FuNGI

A0A2B7ZL11

Protein Details

Accession

A0A2B7ZL11

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-39	DIDPVPLSPERKRKNKEKDGHSAKKRKHESSTT	Basic
42-100	PEVEEPSPKAKKKEKKHRKHKHHEDSEPSAQTLPDSSNARSKKTKKHKHQAQEAVKDDQ	Basic
478-502	VPVPMPGKQGKEKQKQKKKGKKSAS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-35	ERKRKNKEKDGHSAKKRKHE
47-63	PSPKAKKKEKKHRKHKH
82-88	SKKTKKH
484-502	GKQGKEKQKQKKKGKKSAS

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, mito_nucl 10, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSVDAMDIDPVPLSPERKRKNKEKDGHSAKKRKHESSTTAQPEVEEPSPKAKKKEKKHRKHKHHEDSEPSAQTLPDSSNARSKKTKKHKHQAQEAVKDDQEEEEEPSSQAQSPTTSRKPLAKTSASQLESASTDSTESSPFHLITATLYVPLSPISISPTHALSSLQAEHLSPLLLTYYPPLRGIVLAYSNASISSTPPSLSTPSTTHNPDADPNPQPLTLAVSAGEYGVLYVYLTATFLIFRPERGQPLEGWINVQSDGFLGAVVYNLFSVGIERRRLPADWQWVAPGQEQEQESAASGLEVATPKTSGNDDDDDDDDDEEDSDFDSDKENFRPLPASSAAMLDLSTQQNQNNDGMEPPFEAFEDASAGYFRTRSGRRVRGMVRFRVRDVDVIPGAENDKGFLSIEGTMLSPEEEAKLVEEERKRAGFAPSSSPAAAAAAAVGRSGSEGPGRAMMSGGLGIAGAAAVEREEEAEVEVPVPMPGKQGKEKQKQKKKGKKSAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.36
3	0.45
4	0.55
5	0.65
6	0.72
7	0.8
8	0.87
9	0.88
10	0.87
11	0.89
12	0.9
13	0.91
14	0.91
15	0.9
16	0.86
17	0.87
18	0.87
19	0.83
20	0.81
21	0.79
22	0.76
23	0.76
24	0.79
25	0.75
26	0.69
27	0.62
28	0.53
29	0.46
30	0.43
31	0.37
32	0.3
33	0.25
34	0.32
35	0.41
36	0.44
37	0.52
38	0.56
39	0.63
40	0.7
41	0.8
42	0.81
43	0.84
44	0.91
45	0.94
46	0.95
47	0.97
48	0.97
49	0.97
50	0.96
51	0.94
52	0.91
53	0.88
54	0.85
55	0.75
56	0.65
57	0.54
58	0.44
59	0.35
60	0.28
61	0.21
62	0.18
63	0.19
64	0.2
65	0.28
66	0.3
67	0.35
68	0.43
69	0.5
70	0.55
71	0.63
72	0.72
73	0.75
74	0.84
75	0.89
76	0.9
77	0.93
78	0.93
79	0.91
80	0.9
81	0.82
82	0.76
83	0.66
84	0.56
85	0.46
86	0.36
87	0.28
88	0.2
89	0.19
90	0.15
91	0.16
92	0.15
93	0.15
94	0.16
95	0.15
96	0.15
97	0.13
98	0.15
99	0.18
100	0.26
101	0.3
102	0.33
103	0.34
104	0.41
105	0.44
106	0.48
107	0.52
108	0.49
109	0.47
110	0.49
111	0.55
112	0.49
113	0.45
114	0.38
115	0.31
116	0.27
117	0.26
118	0.2
119	0.11
120	0.1
121	0.1
122	0.11
123	0.11
124	0.1
125	0.12
126	0.13
127	0.13
128	0.13
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.12
133	0.1
134	0.09
135	0.09
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.08
140	0.06
141	0.06
142	0.08
143	0.09
144	0.11
145	0.12
146	0.12
147	0.13
148	0.13
149	0.13
150	0.1
151	0.13
152	0.12
153	0.12
154	0.11
155	0.11
156	0.11
157	0.11
158	0.1
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.05
163	0.05
164	0.07
165	0.09
166	0.1
167	0.11
168	0.11
169	0.1
170	0.1
171	0.11
172	0.1
173	0.1
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.07
181	0.06
182	0.08
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.11
187	0.12
188	0.13
189	0.15
190	0.14
191	0.17
192	0.21
193	0.23
194	0.23
195	0.22
196	0.22
197	0.22
198	0.23
199	0.24
200	0.23
201	0.22
202	0.22
203	0.2
204	0.2
205	0.17
206	0.18
207	0.13
208	0.11
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.07
214	0.04
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.02
219	0.02
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.04
227	0.08
228	0.08
229	0.09
230	0.12
231	0.13
232	0.16
233	0.17
234	0.18
235	0.14
236	0.19
237	0.2
238	0.17
239	0.17
240	0.16
241	0.15
242	0.14
243	0.13
244	0.08
245	0.06
246	0.07
247	0.05
248	0.04
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.04
259	0.07
260	0.1
261	0.12
262	0.13
263	0.15
264	0.16
265	0.17
266	0.2
267	0.23
268	0.28
269	0.28
270	0.28
271	0.27
272	0.27
273	0.28
274	0.26
275	0.21
276	0.13
277	0.16
278	0.16
279	0.15
280	0.14
281	0.13
282	0.11
283	0.1
284	0.09
285	0.05
286	0.05
287	0.04
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.11
298	0.13
299	0.13
300	0.15
301	0.16
302	0.16
303	0.16
304	0.15
305	0.12
306	0.1
307	0.09
308	0.08
309	0.07
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.08
315	0.08
316	0.11
317	0.12
318	0.15
319	0.14
320	0.15
321	0.18
322	0.16
323	0.19
324	0.18
325	0.18
326	0.16
327	0.16
328	0.15
329	0.13
330	0.12
331	0.09
332	0.11
333	0.11
334	0.12
335	0.13
336	0.14
337	0.16
338	0.18
339	0.18
340	0.16
341	0.15
342	0.15
343	0.14
344	0.13
345	0.13
346	0.11
347	0.1
348	0.09
349	0.1
350	0.08
351	0.07
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.14
361	0.17
362	0.24
363	0.33
364	0.41
365	0.44
366	0.52
367	0.58
368	0.6
369	0.65
370	0.68
371	0.68
372	0.62
373	0.61
374	0.58
375	0.53
376	0.46
377	0.39
378	0.36
379	0.27
380	0.25
381	0.24
382	0.19
383	0.19
384	0.17
385	0.16
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.07
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.1
406	0.11
407	0.18
408	0.21
409	0.23
410	0.28
411	0.28
412	0.28
413	0.29
414	0.32
415	0.32
416	0.31
417	0.35
418	0.33
419	0.36
420	0.35
421	0.32
422	0.27
423	0.22
424	0.19
425	0.11
426	0.09
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.05
432	0.06
433	0.07
434	0.08
435	0.09
436	0.1
437	0.12
438	0.16
439	0.16
440	0.15
441	0.15
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.09
446	0.06
447	0.05
448	0.05
449	0.04
450	0.04
451	0.03
452	0.02
453	0.02
454	0.03
455	0.03
456	0.04
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.08
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.1
465	0.09
466	0.1
467	0.11
468	0.09
469	0.13
470	0.18
471	0.23
472	0.32
473	0.41
474	0.51
475	0.61
476	0.72
477	0.78
478	0.85
479	0.89
480	0.93
481	0.94
482	0.94

A0A2B7ZL11

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer