Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XTT1

Protein Details
Accession A0A2C5XTT1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-81QQQQELQQRQRQQQQHQQKGEEEQSQRRRRQEPQQKQQAEPQQHydrophilic
936-962EELGGLLSNKKKRKRRKGVGNLVRDCAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
945-953KKKRKRRKG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001610  PAC  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013655  PAS_fold_3  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF08447  PAS_3  
PF13426  PAS_9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50112  PAS  
CDD cd00130  PAS  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MESYYPQQQLPQEPQHQFNSQQPQEHQQQQQQQQQQQQQQQQELQQRQRQQQQHQQKGEEEQSQRRRRQEPQQKQQAEPQQQQASISDAFGVNNRLPAQSQAAASQSTTDRPMMAGDTLDDIIRNNQSEIQRRRSMPQATFGNPTTTTQAQSPRRVSSIGAADMMSFGSHNADIGSYQFGPAANSGLSNINTTGMDMTDQVGSYMTEAGDYSAISPDLMGSMIPASFANMDMGHMSNDSSTMSMFATPAAASSSTASGAGSTPIGNGFSPSQIPSVNTEYPLGATTDAGSMETTPGNVSGAIATVDDQDDDMMALQPAQFSSMRTTPNSNSTISGSGANLDTNFSRNIQPSLSRRVSSPRCNPSSQHGASSAGLGQTTSGASNATTPMTTSTPREPKEKTIYSKSGFDMIKALWLVATRKDPRIHLGAVDMSCAFVVCDVTMNDCPIVYVSDNFQNLTGYSRHEIVGQNCRFLQAPDGKVEAGCKREFVDDGAVYNLKKMIQEGQEVQQSLINYRKGGKPFLNLLTMIPIPWDTDEIRYFIGFQIDLVECPDAISGQELDGVKVNYKHSEMEQYIWNPPPSSQWEPGDGQTLGVDDVSTLLQQFNPKGHASDWHKQSWDKMLLENTDDLVHVLSLKGIFLYLSPSCRRVLECDAREMTGTSLSTVCHPSDIVPVTRELKEATTGNQVNVVFRIRRKQSGYTWFESHGSLFVEQGKGRKCIILVGRKRPVFALSRHHLETNGGIGDSELWTKLSTSGMFLFVSSNVRSLLDLQPETLVGTSIQELMRKESRPEFGRSIEKARRGKIVTCKHEVQNRRGQGLQAQTILYPGDACEGQKPSFLLAQTKLLKASSRNLSTSSAAGSNKSVTATPRGNPQSQTSQGNGQISQPAGGALVPGTQDAALASDDNIFDELRTTKCSSWQFELRQMEKVNRILAEELGGLLSNKKKRKRRKGVGNLVRDCANCHTRNTPEWRRGPSGQRDLCNSCGLRWAKQTGRVSPRNSSRGGNNGNGDSQSKKSASPIHSSPLHREVSSETPNAYGTDGDGAADTVAMACQGADMGPSTVSNSSLGPKPLSTMPPPSQPSLSGGAPGSAMTSIREESENSQP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.6
4 0.56
5 0.56
6 0.57
7 0.52
8 0.55
9 0.53
10 0.55
11 0.59
12 0.64
13 0.63
14 0.61
15 0.66
16 0.69
17 0.74
18 0.76
19 0.74
20 0.74
21 0.76
22 0.77
23 0.76
24 0.75
25 0.73
26 0.7
27 0.68
28 0.66
29 0.67
30 0.67
31 0.68
32 0.67
33 0.69
34 0.72
35 0.76
36 0.77
37 0.77
38 0.78
39 0.8
40 0.83
41 0.82
42 0.78
43 0.72
44 0.71
45 0.68
46 0.65
47 0.61
48 0.61
49 0.64
50 0.7
51 0.73
52 0.73
53 0.74
54 0.74
55 0.78
56 0.79
57 0.8
58 0.81
59 0.86
60 0.83
61 0.79
62 0.8
63 0.79
64 0.77
65 0.72
66 0.7
67 0.64
68 0.59
69 0.57
70 0.49
71 0.43
72 0.33
73 0.27
74 0.2
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.19
79 0.15
80 0.19
81 0.2
82 0.19
83 0.19
84 0.22
85 0.24
86 0.23
87 0.24
88 0.22
89 0.22
90 0.22
91 0.21
92 0.22
93 0.19
94 0.18
95 0.2
96 0.18
97 0.16
98 0.16
99 0.17
100 0.16
101 0.15
102 0.13
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.11
109 0.14
110 0.17
111 0.17
112 0.16
113 0.21
114 0.27
115 0.37
116 0.44
117 0.49
118 0.53
119 0.55
120 0.58
121 0.61
122 0.62
123 0.55
124 0.56
125 0.54
126 0.5
127 0.52
128 0.5
129 0.45
130 0.38
131 0.37
132 0.33
133 0.28
134 0.26
135 0.26
136 0.34
137 0.37
138 0.44
139 0.47
140 0.45
141 0.46
142 0.45
143 0.41
144 0.38
145 0.36
146 0.3
147 0.26
148 0.22
149 0.21
150 0.2
151 0.19
152 0.13
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.12
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.09
171 0.09
172 0.11
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.12
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.16
262 0.21
263 0.21
264 0.21
265 0.21
266 0.19
267 0.19
268 0.19
269 0.15
270 0.1
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.13
309 0.16
310 0.19
311 0.2
312 0.25
313 0.25
314 0.31
315 0.32
316 0.28
317 0.26
318 0.25
319 0.25
320 0.22
321 0.2
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.15
334 0.16
335 0.16
336 0.22
337 0.24
338 0.33
339 0.34
340 0.32
341 0.32
342 0.4
343 0.46
344 0.49
345 0.54
346 0.54
347 0.56
348 0.57
349 0.58
350 0.55
351 0.57
352 0.49
353 0.42
354 0.34
355 0.31
356 0.29
357 0.28
358 0.22
359 0.13
360 0.12
361 0.09
362 0.08
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.09
375 0.1
376 0.12
377 0.14
378 0.21
379 0.28
380 0.3
381 0.35
382 0.35
383 0.4
384 0.48
385 0.52
386 0.5
387 0.5
388 0.54
389 0.52
390 0.53
391 0.46
392 0.45
393 0.38
394 0.32
395 0.26
396 0.2
397 0.2
398 0.17
399 0.16
400 0.09
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.19
405 0.19
406 0.24
407 0.27
408 0.27
409 0.29
410 0.32
411 0.3
412 0.23
413 0.22
414 0.2
415 0.18
416 0.18
417 0.14
418 0.11
419 0.1
420 0.09
421 0.07
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.05
426 0.05
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.07
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.08
438 0.12
439 0.12
440 0.13
441 0.12
442 0.12
443 0.11
444 0.13
445 0.12
446 0.1
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.15
451 0.17
452 0.19
453 0.28
454 0.26
455 0.27
456 0.25
457 0.26
458 0.24
459 0.21
460 0.23
461 0.19
462 0.2
463 0.2
464 0.21
465 0.2
466 0.2
467 0.23
468 0.19
469 0.17
470 0.16
471 0.14
472 0.15
473 0.16
474 0.16
475 0.14
476 0.16
477 0.12
478 0.13
479 0.14
480 0.14
481 0.13
482 0.12
483 0.12
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.12
488 0.13
489 0.15
490 0.17
491 0.19
492 0.21
493 0.22
494 0.21
495 0.18
496 0.16
497 0.16
498 0.18
499 0.16
500 0.14
501 0.16
502 0.2
503 0.2
504 0.24
505 0.24
506 0.22
507 0.25
508 0.27
509 0.25
510 0.22
511 0.2
512 0.19
513 0.17
514 0.14
515 0.1
516 0.08
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.06
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.1
526 0.11
527 0.09
528 0.1
529 0.07
530 0.06
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.09
548 0.09
549 0.1
550 0.12
551 0.13
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.11
556 0.17
557 0.16
558 0.16
559 0.18
560 0.19
561 0.21
562 0.22
563 0.22
564 0.17
565 0.17
566 0.18
567 0.21
568 0.24
569 0.24
570 0.23
571 0.26
572 0.27
573 0.27
574 0.27
575 0.21
576 0.17
577 0.13
578 0.12
579 0.09
580 0.08
581 0.07
582 0.03
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.05
589 0.07
590 0.08
591 0.09
592 0.11
593 0.12
594 0.12
595 0.13
596 0.19
597 0.25
598 0.32
599 0.35
600 0.35
601 0.37
602 0.36
603 0.37
604 0.37
605 0.34
606 0.27
607 0.25
608 0.25
609 0.24
610 0.25
611 0.24
612 0.17
613 0.12
614 0.12
615 0.1
616 0.07
617 0.06
618 0.05
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.03
625 0.04
626 0.03
627 0.07
628 0.07
629 0.11
630 0.13
631 0.14
632 0.15
633 0.16
634 0.17
635 0.18
636 0.25
637 0.3
638 0.31
639 0.34
640 0.34
641 0.33
642 0.33
643 0.29
644 0.21
645 0.14
646 0.13
647 0.09
648 0.08
649 0.08
650 0.1
651 0.11
652 0.11
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.13
657 0.15
658 0.14
659 0.13
660 0.16
661 0.18
662 0.19
663 0.18
664 0.15
665 0.14
666 0.15
667 0.15
668 0.15
669 0.2
670 0.2
671 0.2
672 0.23
673 0.22
674 0.2
675 0.21
676 0.21
677 0.16
678 0.17
679 0.25
680 0.25
681 0.3
682 0.34
683 0.37
684 0.42
685 0.5
686 0.54
687 0.5
688 0.49
689 0.45
690 0.42
691 0.37
692 0.3
693 0.21
694 0.16
695 0.12
696 0.11
697 0.11
698 0.13
699 0.13
700 0.17
701 0.19
702 0.2
703 0.2
704 0.2
705 0.18
706 0.22
707 0.28
708 0.33
709 0.38
710 0.45
711 0.52
712 0.52
713 0.52
714 0.47
715 0.44
716 0.39
717 0.36
718 0.35
719 0.33
720 0.37
721 0.38
722 0.37
723 0.34
724 0.3
725 0.27
726 0.2
727 0.15
728 0.11
729 0.09
730 0.08
731 0.09
732 0.08
733 0.08
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.07
738 0.08
739 0.09
740 0.08
741 0.1
742 0.1
743 0.11
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.1
748 0.13
749 0.11
750 0.11
751 0.1
752 0.11
753 0.11
754 0.13
755 0.16
756 0.18
757 0.18
758 0.17
759 0.17
760 0.17
761 0.17
762 0.14
763 0.1
764 0.05
765 0.06
766 0.06
767 0.08
768 0.09
769 0.11
770 0.12
771 0.17
772 0.22
773 0.22
774 0.25
775 0.28
776 0.34
777 0.35
778 0.4
779 0.38
780 0.38
781 0.44
782 0.43
783 0.47
784 0.47
785 0.51
786 0.51
787 0.5
788 0.53
789 0.48
790 0.52
791 0.53
792 0.57
793 0.55
794 0.56
795 0.59
796 0.57
797 0.62
798 0.63
799 0.6
800 0.6
801 0.57
802 0.54
803 0.5
804 0.45
805 0.42
806 0.41
807 0.36
808 0.28
809 0.25
810 0.21
811 0.21
812 0.2
813 0.15
814 0.09
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.08
819 0.12
820 0.15
821 0.15
822 0.17
823 0.18
824 0.17
825 0.2
826 0.2
827 0.2
828 0.18
829 0.26
830 0.27
831 0.28
832 0.27
833 0.26
834 0.27
835 0.25
836 0.31
837 0.32
838 0.32
839 0.32
840 0.33
841 0.35
842 0.34
843 0.32
844 0.27
845 0.22
846 0.19
847 0.19
848 0.18
849 0.16
850 0.16
851 0.16
852 0.15
853 0.14
854 0.2
855 0.22
856 0.22
857 0.31
858 0.35
859 0.38
860 0.38
861 0.41
862 0.42
863 0.44
864 0.46
865 0.38
866 0.38
867 0.39
868 0.39
869 0.34
870 0.28
871 0.26
872 0.23
873 0.21
874 0.16
875 0.13
876 0.1
877 0.1
878 0.08
879 0.05
880 0.06
881 0.06
882 0.06
883 0.06
884 0.06
885 0.06
886 0.06
887 0.07
888 0.06
889 0.06
890 0.07
891 0.08
892 0.08
893 0.09
894 0.1
895 0.08
896 0.08
897 0.1
898 0.12
899 0.12
900 0.17
901 0.19
902 0.19
903 0.27
904 0.33
905 0.35
906 0.4
907 0.47
908 0.46
909 0.52
910 0.6
911 0.54
912 0.55
913 0.53
914 0.51
915 0.49
916 0.48
917 0.43
918 0.34
919 0.34
920 0.29
921 0.26
922 0.22
923 0.16
924 0.13
925 0.1
926 0.1
927 0.08
928 0.11
929 0.17
930 0.23
931 0.31
932 0.41
933 0.5
934 0.62
935 0.73
936 0.81
937 0.85
938 0.89
939 0.93
940 0.95
941 0.95
942 0.94
943 0.87
944 0.78
945 0.71
946 0.59
947 0.51
948 0.46
949 0.44
950 0.36
951 0.36
952 0.39
953 0.4
954 0.48
955 0.55
956 0.58
957 0.59
958 0.64
959 0.66
960 0.67
961 0.69
962 0.71
963 0.71
964 0.72
965 0.69
966 0.66
967 0.66
968 0.63
969 0.59
970 0.57
971 0.47
972 0.37
973 0.4
974 0.38
975 0.36
976 0.38
977 0.43
978 0.4
979 0.49
980 0.54
981 0.55
982 0.62
983 0.65
984 0.65
985 0.66
986 0.7
987 0.67
988 0.64
989 0.58
990 0.53
991 0.55
992 0.55
993 0.52
994 0.47
995 0.44
996 0.43
997 0.41
998 0.38
999 0.32
1000 0.29
1001 0.29
1002 0.26
1003 0.25
1004 0.28
1005 0.35
1006 0.37
1007 0.41
1008 0.41
1009 0.43
1010 0.49
1011 0.51
1012 0.53
1013 0.51
1014 0.5
1015 0.43
1016 0.41
1017 0.39
1018 0.4
1019 0.42
1020 0.37
1021 0.31
1022 0.29
1023 0.3
1024 0.29
1025 0.25
1026 0.17
1027 0.12
1028 0.13
1029 0.12
1030 0.11
1031 0.1
1032 0.1
1033 0.09
1034 0.08
1035 0.07
1036 0.05
1037 0.05
1038 0.04
1039 0.04
1040 0.03
1041 0.04
1042 0.04
1043 0.04
1044 0.04
1045 0.06
1046 0.07
1047 0.07
1048 0.08
1049 0.1
1050 0.11
1051 0.12
1052 0.12
1053 0.12
1054 0.16
1055 0.2
1056 0.23
1057 0.23
1058 0.22
1059 0.25
1060 0.29
1061 0.33
1062 0.34
1063 0.38
1064 0.4
1065 0.47
1066 0.5
1067 0.51
1068 0.47
1069 0.43
1070 0.43
1071 0.39
1072 0.34
1073 0.28
1074 0.25
1075 0.22
1076 0.2
1077 0.18
1078 0.15
1079 0.11
1080 0.11
1081 0.1
1082 0.12
1083 0.12
1084 0.14
1085 0.15
1086 0.17