Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YJW8

Protein Details
Accession A0A2C5YJW8    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-164GGLPVEKKERKKRAHDPNAPKRPLTBasic
292-314DGDSKTPKKSSGRKRKTGTPAIEHydrophilic
318-357QEATPASPDKKRRRASTKAADAPAKEESKKSSRKKQKATSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-160KKERKKRAHDPNAPK
298-307PKKSSGRKRK
325-355PDKKRRRASTKAADAPAKEESKKSSRKKQKA
Subcellular Location(s) mito 10.5, cyto_mito 9.166, nucl 9, cyto_nucl 8.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPRPKKVVDDKAKVPAVTAPVPAMATMVPPPSSTAVVPVQQQQPMPIAPPPGAAPTAPAPVTASRLVDSESFLRVRDSAVGRLNTIGELLRSFTADYLRQTNLLLGEPGPEGTHAELLQPFSHFENAAAQLMLPTTDVGGGLPVEKKERKKRAHDPNAPKRPLTPYFLYMQYARTIISNDLGQDVPKGAVQEEGQRRWANMDAKEKQAWNGAYQYNLSLYNARTHAYKAGNPLAKDMTDDEATEYAQRHGLGTAADSEKLGLEGAANVNEAIAEQLEEQPQPQVPVPPQGVDGDSKTPKKSSGRKRKTGTPAIEAVEQEATPASPDKKRRRASTKAADAPAKEESKKSSRKKQKATS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.48
3 0.43
4 0.37
5 0.32
6 0.24
7 0.21
8 0.21
9 0.2
10 0.16
11 0.11
12 0.1
13 0.11
14 0.13
15 0.12
16 0.12
17 0.14
18 0.16
19 0.17
20 0.16
21 0.18
22 0.19
23 0.21
24 0.23
25 0.28
26 0.3
27 0.31
28 0.31
29 0.29
30 0.29
31 0.27
32 0.26
33 0.22
34 0.2
35 0.18
36 0.19
37 0.18
38 0.17
39 0.17
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.21
49 0.19
50 0.18
51 0.15
52 0.16
53 0.17
54 0.15
55 0.17
56 0.15
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.19
64 0.19
65 0.21
66 0.27
67 0.27
68 0.26
69 0.27
70 0.26
71 0.2
72 0.19
73 0.14
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.12
82 0.13
83 0.15
84 0.17
85 0.18
86 0.18
87 0.18
88 0.18
89 0.16
90 0.15
91 0.13
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.07
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.06
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.07
131 0.12
132 0.16
133 0.24
134 0.34
135 0.44
136 0.51
137 0.59
138 0.68
139 0.75
140 0.82
141 0.84
142 0.85
143 0.87
144 0.89
145 0.82
146 0.72
147 0.62
148 0.58
149 0.5
150 0.44
151 0.36
152 0.27
153 0.28
154 0.29
155 0.28
156 0.23
157 0.2
158 0.16
159 0.14
160 0.12
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.15
179 0.2
180 0.21
181 0.24
182 0.24
183 0.24
184 0.24
185 0.29
186 0.25
187 0.26
188 0.33
189 0.32
190 0.35
191 0.38
192 0.36
193 0.33
194 0.33
195 0.29
196 0.21
197 0.23
198 0.2
199 0.19
200 0.19
201 0.18
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.11
206 0.11
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.15
212 0.2
213 0.2
214 0.21
215 0.22
216 0.29
217 0.31
218 0.31
219 0.32
220 0.28
221 0.25
222 0.24
223 0.21
224 0.17
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.12
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.09
239 0.09
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.05
249 0.04
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.07
263 0.09
264 0.1
265 0.1
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.15
270 0.17
271 0.17
272 0.25
273 0.26
274 0.24
275 0.25
276 0.24
277 0.24
278 0.21
279 0.22
280 0.22
281 0.27
282 0.3
283 0.31
284 0.32
285 0.36
286 0.43
287 0.51
288 0.56
289 0.61
290 0.68
291 0.76
292 0.8
293 0.84
294 0.85
295 0.85
296 0.79
297 0.74
298 0.68
299 0.61
300 0.57
301 0.47
302 0.39
303 0.31
304 0.25
305 0.19
306 0.15
307 0.12
308 0.1
309 0.15
310 0.17
311 0.23
312 0.33
313 0.44
314 0.54
315 0.62
316 0.71
317 0.76
318 0.81
319 0.85
320 0.86
321 0.86
322 0.84
323 0.82
324 0.77
325 0.69
326 0.63
327 0.59
328 0.53
329 0.44
330 0.39
331 0.4
332 0.45
333 0.54
334 0.6
335 0.64
336 0.7
337 0.79