21 0.21
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.19
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.17
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.18
35 0.21
36 0.23
37 0.26
38 0.29
39 0.38
40 0.42
41 0.46
42 0.5
43 0.51
44 0.5
45 0.48
46 0.49
47 0.45
48 0.43
49 0.48
50 0.53
51 0.58
52 0.64
53 0.7
54 0.74
55 0.79
56 0.8
57 0.78
58 0.77
59 0.79
60 0.83
61 0.84
62 0.83
63 0.8
64 0.78
65 0.76
66 0.75
67 0.75
68 0.7
69 0.67
70 0.68
71 0.69
72 0.64
73 0.64
74 0.62
75 0.53
76 0.48
77 0.44
78 0.35
79 0.28
80 0.27
81 0.2
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.1
94 0.13
95 0.17
96 0.22
97 0.31
98 0.4
99 0.47
100 0.53
101 0.61
102 0.62
103 0.67
104 0.74
105 0.75
106 0.75
107 0.72
108 0.71
109 0.7
110 0.67
111 0.57
112 0.46
113 0.36
114 0.26
115 0.2
116 0.16
117 0.09
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.03
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.1
129 0.12
130 0.13
131 0.16
132 0.14
133 0.15
134 0.19
135 0.19
136 0.17
137 0.2
138 0.19
139 0.17
140 0.16
141 0.16
142 0.13
143 0.15
144 0.14
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.12
178 0.18
179 0.22
180 0.29
181 0.28
182 0.33
183 0.36
184 0.38
185 0.43
186 0.44
187 0.42
188 0.44
189 0.49
190 0.49
191 0.52
192 0.56
193 0.56
194 0.59
195 0.59
196 0.51
197 0.53
198 0.49
199 0.46
200 0.41
201 0.37
202 0.27
203 0.24
204 0.23
205 0.17
206 0.16
207 0.14
208 0.12
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.12
215 0.13
216 0.14
217 0.15
218 0.16
219 0.17
220 0.2
221 0.23
222 0.24
223 0.24
224 0.29
225 0.3
226 0.28
227 0.27
228 0.24
229 0.19
230 0.16
231 0.13
232 0.06
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.11
242 0.12
243 0.15
244 0.19
245 0.22
246 0.29
247 0.33
248 0.37
249 0.37
250 0.41
251 0.4
252 0.36
253 0.33
254 0.27
255 0.23
256 0.19
257 0.12
258 0.07
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.17
271 0.19
272 0.23
273 0.32
274 0.42
275 0.49
276 0.6
277 0.7
278 0.73
279 0.82
280 0.89
281 0.9
282 0.92
283 0.94
284 0.95
285 0.95
286 0.92
287 0.9
288 0.88
289 0.84
290 0.78
291 0.7
292 0.61
293 0.49
294 0.42
295 0.32
296 0.23
297 0.15
298 0.11
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.12
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.09
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.14
319 0.2
320 0.22
321 0.26
322 0.28
323 0.31
324 0.33
325 0.39
326 0.36
327 0.35
328 0.36
329 0.33
330 0.31
331 0.29
332 0.26
333 0.18
334 0.14
335 0.08
336 0.05
337 0.04
338 0.05
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.13
343 0.18
344 0.26
345 0.33
346 0.41
347 0.47
348 0.55
349 0.65
350 0.71
351 0.77
352 0.8
353 0.83
354 0.83
355 0.84
356 0.85
357 0.84
358 0.83
359 0.74
360 0.7
361 0.63
362 0.56
363 0.46
364 0.38
365 0.33
366 0.29
367 0.28
368 0.25
369 0.22
370 0.2
371 0.18
372 0.17
373 0.12
374 0.1
375 0.08
376 0.05
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.02
382 0.02
383 0.02
384 0.02
385 0.02
386 0.02
387 0.02
388 0.03
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.08
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.14
403 0.15
404 0.15
405 0.18
406 0.2
407 0.22
408 0.24
409 0.27
410 0.27
411 0.33
412 0.37
413 0.36
414 0.32
415 0.29
416 0.27
417 0.24
418 0.22
419 0.15
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.12
425 0.1
426 0.1
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.05
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.11
439 0.12
440 0.14
441 0.16
442 0.18
443 0.19
444 0.2
445 0.24
446 0.23
447 0.23
448 0.22
449 0.19
450 0.17
451 0.15
452 0.16
453 0.12
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.07
475 0.09
476 0.08
477 0.1
478 0.14
479 0.15
480 0.2
481 0.22
482 0.23
483 0.23
484 0.25
485 0.3
486 0.28
487 0.37
488 0.38
489 0.44
490 0.47
491 0.46
492 0.49
493 0.53
494 0.57
495 0.51
496 0.53
497 0.46
498 0.42
499 0.43
500 0.42
501 0.34
502 0.31
503 0.32
504 0.27
505 0.29
506 0.33
507 0.31
508 0.29
509 0.32
510 0.33
511 0.33
512 0.39
513 0.46
514 0.5
515 0.58
516 0.64
517 0.65
518 0.67
519 0.72
520 0.7
521 0.62
522 0.61
523 0.56
524 0.53
525 0.51
526 0.48
527 0.43
528 0.43
529 0.43
530 0.39
531 0.42
532 0.44
533 0.47
534 0.51
535 0.49
536 0.46
537 0.48
538 0.53
539 0.55
540 0.55
541 0.51
542 0.46
543 0.48
544 0.55
545 0.59
546 0.55
547 0.47
548 0.42
549 0.39
550 0.35
551 0.33
552 0.26
553 0.23
554 0.26
555 0.25
556 0.24
557 0.24
558 0.24
559 0.21
560 0.24
561 0.24
562 0.19
563 0.22
564 0.26
565 0.29
566 0.32
567 0.39
568 0.36
569 0.33
570 0.34
571 0.34
572 0.36
573 0.35
574 0.39
575 0.37
576 0.42
577 0.42
578 0.48
579 0.47
580 0.41
581 0.46
582 0.47
583 0.49
584 0.46
585 0.51
586 0.45
587 0.46
588 0.53
589 0.5
590 0.49
591 0.47
592 0.5
593 0.47
594 0.53
595 0.57
596 0.58
597 0.64
598 0.65
599 0.69
600 0.73
601 0.72
602 0.74
603 0.77
604 0.79
605 0.8
606 0.81
607 0.77
608 0.74
609 0.72
610 0.65
611 0.55
612 0.5
613 0.46
614 0.45
615 0.39
616 0.34
617 0.33
618 0.29
619 0.31
620 0.26
621 0.19
622 0.12
623 0.11
624 0.1
625 0.09
626 0.1
627 0.08
628 0.11
629 0.16
630 0.23
631 0.32
632 0.36
633 0.44
634 0.52
635 0.58
636 0.65