Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2B7YNE6

Protein Details
Accession A0A2B7YNE6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-246AYIKGKEEKARREKARKEKAFVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-53GKREGPSEPPRAADPANARAPRGGRGGG
228-244KGKEEKARREKARKEKA
256-317SRGGRGGGEGGYRGGRGGRGGDRGHGGGPRGGPGAGGRGRGGEFRGGAPGGGAPRGGRGGPA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8, nucl 7, mito 7, cyto 7, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences NDPEEDSDREPEPPTSAITKAAPRYGKREGPSEPPRAADPANARAPRGGRGGGGGRYGNEQAFRDRDASAKANRSKPVDAPLPDIPTGVVKNRDVRGNLLREDRTNRSDRIVTPKQVEQGWGANSGESTWEDERAGEATAKREGKESAAALEAAAANNNGVDAEAAAAAEAEDKAKSYAEYLVEQAEQRREDLGVKEARKPNEGVKADKKWATAKELKRDEDEQAYIKGKEEKARREKARKEKAFVEVDMRFVEPSRGGRGGGEGGYRGGRGGRGGDRGHGGGPRGGPGAGGRGRGGEFRGGAPGGGAPRGGRGGPAAGPGPSVSVDEKNFPALGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.23
4 0.24
5 0.26
6 0.31
7 0.32
8 0.38
9 0.41
10 0.42
11 0.48
12 0.53
13 0.56
14 0.52
15 0.54
16 0.52
17 0.55
18 0.6
19 0.6
20 0.53
21 0.48
22 0.47
23 0.44
24 0.41
25 0.37
26 0.34
27 0.35
28 0.42
29 0.41
30 0.4
31 0.4
32 0.41
33 0.38
34 0.36
35 0.29
36 0.21
37 0.24
38 0.27
39 0.25
40 0.27
41 0.23
42 0.2
43 0.23
44 0.24
45 0.21
46 0.2
47 0.19
48 0.21
49 0.22
50 0.23
51 0.22
52 0.21
53 0.22
54 0.24
55 0.28
56 0.29
57 0.36
58 0.42
59 0.46
60 0.5
61 0.53
62 0.51
63 0.48
64 0.49
65 0.47
66 0.41
67 0.41
68 0.4
69 0.39
70 0.36
71 0.33
72 0.27
73 0.22
74 0.22
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.25
79 0.27
80 0.31
81 0.3
82 0.33
83 0.36
84 0.37
85 0.38
86 0.38
87 0.37
88 0.37
89 0.41
90 0.41
91 0.4
92 0.4
93 0.37
94 0.35
95 0.37
96 0.36
97 0.4
98 0.42
99 0.4
100 0.4
101 0.41
102 0.4
103 0.37
104 0.36
105 0.28
106 0.25
107 0.22
108 0.21
109 0.18
110 0.15
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.09
115 0.11
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.09
124 0.09
125 0.11
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.18
130 0.18
131 0.17
132 0.19
133 0.17
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.02
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.02
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.14
180 0.18
181 0.2
182 0.22
183 0.29
184 0.33
185 0.34
186 0.34
187 0.35
188 0.33
189 0.37
190 0.38
191 0.37
192 0.39
193 0.42
194 0.44
195 0.45
196 0.43
197 0.38
198 0.38
199 0.39
200 0.41
201 0.42
202 0.48
203 0.52
204 0.52
205 0.51
206 0.51
207 0.46
208 0.41
209 0.37
210 0.29
211 0.26
212 0.27
213 0.23
214 0.23
215 0.26
216 0.24
217 0.29
218 0.34
219 0.41
220 0.48
221 0.57
222 0.65
223 0.7
224 0.77
225 0.81
226 0.86
227 0.82
228 0.78
229 0.73
230 0.71
231 0.65
232 0.56
233 0.52
234 0.41
235 0.36
236 0.32
237 0.28
238 0.2
239 0.17
240 0.17
241 0.13
242 0.14
243 0.17
244 0.17
245 0.17
246 0.16
247 0.18
248 0.18
249 0.17
250 0.15
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.13
260 0.15
261 0.2
262 0.21
263 0.23
264 0.25
265 0.25
266 0.26
267 0.24
268 0.22
269 0.19
270 0.19
271 0.19
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.13
276 0.19
277 0.18
278 0.19
279 0.17
280 0.18
281 0.19
282 0.21
283 0.22
284 0.18
285 0.17
286 0.16
287 0.19
288 0.17
289 0.16
290 0.15
291 0.16
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.1
296 0.12
297 0.14
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.14
302 0.14
303 0.17
304 0.16
305 0.15
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.13
310 0.14
311 0.14
312 0.17
313 0.2
314 0.23
315 0.24
316 0.25
317 0.25