FuNGI

J3P5K9

Protein Details

Accession

J3P5K9

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
51-70	NPLVGRRKHDPSKTMNRPAS	Hydrophilic
233-256	NAEPAQKKTQKKEKPFNAHFHTKK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
459-462	KKVR
515-557	TKDSKDPKDAKDKKAAAKGSGAAGKSKADATKGPKSLKRPGSP
569-573	RKKAK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPRSNPPNGPNANAPNPNAPNPAAPNAAQNAAAMRIPASLRRRTAAASNPLVGRRKHDPSKTMNRPASTQRPSSTAYVKATPKDPLIALKEQNEKRLKDFEAQRKKNGGWTNPPPQGEFMDYPLVISKRALDDDTLFHVMRFSHTKGGQIDHTVDPTDPNDFTRPVVLHRRDAQQPAAAREVKDEAAVEEEPAKPTMDEKEAERLEKLKAEKEAQRQEDLAKIAPGVKTANAEPAQKKTQKKEKPFNAHFHTKKTADPKAGQLRYAEALPWHIEDADGKNVWFGQYVAPLSRANVGLVISGQGFKMIPLEKYYRFIAKPAFKGFSLEEAEAQMKQKLKMPIWAEKGESKEAKAELAATRRWMGGGSMVKQESSTYRAAPRSEKVDHDDVDMSGDEFQDDDEAPTMERDNDEDAKDARERQRRDHMGANLFGEADEKEVDEEETAKMLEDAVRKMHGKKVRKALTRHEKHLEYQSDSDSNPYASSSDEEEEKPDEEKKDEANGKDGEKEKESETKDSKDPKDAKDKKAAAKGSGAAGKSKADATKGPKSLKRPGSPNLSESSGNESTRKKAKKTATSSVQPSRSGTPLPQRTKVKPAGSATSDGEATGGEMSDGGLKKKKLSKLGGTGTPGGSRAGSPVPSQGPVGSSSAGVSPKKGTPVPDGPGQIITREELLAALEANPNGISIGDLLKRYFSDRVGDGENKLQKNKFISLVTRNSIFRKADKLLLPKPKKEAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.55
3	0.54
4	0.53
5	0.54
6	0.54
7	0.5
8	0.44
9	0.41
10	0.4
11	0.42
12	0.36
13	0.32
14	0.33
15	0.31
16	0.31
17	0.26
18	0.22
19	0.2
20	0.18
21	0.18
22	0.13
23	0.11
24	0.13
25	0.14
26	0.21
27	0.26
28	0.31
29	0.34
30	0.36
31	0.37
32	0.37
33	0.43
34	0.44
35	0.46
36	0.44
37	0.45
38	0.46
39	0.5
40	0.54
41	0.48
42	0.45
43	0.44
44	0.49
45	0.54
46	0.58
47	0.59
48	0.63
49	0.73
50	0.78
51	0.8
52	0.77
53	0.71
54	0.69
55	0.7
56	0.71
57	0.66
58	0.61
59	0.53
60	0.51
61	0.52
62	0.51
63	0.47
64	0.43
65	0.4
66	0.42
67	0.44
68	0.44
69	0.43
70	0.42
71	0.39
72	0.36
73	0.33
74	0.32
75	0.33
76	0.36
77	0.37
78	0.4
79	0.48
80	0.48
81	0.56
82	0.56
83	0.53
84	0.51
85	0.53
86	0.5
87	0.49
88	0.56
89	0.58
90	0.62
91	0.65
92	0.68
93	0.68
94	0.66
95	0.65
96	0.63
97	0.59
98	0.58
99	0.61
100	0.63
101	0.63
102	0.64
103	0.57
104	0.51
105	0.46
106	0.41
107	0.34
108	0.28
109	0.26
110	0.24
111	0.23
112	0.26
113	0.24
114	0.19
115	0.18
116	0.18
117	0.16
118	0.19
119	0.19
120	0.16
121	0.17
122	0.19
123	0.24
124	0.25
125	0.22
126	0.2
127	0.21
128	0.19
129	0.21
130	0.23
131	0.21
132	0.24
133	0.25
134	0.3
135	0.31
136	0.34
137	0.32
138	0.31
139	0.32
140	0.26
141	0.27
142	0.23
143	0.21
144	0.19
145	0.18
146	0.18
147	0.14
148	0.16
149	0.17
150	0.17
151	0.18
152	0.2
153	0.2
154	0.22
155	0.32
156	0.33
157	0.36
158	0.41
159	0.46
160	0.47
161	0.5
162	0.47
163	0.41
164	0.41
165	0.38
166	0.4
167	0.36
168	0.31
169	0.3
170	0.3
171	0.25
172	0.22
173	0.19
174	0.13
175	0.14
176	0.14
177	0.12
178	0.12
179	0.13
180	0.14
181	0.14
182	0.14
183	0.11
184	0.12
185	0.15
186	0.16
187	0.16
188	0.17
189	0.25
190	0.26
191	0.27
192	0.27
193	0.25
194	0.24
195	0.27
196	0.28
197	0.23
198	0.26
199	0.3
200	0.36
201	0.43
202	0.5
203	0.48
204	0.48
205	0.45
206	0.42
207	0.41
208	0.36
209	0.27
210	0.19
211	0.16
212	0.17
213	0.16
214	0.16
215	0.13
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.19
220	0.19
221	0.24
222	0.25
223	0.29
224	0.36
225	0.41
226	0.46
227	0.49
228	0.57
229	0.61
230	0.69
231	0.74
232	0.77
233	0.81
234	0.83
235	0.83
236	0.8
237	0.81
238	0.73
239	0.68
240	0.65
241	0.55
242	0.52
243	0.51
244	0.49
245	0.43
246	0.43
247	0.46
248	0.5
249	0.49
250	0.46
251	0.39
252	0.35
253	0.31
254	0.3
255	0.21
256	0.12
257	0.12
258	0.12
259	0.12
260	0.1
261	0.08
262	0.08
263	0.09
264	0.11
265	0.13
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.11
272	0.09
273	0.06
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.14
281	0.13
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.12
298	0.16
299	0.17
300	0.19
301	0.21
302	0.22
303	0.21
304	0.23
305	0.27
306	0.29
307	0.32
308	0.32
309	0.33
310	0.28
311	0.3
312	0.29
313	0.26
314	0.23
315	0.19
316	0.15
317	0.15
318	0.16
319	0.14
320	0.15
321	0.13
322	0.12
323	0.13
324	0.18
325	0.21
326	0.21
327	0.27
328	0.29
329	0.34
330	0.37
331	0.37
332	0.34
333	0.32
334	0.34
335	0.32
336	0.29
337	0.22
338	0.2
339	0.19
340	0.17
341	0.15
342	0.14
343	0.12
344	0.15
345	0.15
346	0.13
347	0.14
348	0.14
349	0.14
350	0.12
351	0.09
352	0.11
353	0.13
354	0.14
355	0.16
356	0.16
357	0.16
358	0.16
359	0.16
360	0.13
361	0.14
362	0.13
363	0.11
364	0.15
365	0.18
366	0.2
367	0.22
368	0.23
369	0.25
370	0.25
371	0.26
372	0.27
373	0.28
374	0.26
375	0.26
376	0.24
377	0.19
378	0.18
379	0.16
380	0.12
381	0.08
382	0.08
383	0.06
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.06
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.07
397	0.1
398	0.11
399	0.12
400	0.13
401	0.13
402	0.15
403	0.17
404	0.21
405	0.25
406	0.31
407	0.33
408	0.37
409	0.47
410	0.49
411	0.51
412	0.53
413	0.5
414	0.46
415	0.46
416	0.4
417	0.3
418	0.26
419	0.22
420	0.16
421	0.11
422	0.08
423	0.06
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.08
437	0.09
438	0.1
439	0.11
440	0.14
441	0.16
442	0.17
443	0.24
444	0.28
445	0.34
446	0.4
447	0.5
448	0.56
