FuNGI

A0A2C5Y1U6

Protein Details

Accession

A0A2C5Y1U6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-41	TTEGSGPKRRKYSPRCRHQHQNSDIDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MPAKRDYDDLESGETTEGSGPKRRKYSPRCRHQHQNSDIDATWGQKYVFSAQTDATSIPYGDESDFEDDADAMAYLRSVRTEAQAIPHMLTASTTIIGPQMPPELQADDVEDTPICENVVDDVRGYYQDGAYVARPTEPDDDHGSVDPDSTSHAHLEGHDHLEKSSSPQLLQAYFASILTRYHHLRRTLHTRPPQSAMKLVASSRSTPATLFKPNTKSVKTWYRILRQSSPHPVQLALLHKSSVFYALQLLLGGRFLRRGYTLSERTSQWLWGLLARLPSPEEMGAEEVACVRDIGRRAVLLGRSLSELAEINAELYETTSEVDDTDSSTTQKDENHDDDDDDAIADRDTNPEDSTEPVIRSESPSLSSDPVVKKEHDLHDSSDEEEGEITADFAESESEAMELAASDSDVEGSMHSTTTDAQALRAAKEAFLARLAIDTTTNDMDEEEAAKFRLRLNLRATLDMVLTVTGEYYGQRDLLDFREPFLGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.18
3	0.17
4	0.18
5	0.18
6	0.26
7	0.31
8	0.38
9	0.46
10	0.54
11	0.61
12	0.69
13	0.77
14	0.8
15	0.85
16	0.87
17	0.88
18	0.91
19	0.91
20	0.91
21	0.88
22	0.86
23	0.78
24	0.73
25	0.65
26	0.57
27	0.48
28	0.39
29	0.32
30	0.25
31	0.22
32	0.17
33	0.19
34	0.21
35	0.25
36	0.23
37	0.24
38	0.23
39	0.25
40	0.25
41	0.23
42	0.19
43	0.16
44	0.14
45	0.13
46	0.13
47	0.12
48	0.11
49	0.11
50	0.12
51	0.16
52	0.15
53	0.15
54	0.14
55	0.13
56	0.13
57	0.12
58	0.09
59	0.05
60	0.05
61	0.05
62	0.06
63	0.06
64	0.06
65	0.07
66	0.09
67	0.11
68	0.15
69	0.15
70	0.19
71	0.24
72	0.25
73	0.25
74	0.25
75	0.22
76	0.19
77	0.18
78	0.15
79	0.1
80	0.1
81	0.09
82	0.08
83	0.08
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.13
91	0.13
92	0.13
93	0.14
94	0.15
95	0.13
96	0.14
97	0.13
98	0.12
99	0.11
100	0.11
101	0.11
102	0.09
103	0.07
104	0.07
105	0.08
106	0.11
107	0.1
108	0.1
109	0.1
110	0.11
111	0.12
112	0.13
113	0.11
114	0.08
115	0.09
116	0.09
117	0.1
118	0.11
119	0.12
120	0.11
121	0.11
122	0.12
123	0.14
124	0.17
125	0.17
126	0.19
127	0.22
128	0.24
129	0.24
130	0.24
131	0.22
132	0.18
133	0.18
134	0.14
135	0.09
136	0.1
137	0.1
138	0.1
139	0.09
140	0.1
141	0.1
142	0.11
143	0.14
144	0.14
145	0.18
146	0.19
147	0.19
148	0.18
149	0.19
150	0.19
151	0.19
152	0.22
153	0.18
154	0.16
155	0.19
156	0.21
157	0.2
158	0.21
159	0.17
160	0.14
161	0.13
162	0.13
163	0.11
164	0.09
165	0.1
166	0.1
167	0.14
168	0.15
169	0.2
170	0.25
171	0.3
172	0.33
173	0.38
174	0.45
175	0.49
176	0.55
177	0.58
178	0.57
179	0.55
180	0.57
181	0.55
182	0.47
183	0.43
184	0.36
185	0.3
186	0.27
187	0.24
188	0.23
189	0.21
190	0.2
191	0.18
192	0.17
193	0.16
194	0.14
195	0.18
196	0.17
197	0.21
198	0.22
199	0.26
200	0.3
201	0.35
202	0.39
203	0.38
204	0.36
205	0.37
206	0.45
207	0.42
208	0.45
209	0.46
210	0.49
211	0.52
212	0.56
213	0.55
214	0.5
215	0.52
216	0.54
217	0.5
218	0.44
219	0.39
220	0.34
221	0.29
222	0.28
223	0.27
224	0.2
225	0.17
226	0.16
227	0.15
228	0.15
229	0.15
230	0.13
231	0.09
232	0.06
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.08
247	0.12
248	0.19
249	0.23
250	0.24
251	0.27
252	0.27
253	0.29
254	0.28
255	0.25
256	0.18
257	0.16
258	0.14
259	0.12
260	0.13
261	0.11
262	0.12
263	0.12
264	0.12
265	0.11
266	0.11
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.07
271	0.08
272	0.08
273	0.07
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.08
281	0.09
282	0.11
283	0.11
284	0.1
285	0.11
286	0.15
287	0.15
288	0.14
289	0.13
290	0.12
291	0.13
292	0.13
293	0.12
294	0.1
295	0.09
296	0.07
297	0.08
298	0.07
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.04
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.1
317	0.1
318	0.11
319	0.13
320	0.16
321	0.2
322	0.22
323	0.25
324	0.25
325	0.25
326	0.24
327	0.22
328	0.19
329	0.13
330	0.1
331	0.07
332	0.07
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.09
337	0.1
338	0.1
339	0.11
340	0.12
341	0.13
342	0.17
343	0.18
344	0.17
345	0.16
346	0.17
347	0.17
348	0.2
349	0.2
350	0.17
351	0.17
352	0.19
353	0.2
354	0.2
355	0.2
356	0.24
357	0.24
358	0.28
359	0.29
360	0.28
361	0.3
362	0.36
363	0.4
364	0.38
365	0.38
366	0.36
367	0.38
368	0.38
369	0.35
370	0.29
371	0.24
372	0.19
373	0.17
374	0.13
375	0.09
376	0.08
377	0.07
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.04
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.08
406	0.1
407	0.14
408	0.13
409	0.13
410	0.17
411	0.19
412	0.19
413	0.23
414	0.22
415	0.18
416	0.21
417	0.22
418	0.19
419	0.18
420	0.18
421	0.13
422	0.14
423	0.14
424	0.11
425	0.11
426	0.11
427	0.14
428	0.14
429	0.14
430	0.13
431	0.13
432	0.13
433	0.13
434	0.14
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.13
439	0.14
440	0.16
441	0.24
442	0.26
443	0.32
444	0.36
445	0.45
446	0.46
447	0.47
448	0.46
449	0.39
450	0.35
451	0.29
452	0.23
453	0.14
454	0.12
455	0.09
456	0.08
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.08
461	0.09
462	0.09
463	0.1
464	0.11
465	0.13
466	0.16
467	0.23
468	0.22
469	0.22

A0A2C5Y1U6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer