FuNGI

A0A2B7Z6Y5

Protein Details

Accession

A0A2B7Z6Y5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-51	GPFMKVRRPKADPLVRPKKRPIPRPPGQAQPG	Hydrophilic
530-550	GTDTSRKKPKSKHADAQPESR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-46	PPARRPPGPSGPFMKVRRPKADPLVRPKKRPIPRPPG
418-434	KEALKNFGKRVRKALQR
499-522	GRPKHTDPLNKKATSRAARKRAGS
534-577	SRKKPKSKHADAQPESRPMSPGPSGQRKPGAAGDQASKKRGRNG

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSTPPNPPPPARRPPGPSGPFMKVRRPKADPLVRPKKRPIPRPPGQAQPGAGPVANGIVAARPRPPQTAPRPQPSATQSKPTIPSADDLTVNGFSGPLLSESYVDYPVVTTKRAWREGLKHHVAKFASKKSIDPRDELQFTRPVRLQRRDPRASNIGPAADKDDQPPRRPGELNEAEREELEAKKAVREKERAENLAQIAPSAAVTQKKTNAPKQRTQQVFKSEMTPEEIARARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSETYAMFVLQNDGKMRMVPIDKWYKFTTKSPFKTLTIEEAEKFMAKKIKDPRWFMEKEQDRAQKKALEGYAKQSKLFTGRREGFSGAGEGFEGDDLDFEEDRFADDEEHVGIFDEDEDAKTAEKRIKEDQLKANIFDLKDEKMYDEEENQEKKEKEALKNFGKRVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDESSEDSETERLKEEQEKLEEEHVKKEKGKESDKNSGASTKGTNTPSGRPKHTDPLNKKATSRAARKRAGSPNLSEASGTDTSRKKPKSKHADAQPESRPMSPGPSGQRKPGAAGDQASKKRGRNGPAGSGSGSDGERGAGSGGEMSDSTTAGAKKLKLNPPGLKSKTGTPRGSRAGSPAGVLPTRTGPGSGANSPGPQTRTSTPGPTTPSNLTFPTPSEIHSAIPSTGIASAELLKIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDKLLRPGVLKDGSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.75
3	0.77
4	0.72
5	0.69
6	0.65
7	0.65
8	0.66
9	0.63
10	0.64
11	0.63
12	0.67
13	0.69
14	0.69
15	0.71
16	0.72
17	0.78
18	0.77
19	0.79
20	0.82
21	0.81
22	0.83
23	0.85
24	0.84
25	0.83
26	0.84
27	0.84
28	0.83
29	0.85
30	0.87
31	0.83
32	0.83
33	0.79
34	0.73
35	0.64
36	0.56
37	0.5
38	0.41
39	0.35
40	0.24
41	0.19
42	0.15
43	0.13
44	0.1
45	0.07
46	0.09
47	0.11
48	0.12
49	0.16
50	0.2
51	0.23
52	0.27
53	0.31
54	0.38
55	0.46
56	0.56
57	0.61
58	0.65
59	0.68
60	0.65
61	0.69
62	0.65
63	0.65
64	0.57
65	0.58
66	0.52
67	0.53
68	0.56
69	0.51
70	0.48
71	0.39
72	0.37
73	0.33
74	0.33
75	0.26
76	0.23
77	0.23
78	0.2
79	0.19
80	0.16
81	0.12
82	0.09
83	0.09
84	0.09
85	0.07
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.1
90	0.12
91	0.13
92	0.12
93	0.11
94	0.1
95	0.15
96	0.16
97	0.16
98	0.17
99	0.24
100	0.33
101	0.37
102	0.39
103	0.42
104	0.48
105	0.56
106	0.64
107	0.65
108	0.62
109	0.6
110	0.63
111	0.57
112	0.57
113	0.55
114	0.52
115	0.51
116	0.46
117	0.5
118	0.53
119	0.62
120	0.57
121	0.53
122	0.5
123	0.51
124	0.54
125	0.5
126	0.45
127	0.42
128	0.4
129	0.42
130	0.41
131	0.41
132	0.46
133	0.53
134	0.59
135	0.62
136	0.71
137	0.74
138	0.73
