Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QXF7

Protein Details
Accession C4QXF7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-97SLCDKVLKNNESKKNKNKKKSKAKKDDNDIAWNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-88SKKNKNKKKSKAKK
Subcellular Location(s) nucl 7.5, mito 7, cyto_nucl 6.5, cyto 4.5, extr 3, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025762  DFDF  
IPR019050  FDF_dom  
IPR047575  Sm  
IPR004443  YjeF_N_dom  
IPR036652  YjeF_N_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0031087  P:deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
GO:0033962  P:P-body assembly  
GO:1900153  P:positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0100  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09532  FDF  
PF03853  YjeF_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51512  DFDF  
PS52002  SM  
PS51385  YJEF_N  
CDD cd00600  Sm_like  
Amino Acid Sequences MSQFLGSTVLLVLKNNKRFQGKIDAVDNKVASLSSVVDLNTETRQSIPDQKIPGRDIAKLEVLSLCDKVLKNNESKKNKNKKKSKAKKDDNDIAWNGDDKLNEEFDFQSNLDKFDKESVFRELSAKDNIDPNLRLAGHNKKVNYDHNEMVVKKEVDTWDNQQSIPTPIAPSRSSTSTFPHLQRQPSIRQPGFGIQLTDGANLLPSCSPVQLLEMERITVDEYKVPIEMLLENVAINVSSIVIKSLGGYARFDQTNHNLPPLILFLVGNNRSGARVLSVGRRLVNIGARCVAILTNTNSDELIDSVKRQSTIFTKFGGRLVYDINQLTVLLDSLQSPLEFVVDGLQGYDNHLDDLFGVELTTSNSLIEWVNQQYVNVLSLDIPSGLEPSSAHINSENAFLQSKFIVSVGLPLNGVLNAYKEGGVLTPGDCIHYLVDLSVPRAIFKKGSLRKFDRDWFEDKGFIELFIKQTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.42
3 0.48
4 0.51
5 0.52
6 0.55
7 0.57
8 0.54
9 0.52
10 0.57
11 0.57
12 0.53
13 0.57
14 0.52
15 0.41
16 0.35
17 0.29
18 0.2
19 0.15
20 0.14
21 0.09
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.13
31 0.15
32 0.18
33 0.27
34 0.31
35 0.35
36 0.41
37 0.45
38 0.5
39 0.51
40 0.54
41 0.46
42 0.44
43 0.41
44 0.38
45 0.38
46 0.31
47 0.3
48 0.24
49 0.24
50 0.23
51 0.2
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.21
56 0.28
57 0.31
58 0.39
59 0.48
60 0.58
61 0.63
62 0.73
63 0.79
64 0.82
65 0.87
66 0.89
67 0.9
68 0.91
69 0.92
70 0.94
71 0.94
72 0.94
73 0.95
74 0.94
75 0.93
76 0.92
77 0.86
78 0.82
79 0.72
80 0.63
81 0.53
82 0.44
83 0.36
84 0.28
85 0.22
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.16
90 0.17
91 0.17
92 0.16
93 0.18
94 0.17
95 0.21
96 0.2
97 0.22
98 0.22
99 0.21
100 0.21
101 0.25
102 0.28
103 0.23
104 0.25
105 0.28
106 0.28
107 0.28
108 0.3
109 0.24
110 0.25
111 0.27
112 0.26
113 0.22
114 0.25
115 0.25
116 0.27
117 0.26
118 0.24
119 0.24
120 0.24
121 0.23
122 0.24
123 0.31
124 0.35
125 0.38
126 0.37
127 0.37
128 0.41
129 0.48
130 0.5
131 0.46
132 0.4
133 0.4
134 0.44
135 0.39
136 0.38
137 0.36
138 0.29
139 0.24
140 0.26
141 0.23
142 0.2
143 0.23
144 0.25
145 0.27
146 0.28
147 0.27
148 0.24
149 0.24
150 0.25
151 0.22
152 0.18
153 0.13
154 0.13
155 0.17
156 0.17
157 0.18
158 0.19
159 0.21
160 0.22
161 0.22
162 0.24
163 0.26
164 0.31
165 0.3
166 0.36
167 0.38
168 0.39
169 0.42
170 0.43
171 0.44
172 0.46
173 0.53
174 0.45
175 0.41
176 0.4
177 0.38
178 0.37
179 0.31
180 0.24
181 0.15
182 0.18
183 0.17
184 0.16
185 0.13
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.15
240 0.17
241 0.24
242 0.24
243 0.24
244 0.21
245 0.2
246 0.21
247 0.18
248 0.15
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.13
253 0.14
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.14
264 0.16
265 0.18
266 0.18
267 0.18
268 0.18
269 0.18
270 0.21
271 0.17
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.14
276 0.14
277 0.12
278 0.08
279 0.1
280 0.11
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.11
288 0.11
289 0.09
290 0.09
291 0.11
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.15
296 0.18
297 0.24
298 0.25
299 0.25
300 0.26
301 0.26
302 0.29
303 0.27
304 0.22
305 0.17
306 0.18
307 0.17
308 0.18
309 0.17
310 0.15
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.1
315 0.08
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.1
334 0.12
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.1
341 0.08
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.06
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.11
355 0.12
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.16
360 0.16
361 0.16
362 0.12
363 0.11
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.07
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.09
375 0.16
376 0.16
377 0.17
378 0.17
379 0.18
380 0.19
381 0.22
382 0.2
383 0.14
384 0.16
385 0.15
386 0.16
387 0.15
388 0.14
389 0.12
390 0.11
391 0.1
392 0.08
393 0.14
394 0.15
395 0.15
396 0.15
397 0.14
398 0.15
399 0.14
400 0.14
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.11
413 0.11
414 0.12
415 0.12
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.12
420 0.09
421 0.13
422 0.12
423 0.14
424 0.16
425 0.15
426 0.16
427 0.18
428 0.2
429 0.19
430 0.22
431 0.31
432 0.37
433 0.46
434 0.55
435 0.6
436 0.65
437 0.71
438 0.75
439 0.73
440 0.69
441 0.66
442 0.62
443 0.58
444 0.55
445 0.48
446 0.44
447 0.35
448 0.31
449 0.28
450 0.24