Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YCT0

Protein Details
Accession A0A2C5YCT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
685-704NTSPASNKRRRPSAVKEEDIHydrophilic
718-740NGIQNRPNKPPTPRMPKRHKAGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
726-740KPPTPRMPKRHKAGP
Subcellular Location(s) nucl 12cyto_nucl 12, cyto 10, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MMAASMGPNFTGHAAGMAHQGVAGHPMGPGMPPNAAQQGVPGAGMHQQFGGHMAVPGPGGQVNPALMGAMPPGASPHALQHLTAAQQHLYQQQQHQHPLSAHLASNHSAIAAMRQQQLLQQQQSQARQALLAQQAVHANMGGAMPMGMPLNAQHFQQLRQPGRLAPNGHQQAQAIMAQQLALQQQQQHVQQQQAAQQAAHNQQMAGGPNHGQHMSMGASGMMGMQQQPQMGGGGQGQMGGQQQGMQQGQGQAQSHLHGQSQQHAQQGQQQSQHGSQGGTPGPGGQQTPSQTPAPTPAQPNQLQQAPGQAHHQALHHGPPHMSAAATQQLMANTLFQQQQQQQQHRREGMKGQCMLKLLQFGEHLSAFPGHKGKDDISYWNSFVERFFSQNAVFRHSLHISDAEDTTDKQYEISFAAIARYFHTHFTSGVKSMQLVADKGLMDRAMPGDCHCIETSKASLVYWFETGTHLVATGTLRAQFDAEQKIELFEFLTTGHEEYISRKQVIELAKPVHVWFKDWHKVNSGQEVKQSPEMSKKAKGKHFKSPQTQPPDVLADLPDSAVNSKGVTAAVHQFLEIVEVLGQMNPLFAFCHSYPGHSPYTTMDQYVSTYINGAPPAVNGQVLPPPAAAPPAFAAFAMGASPAAAHVNLPASPHVAGSPAPGQMQAPAMQMQPSQQGTNSSGPSANTSPASNKRRRPSAVKEEDISGAPTPVGSVAQVNGIQNRPNKPPTPRMPKRHKAGP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.14
4 0.13
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.1
9 0.13
10 0.12
11 0.09
12 0.08
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.12
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.16
21 0.19
22 0.19
23 0.18
24 0.17
25 0.19
26 0.18
27 0.16
28 0.13
29 0.11
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.15
37 0.15
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.12
64 0.18
65 0.19
66 0.19
67 0.2
68 0.22
69 0.24
70 0.25
71 0.24
72 0.18
73 0.19
74 0.22
75 0.25
76 0.26
77 0.29
78 0.32
79 0.39
80 0.44
81 0.51
82 0.5
83 0.49
84 0.45
85 0.46
86 0.44
87 0.38
88 0.33
89 0.28
90 0.28
91 0.25
92 0.25
93 0.2
94 0.15
95 0.14
96 0.12
97 0.13
98 0.15
99 0.19
100 0.21
101 0.21
102 0.22
103 0.25
104 0.32
105 0.36
106 0.35
107 0.34
108 0.37
109 0.43
110 0.46
111 0.47
112 0.41
113 0.34
114 0.31
115 0.28
116 0.29
117 0.26
118 0.24
119 0.2
120 0.2
121 0.21
122 0.21
123 0.2
124 0.14
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.07
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.16
141 0.17
142 0.19
143 0.25
144 0.34
145 0.32
146 0.35
147 0.37
148 0.37
149 0.41
150 0.45
151 0.43
152 0.38
153 0.45
154 0.45
155 0.46
156 0.42
157 0.36
158 0.31
159 0.29
160 0.26
161 0.17
162 0.13
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.12
171 0.15
172 0.19
173 0.22
174 0.26
175 0.28
176 0.29
177 0.3
178 0.3
179 0.33
180 0.33
181 0.31
182 0.26
183 0.24
184 0.28
185 0.29
186 0.29
187 0.24
188 0.19
189 0.19
190 0.22
191 0.23
192 0.18
193 0.16
194 0.14
195 0.15
196 0.18
197 0.16
198 0.14
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.12
234 0.14
235 0.15
236 0.17
237 0.17
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.16
242 0.15
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.2
247 0.24
248 0.26
249 0.28
250 0.27
251 0.27
252 0.3
253 0.34
254 0.32
255 0.3
256 0.29
257 0.28
258 0.29
259 0.3
260 0.24
261 0.2
262 0.17
263 0.17
264 0.16
265 0.14
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.08
272 0.1
273 0.12
274 0.14
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.16
279 0.21
280 0.21
281 0.22
282 0.24
283 0.25
284 0.31
285 0.33
286 0.35
287 0.33
288 0.32
289 0.29
290 0.26
291 0.28
292 0.22
293 0.21
294 0.21
295 0.19
296 0.18
297 0.18
298 0.18
299 0.14
300 0.14
301 0.18
302 0.17
303 0.17
304 0.16
305 0.16
306 0.17
307 0.15
308 0.13
309 0.1
310 0.1
311 0.12
312 0.12
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.07
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.15
324 0.16
325 0.25
326 0.31
327 0.39
328 0.45
329 0.5
330 0.55
331 0.56
332 0.55
333 0.49
334 0.49
335 0.46
336 0.45
337 0.43
338 0.39
339 0.35
340 0.34
341 0.32
342 0.26
343 0.23
344 0.16
345 0.14
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.08
352 0.1
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.1
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.15
361 0.16
362 0.19
363 0.19
364 0.21
365 0.2
366 0.2
367 0.19
368 0.15
369 0.14
370 0.14
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.18
377 0.19
378 0.2
379 0.2
380 0.19
381 0.22
382 0.21
383 0.21
384 0.16
385 0.17
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.07
401 0.06
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.13
412 0.16
413 0.17
414 0.15
415 0.16
416 0.14
417 0.13
418 0.13
419 0.14
420 0.12
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.11
435 0.12
436 0.14
437 0.14
438 0.14
439 0.14
440 0.16
441 0.16
442 0.13
443 0.13
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.13
448 0.11
449 0.1
450 0.09
451 0.1
452 0.1
453 0.09
454 0.08
455 0.07
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.1
465 0.11
466 0.14
467 0.17
468 0.17
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.16
473 0.14
474 0.11
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.08
484 0.12
485 0.19
486 0.21
487 0.21
488 0.2
489 0.21
490 0.25
491 0.28
492 0.28
493 0.26
494 0.25
495 0.26
496 0.26
497 0.26
498 0.27
499 0.24
500 0.23
501 0.22
502 0.28
503 0.34
504 0.38
505 0.39
506 0.38
507 0.44
508 0.44
509 0.5
510 0.46
511 0.4
512 0.42
513 0.42
514 0.4
515 0.39
516 0.38
517 0.3
518 0.33
519 0.36
520 0.35
521 0.4
522 0.45
523 0.48
524 0.56
525 0.64
526 0.61
527 0.67
528 0.73
529 0.75
530 0.77
531 0.78
532 0.79
533 0.77
534 0.74
535 0.65
536 0.57
537 0.51
538 0.42
539 0.33
540 0.25
541 0.17
542 0.15
543 0.14
544 0.11
545 0.08
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.07
550 0.07
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.09
555 0.13
556 0.14
557 0.14
558 0.14
559 0.13
560 0.13
561 0.14
562 0.12
563 0.08
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.05
572 0.05
573 0.06
574 0.06
575 0.12
576 0.12
577 0.19
578 0.19
579 0.23
580 0.26
581 0.29
582 0.33
583 0.27
584 0.27
585 0.23
586 0.31
587 0.28
588 0.26
589 0.22
590 0.19
591 0.2
592 0.21
593 0.19
594 0.11
595 0.12
596 0.12
597 0.14
598 0.13
599 0.12
600 0.1
601 0.1
602 0.13
603 0.12
604 0.12
605 0.09
606 0.11
607 0.14
608 0.14
609 0.15
610 0.12
611 0.12
612 0.12
613 0.15
614 0.13
615 0.11
616 0.12
617 0.13
618 0.13
619 0.12
620 0.12
621 0.09
622 0.1
623 0.08
624 0.07
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.05
631 0.05
632 0.07
633 0.09
634 0.09
635 0.11
636 0.11
637 0.13
638 0.13
639 0.13
640 0.12
641 0.11
642 0.11
643 0.13
644 0.15
645 0.15
646 0.15
647 0.15
648 0.15
649 0.15
650 0.18
651 0.16
652 0.15
653 0.16
654 0.16
655 0.17
656 0.17
657 0.18
658 0.22
659 0.22
660 0.22
661 0.21
662 0.24
663 0.27
664 0.32
665 0.31
666 0.27
667 0.26
668 0.26
669 0.3
670 0.28
671 0.27
672 0.22
673 0.23
674 0.29
675 0.37
676 0.46
677 0.5
678 0.57
679 0.63
680 0.71
681 0.76
682 0.77
683 0.78
684 0.8
685 0.81
686 0.78
687 0.71
688 0.64
689 0.6
690 0.52
691 0.44
692 0.33
693 0.24
694 0.18
695 0.15
696 0.12
697 0.11
698 0.1
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.12
703 0.14
704 0.17
705 0.21
706 0.23
707 0.28
708 0.33
709 0.38
710 0.43
711 0.48
712 0.53
713 0.56
714 0.64
715 0.69
716 0.74
717 0.79
718 0.82
719 0.86
720 0.88