139	0.72
140	0.71
141	0.65
142	0.59
143	0.51
144	0.44
145	0.36
146	0.33
147	0.32
148	0.26
149	0.25
150	0.24
151	0.31
152	0.34
153	0.38
154	0.44
155	0.43
156	0.46
157	0.47
158	0.46
159	0.47
160	0.51
161	0.51
162	0.49
163	0.46
164	0.41
165	0.39
166	0.38
167	0.29
168	0.2
169	0.18
170	0.17
171	0.15
172	0.2
173	0.25
174	0.29
175	0.34
176	0.39
177	0.42
178	0.48
179	0.54
180	0.52
181	0.49
182	0.48
183	0.43
184	0.39
185	0.34
186	0.24
187	0.18
188	0.15
189	0.13
190	0.1
191	0.1
192	0.11
193	0.13
194	0.17
195	0.22
196	0.28
197	0.35
198	0.43
199	0.51
200	0.55
201	0.61
202	0.67
203	0.71
204	0.72
205	0.71
206	0.69
207	0.66
208	0.64
209	0.56
210	0.52
211	0.44
212	0.37
213	0.36
214	0.3
215	0.22
216	0.22
217	0.23
218	0.21
219	0.22
220	0.21
221	0.18
222	0.18
223	0.19
224	0.16
225	0.17
226	0.19
227	0.2
228	0.23
229	0.23
230	0.22
231	0.22
232	0.21
233	0.18
234	0.15
235	0.16
236	0.15
237	0.14
238	0.13
239	0.13
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.08
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.07
259	0.07
260	0.09
261	0.1
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.12
266	0.13
267	0.13
268	0.13
269	0.19
270	0.28
271	0.28
272	0.32
273	0.34
274	0.34
275	0.35
276	0.39
277	0.43
278	0.43
279	0.46
280	0.49
281	0.5
282	0.48
283	0.49
284	0.44
285	0.4
286	0.34
287	0.32
288	0.26
289	0.23
290	0.22
291	0.2
292	0.19
293	0.16
294	0.16
295	0.15
296	0.21
297	0.29
298	0.38
299	0.45
300	0.49
301	0.51
302	0.54
303	0.56
304	0.51
305	0.52
306	0.49
307	0.45
308	0.49
309	0.53
310	0.47
311	0.46
312	0.47
313	0.4
314	0.35
315	0.36
316	0.3
317	0.27
318	0.25
319	0.31
320	0.35
321	0.33
322	0.33
323	0.28
324	0.26
325	0.29
326	0.32
327	0.27
328	0.29
329	0.32
330	0.34
331	0.36
332	0.35
333	0.29
334	0.25
335	0.24
336	0.14
337	0.11
338	0.08
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.08
372	0.11
373	0.12
374	0.15
375	0.19
376	0.27
377	0.32
378	0.38
379	0.42
380	0.48
381	0.48
382	0.45
383	0.43
384	0.37
385	0.32
386	0.28
387	0.23
388	0.15
389	0.15
390	0.14
391	0.13
392	0.11
393	0.13
394	0.12
395	0.12
396	0.15
397	0.19
398	0.21
399	0.21
400	0.26
401	0.24
402	0.24
403	0.29
404	0.32
405	0.33
406	0.39
407	0.46
408	0.49
409	0.56
410	0.59
411	0.6
412	0.6
413	0.56
414	0.56
415	0.56
416	0.57
417	0.59
418	0.67
419	0.7
420	0.74
421	0.78
422	0.78
423	0.73
424	0.69
425	0.61
426	0.53
427	0.48
428	0.39
429	0.36
430	0.3
431	0.27
432	0.22
433	0.21
434	0.19
435	0.14
436	0.13
437	0.11
438	0.09
439	0.1
440	0.11
441	0.14