449	0.61
450	0.64
451	0.69
452	0.72
453	0.71
454	0.7
455	0.66
456	0.59
457	0.55
458	0.59
459	0.52
460	0.44
461	0.4
462	0.36
463	0.31
464	0.29
465	0.28
466	0.2
467	0.17
468	0.13
469	0.11
470	0.09
471	0.08
472	0.09
473	0.1
474	0.11
475	0.12
476	0.12
477	0.14
478	0.15
479	0.15
480	0.16
481	0.17
482	0.18
483	0.17
484	0.19
485	0.19
486	0.25
487	0.29
488	0.28
489	0.31
490	0.31
491	0.31
492	0.35
493	0.37
494	0.32
495	0.29
496	0.3
497	0.27
498	0.32
499	0.33
500	0.35
501	0.36
502	0.37
503	0.41
504	0.48
505	0.48
506	0.5
507	0.53
508	0.51
509	0.59
510	0.62
511	0.61
512	0.63
513	0.67
514	0.64
515	0.66
516	0.63
517	0.53
518	0.48
519	0.44
520	0.38
521	0.36
522	0.29
523	0.23
524	0.22
525	0.2
526	0.18
527	0.19
528	0.16
529	0.15
530	0.2
531	0.25
532	0.33
533	0.38
534	0.44
535	0.46
536	0.51
537	0.59
538	0.62
539	0.62
540	0.6
541	0.6
542	0.64
543	0.62
544	0.58
545	0.52
546	0.46
547	0.39
548	0.34
549	0.36
550	0.29
551	0.28
552	0.29
553	0.28
554	0.31
555	0.4
556	0.44
557	0.4
558	0.45
559	0.53
560	0.59
561	0.65
562	0.69
563	0.69
564	0.71
565	0.75
566	0.75
567	0.69
568	0.61
569	0.55
570	0.49
571	0.42
572	0.36
573	0.34
574	0.36
575	0.41
576	0.46
577	0.51
578	0.55
579	0.57
580	0.64
581	0.67
582	0.61
583	0.58
584	0.56
585	0.55
586	0.5
587	0.5
588	0.42
589	0.36
590	0.32
591	0.25
592	0.21
593	0.14
594	0.12
595	0.08
596	0.06
597	0.04
598	0.04
599	0.05
600	0.1
601	0.11
602	0.13
603	0.19
604	0.2
605	0.27
606	0.34
607	0.4
608	0.44
609	0.5
610	0.56
611	0.6
612	0.65
613	0.64
614	0.6
615	0.57
616	0.5
617	0.43
618	0.35
619	0.27
620	0.21
621	0.16
622	0.15
623	0.15
624	0.15
625	0.15
626	0.19
627	0.21
628	0.21
629	0.22
630	0.2
631	0.18
632	0.18
633	0.19
634	0.15
635	0.13
636	0.12
637	0.15
638	0.19
639	0.18
640	0.18
641	0.2
642	0.22
643	0.27
644	0.29
645	0.29
646	0.33
647	0.39
648	0.41
649	0.43
650	0.43
651	0.39
652	0.42
653	0.38
654	0.31
655	0.26
656	0.23
657	0.18
658	0.16
659	0.15
660	0.1
661	0.1
662	0.09
663	0.09
664	0.09
665	0.1
666	0.1
667	0.11
668	0.11
669	0.1
670	0.09
671	0.09
672	0.08
673	0.06
674	0.11
675	0.13
676	0.15
677	0.15
678	0.17
679	0.18
680	0.21
681	0.23
682	0.21
683	0.23
684	0.23
685	0.27
686	0.32
687	0.34
688	0.33
689	0.39
690	0.45
691	0.44
692	0.49
693	0.47
694	0.46
695	0.48
696	0.5
697	0.47
698	0.44
699	0.47
700	0.49
701	0.54
702	0.54
703	0.53
704	0.52
705	0.5
706	0.53
707	0.49
708	0.44
709	0.44
710	0.43
711	0.46
712	0.5
713	0.55
714	0.57
715	0.65
716	0.69
717	0.68

J3P5K9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer