Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P397

Protein Details
Accession J3P397    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
364-386RTPATPKPRGFRRPATPARQVRQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
334-378RPGHASAHGSRRPGHASAHGSRRPRAVGSARTPATPKPRGFRRPA
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034158  SF3B4_RRM1  
IPR034159  SF3B4_RRM2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12334  RRM1_SF3B4  
cd12335  RRM2_SF3B4  
Amino Acid Sequences MANRHWEQNKEATIYVGNLDERFGESLMWEMMTQMGPVVNLHMPMDRVSRTHQGYGFVEFDSPESADYAARALNGIRVYGKVIRVNKASADKQRAAEIGAELFVNNLDPQVDEKTLFDTFSRFGQLVTPPNVVRDANNISKGYGFVNFDSFEASDQARDTMNGQYLLSKQITVEYAYKKDGKGERHGDDAERKLAAEGKKHNIVPEQQPLPPAFLMTAPPPTTPATPTGPASAGPGAPAGAPPGFDSANTGRPGGVPGGPGGPPPMLPPGGIPQGYAPPPLSAHGGPMPPRGGPPPSFGGPPHHHNSHHHPHHGGPHHHMGPPGRPWWQSHGWRPGHASAHGSRRPGHASAHGSRRPRAVGSARTPATPKPRGFRRPATPARQVRQGMMVVPRVFVYCPVSCGWGLLRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.28
3 0.23
4 0.19
5 0.16
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.16
10 0.14
11 0.11
12 0.1
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.12
29 0.13
30 0.13
31 0.15
32 0.19
33 0.17
34 0.18
35 0.22
36 0.3
37 0.32
38 0.36
39 0.36
40 0.37
41 0.37
42 0.39
43 0.35
44 0.28
45 0.25
46 0.2
47 0.19
48 0.15
49 0.14
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.15
66 0.18
67 0.22
68 0.24
69 0.28
70 0.32
71 0.34
72 0.35
73 0.36
74 0.4
75 0.43
76 0.45
77 0.49
78 0.47
79 0.46
80 0.47
81 0.43
82 0.37
83 0.32
84 0.24
85 0.17
86 0.13
87 0.12
88 0.09
89 0.09
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.07
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.14
102 0.14
103 0.15
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.15
109 0.12
110 0.11
111 0.14
112 0.18
113 0.21
114 0.24
115 0.25
116 0.23
117 0.24
118 0.26
119 0.24
120 0.2
121 0.2
122 0.22
123 0.23
124 0.26
125 0.26
126 0.24
127 0.24
128 0.24
129 0.2
130 0.17
131 0.15
132 0.11
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.13
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.16
154 0.15
155 0.12
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.16
161 0.16
162 0.17
163 0.2
164 0.22
165 0.21
166 0.26
167 0.29
168 0.29
169 0.34
170 0.39
171 0.38
172 0.39
173 0.4
174 0.36
175 0.36
176 0.33
177 0.27
178 0.2
179 0.19
180 0.15
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.22
185 0.24
186 0.28
187 0.29
188 0.29
189 0.27
190 0.3
191 0.29
192 0.31
193 0.29
194 0.25
195 0.27
196 0.26
197 0.25
198 0.21
199 0.17
200 0.11
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.16
212 0.15
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.13
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.11
234 0.12
235 0.17
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.16
240 0.17
241 0.15
242 0.14
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.13
257 0.16
258 0.16
259 0.15
260 0.14
261 0.17
262 0.18
263 0.19
264 0.15
265 0.13
266 0.13
267 0.14
268 0.16
269 0.12
270 0.14
271 0.16
272 0.18
273 0.18
274 0.21
275 0.21
276 0.18
277 0.2
278 0.2
279 0.21
280 0.2
281 0.23
282 0.24
283 0.25
284 0.26
285 0.26
286 0.31
287 0.32
288 0.36
289 0.39
290 0.38
291 0.39
292 0.43
293 0.51
294 0.53
295 0.55
296 0.53
297 0.49
298 0.48
299 0.55
300 0.58
301 0.53
302 0.48
303 0.49
304 0.48
305 0.48
306 0.48
307 0.42
308 0.39
309 0.4
310 0.38
311 0.34
312 0.33
313 0.34
314 0.38
315 0.45
316 0.47
317 0.51
318 0.57
319 0.55
320 0.56
321 0.58
322 0.56
323 0.51
324 0.44
325 0.41
326 0.36
327 0.43
328 0.44
329 0.42
330 0.39
331 0.4
332 0.42
333 0.39
334 0.37
335 0.34
336 0.38
337 0.43
338 0.51
339 0.52
340 0.52
341 0.53
342 0.55
343 0.5
344 0.44
345 0.44
346 0.42
347 0.46
348 0.47
349 0.54
350 0.51
351 0.5
352 0.51
353 0.5
354 0.52
355 0.51
356 0.5
357 0.5
358 0.59
359 0.66
360 0.72
361 0.75
362 0.75
363 0.78
364 0.82
365 0.81
366 0.81
367 0.82
368 0.79
369 0.79
370 0.71
371 0.62
372 0.58
373 0.51
374 0.45
375 0.4
376 0.42
377 0.34
378 0.32
379 0.31
380 0.27
381 0.26
382 0.24
383 0.24
384 0.18
385 0.2
386 0.2
387 0.23
388 0.21
389 0.23