Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P436

Protein Details
Accession J3P436    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-244GEEEEVKRRRKKSETRSIAHPASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-235KRRRKKSE
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MGRPAVHQASERQFLDERGSSSRLAPNGLNPARIMEKAVVDRIVDSYFWKEQCFGLNEADIVDRVVDHVHFVGGITGASQKPTPFLCLALKLLQLAPGDDVLAEYLHFGGDKFKYLRALALFYVRLTRTPKDVYATIEPFLEDYRKLRRKGRAGTSLTYVDDFADDLLVKDRVCATSLYKLTKRDVLEDLDLLSPRVSPLGDLEDLLEEEEEEEEEEEGEGGEEEEVKRRRKKSETRSIAHPASRPTSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.4
3 0.35
4 0.31
5 0.29
6 0.3
7 0.27
8 0.29
9 0.32
10 0.27
11 0.27
12 0.25
13 0.25
14 0.33
15 0.34
16 0.32
17 0.27
18 0.29
19 0.29
20 0.28
21 0.26
22 0.18
23 0.2
24 0.21
25 0.23
26 0.21
27 0.19
28 0.19
29 0.18
30 0.17
31 0.14
32 0.13
33 0.16
34 0.19
35 0.2
36 0.2
37 0.2
38 0.2
39 0.25
40 0.26
41 0.24
42 0.21
43 0.21
44 0.2
45 0.2
46 0.19
47 0.14
48 0.1
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.11
69 0.12
70 0.14
71 0.12
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.18
76 0.17
77 0.17
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.14
82 0.12
83 0.11
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.06
97 0.07
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.14
102 0.14
103 0.16
104 0.14
105 0.15
106 0.12
107 0.14
108 0.13
109 0.11
110 0.14
111 0.12
112 0.14
113 0.15
114 0.15
115 0.17
116 0.18
117 0.19
118 0.19
119 0.21
120 0.22
121 0.23
122 0.24
123 0.21
124 0.19
125 0.18
126 0.16
127 0.15
128 0.12
129 0.08
130 0.09
131 0.19
132 0.26
133 0.3
134 0.36
135 0.43
136 0.51
137 0.58
138 0.64
139 0.63
140 0.61
141 0.59
142 0.56
143 0.5
144 0.42
145 0.34
146 0.26
147 0.16
148 0.12
149 0.1
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.19
164 0.23
165 0.29
166 0.31
167 0.33
168 0.35
169 0.39
170 0.38
171 0.33
172 0.33
173 0.3
174 0.28
175 0.26
176 0.25
177 0.21
178 0.21
179 0.17
180 0.15
181 0.11
182 0.09
183 0.1
184 0.08
185 0.06
186 0.08
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.11
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.07
212 0.16
213 0.22
214 0.3
215 0.38
216 0.42
217 0.51
218 0.6
219 0.7
220 0.73
221 0.79
222 0.81
223 0.78
224 0.81
225 0.81
226 0.78
227 0.72
228 0.65
229 0.6