Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XUK5

Protein Details
Accession A0A2C5XUK5    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-67TSKMKKATATSKEKARRKKAATSRVKKATATSKEKARRKKAATSRVKKATATHydrophilic
424-451LSVTKGKGFTKEKNKKKKGSFRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-104AKAARKAATSKMKKATATSKEKARRKKAATSRVKKATATSKEKARRKKAATSRVKKATATSKDKAATSRAKKATTTSKEKAAPPKGNKAATTKKAAP
430-445KGFTKEKNKKKKGSFR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MTVTRAAAKAARKAATSKMKKATATSKEKARRKKAATSRVKKATATSKEKARRKKAATSRVKKATATSKDKAATSRAKKATTTSKEKAAPPKGNKAATTKKAAPAEKTKTVSTQYKTASASPSEIEIVDLVAHYLNCEGLTKARSALIKQHGKVAAVPDGHGTLNDMYGAWLAARSSVVKQPTLKRKARASSSSDEDSDSSSSCSGGAEPQLKKQKIKVEEEEESSSDSDSESEDEEKIKVEEEEEEEEEESSSDSDSESEDEEKIKVEEEEEEEESSFDSDSESEYEEMDIAAPGIGIKPDPADDSFCDSESDSSSDSDLDSDSNTSAHNKDSYSSSSSETDSSSQTDSSSDSDSDCPPLDPSPPIKTEACGPDSLIPNAQAKRLATPRQRFSRIPQDLQVDARFASNQWVETDYSRRAYQDLSVTKGKGFTKEKNKKKKGSFRGGAIDIGEKRGIYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.53
3 0.56
4 0.57
5 0.59
6 0.62
7 0.62
8 0.65
9 0.66
10 0.65
11 0.67
12 0.64
13 0.66
14 0.71
15 0.78
16 0.82
17 0.82
18 0.82
19 0.8
20 0.84
21 0.84
22 0.85
23 0.87
24 0.86
25 0.86
26 0.85
27 0.81
28 0.72
29 0.68
30 0.68
31 0.67
32 0.66
33 0.62
34 0.63
35 0.7
36 0.77
37 0.81
38 0.81
39 0.81
40 0.79
41 0.84
42 0.84
43 0.85
44 0.87
45 0.86
46 0.86
47 0.85
48 0.81
49 0.72
50 0.68
51 0.68
52 0.66
53 0.65
54 0.58
55 0.56
56 0.55
57 0.56
58 0.52
59 0.49
60 0.49
61 0.48
62 0.55
63 0.53
64 0.53
65 0.52
66 0.56
67 0.59
68 0.58
69 0.6
70 0.54
71 0.56
72 0.59
73 0.64
74 0.67
75 0.66
76 0.67
77 0.64
78 0.7
79 0.69
80 0.67
81 0.64
82 0.63
83 0.63
84 0.59
85 0.6
86 0.54
87 0.54
88 0.57
89 0.57
90 0.55
91 0.55
92 0.57
93 0.56
94 0.55
95 0.5
96 0.46
97 0.49
98 0.51
99 0.44
100 0.44
101 0.38
102 0.4
103 0.4
104 0.39
105 0.36
106 0.3
107 0.29
108 0.22
109 0.21
110 0.17
111 0.15
112 0.13
113 0.1
114 0.09
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.09
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.14
131 0.15
132 0.16
133 0.23
134 0.3
135 0.36
136 0.36
137 0.41
138 0.4
139 0.39
140 0.39
141 0.34
142 0.29
143 0.22
144 0.22
145 0.16
146 0.16
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.11
165 0.13
166 0.15
167 0.2
168 0.28
169 0.38
170 0.46
171 0.5
172 0.52
173 0.57
174 0.61
175 0.63
176 0.61
177 0.57
178 0.52
179 0.52
180 0.48
181 0.42
182 0.36
183 0.3
184 0.25
185 0.2
186 0.15
187 0.11
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.09
195 0.15
196 0.16
197 0.23
198 0.32
199 0.33
200 0.34
201 0.38
202 0.41
203 0.41
204 0.46
205 0.45
206 0.42
207 0.43
208 0.45
209 0.42
210 0.35
211 0.3
212 0.24
213 0.19
214 0.13
215 0.1
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.09
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.08
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.07
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.09
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.07
290 0.08
291 0.1
292 0.11
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.16
300 0.17
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.14
318 0.13
319 0.14
320 0.17
321 0.2
322 0.21
323 0.21
324 0.22
325 0.22
326 0.23
327 0.22
328 0.21
329 0.19
330 0.17
331 0.18
332 0.16
333 0.15
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.13
340 0.14
341 0.16
342 0.17
343 0.19
344 0.18
345 0.16
346 0.16
347 0.16
348 0.17
349 0.19
350 0.22
351 0.25
352 0.26
353 0.3
354 0.29
355 0.28
356 0.33
357 0.34
358 0.32
359 0.27
360 0.27
361 0.29
362 0.32
363 0.32
364 0.27
365 0.24
366 0.27
367 0.28
368 0.28
369 0.26
370 0.24
371 0.29
372 0.35
373 0.42
374 0.46
375 0.54
376 0.62
377 0.68
378 0.73
379 0.69
380 0.69
381 0.71
382 0.69
383 0.64
384 0.6
385 0.56
386 0.52
387 0.53
388 0.47
389 0.37
390 0.3
391 0.27
392 0.21
393 0.17
394 0.21
395 0.19
396 0.19
397 0.19
398 0.2
399 0.21
400 0.24
401 0.29
402 0.26
403 0.28
404 0.28
405 0.28
406 0.27
407 0.27
408 0.28
409 0.32
410 0.32
411 0.34
412 0.38
413 0.38
414 0.38
415 0.42
416 0.4
417 0.39
418 0.42
419 0.46
420 0.52
421 0.62
422 0.71
423 0.77
424 0.85
425 0.86
426 0.91
427 0.92
428 0.91
429 0.92
430 0.89
431 0.85
432 0.83
433 0.75
434 0.66
435 0.57
436 0.53
437 0.43
438 0.39
439 0.32
440 0.23
441 0.21