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.14
446	0.14
447	0.14
448	0.15
449	0.12
450	0.14
451	0.19
452	0.21
453	0.24
454	0.26
455	0.27
456	0.27
457	0.33
458	0.37
459	0.33
460	0.38
461	0.37
462	0.38
463	0.39
464	0.44
465	0.44
466	0.45
467	0.52
468	0.52
469	0.55
470	0.62
471	0.61
472	0.57
473	0.51
474	0.46
475	0.39
476	0.32
477	0.27
478	0.2
479	0.23
480	0.23
481	0.26
482	0.26
483	0.32
484	0.38
485	0.42
486	0.44
487	0.43
488	0.46
489	0.5
490	0.56
491	0.59
492	0.58
493	0.62
494	0.67
495	0.64
496	0.6
497	0.57
498	0.58
499	0.57
500	0.6
501	0.61
502	0.61
503	0.65
504	0.67
505	0.7
506	0.7
507	0.69
508	0.62
509	0.55
510	0.53
511	0.49
512	0.45
513	0.36
514	0.27
515	0.26
516	0.24
517	0.21
518	0.2
519	0.22
520	0.27
521	0.36
522	0.42
523	0.43
524	0.5
525	0.6
526	0.66
527	0.72
528	0.77
529	0.78
530	0.84
531	0.8
532	0.8
533	0.75
534	0.69
535	0.61
536	0.53
537	0.44
538	0.33
539	0.34
540	0.28
541	0.28
542	0.3
543	0.39
544	0.4
545	0.43
546	0.48
547	0.43
548	0.44
549	0.43
550	0.38
551	0.31
552	0.32
553	0.33
554	0.37
555	0.4
556	0.41
557	0.42
558	0.4
559	0.47
560	0.5
561	0.5
562	0.5
563	0.52
564	0.56
565	0.55
566	0.54
567	0.46
568	0.41
569	0.35
570	0.28
571	0.23
572	0.15
573	0.11
574	0.1
575	0.09
576	0.08
577	0.08
578	0.05
579	0.05
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.1
589	0.1
590	0.11
591	0.15
592	0.17
593	0.24
594	0.33
595	0.4
596	0.45
597	0.53
598	0.58
599	0.61
600	0.69
601	0.65
602	0.62
603	0.57
604	0.58
605	0.59
606	0.61
607	0.61
608	0.56
609	0.6
610	0.61
611	0.62
612	0.54
613	0.49
614	0.45
615	0.39
616	0.35
617	0.3
618	0.27
619	0.25
620	0.24
621	0.21
622	0.18
623	0.19
624	0.18
625	0.16
626	0.13
627	0.17
628	0.21
629	0.21
630	0.23
631	0.23
632	0.24
633	0.26
634	0.3
635	0.27
636	0.23
637	0.27
638	0.26
639	0.3
640	0.32
641	0.36
642	0.34
643	0.37
644	0.42
645	0.4
646	0.42
647	0.41
648	0.42
649	0.39
650	0.38
651	0.35
652	0.31
653	0.3
654	0.31
655	0.26
656	0.24
657	0.26
658	0.25
659	0.24
660	0.24
661	0.24
662	0.19
663	0.19
664	0.18
665	0.13
666	0.13
667	0.12
668	0.11
669	0.1
670	0.11
671	0.12
672	0.13
673	0.12
674	0.13
675	0.17
676	0.18
677	0.2
678	0.22
679	0.25
680	0.33
681	0.4
682	0.45
683	0.46
684	0.56
685	0.65
686	0.64
687	0.63
688	0.55
689	0.49
690	0.44
691	0.48
692	0.46
693	0.4
694	0.39
695	0.38
696	0.39
697	0.38
698	0.37
699	0.3
700	0.24
701	0.22
702	0.21
703	0.21
704	0.24
705	0.27
706	0.32
707	0.34
708	0.33
709	0.34
710	0.35
711	0.4

A0A2B7Z6Y5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer