Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PFR0

Protein Details
Accession J3PFR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-101EVDTGSRGRKPQKKRKRDDAAAPVDEBasic
480-511DKAARKQQKREMLESKKGKKKGKTNGGGGKEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-92RGRKPQKKRKR
483-507ARKQQKREMLESKKGKKKGKTNGGG
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR014816  tRNA_MeTrfase_Gcd14  
Gene Ontology GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0016429  F:tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08704  GCD14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51620  SAM_TRM61  
Amino Acid Sequences MARVPSPFLHLGSQTTANSLAIIHLSRDRLQPLYLEEIDGEHDGYAEGAVLNTRFGSFPHSTFINVPWGSQVRASEVDTGSRGRKPQKKRKRDDAAAPVDETAAGTGGDVVTEVNGGGKGAKKAVAASSGFVHILAPSPELWTSSLPHRTQVVYTPDYSYILQRIRARPGSRLIEAGAGSGSFTHASARAVYNGVGGGPADNPNTGRGQVFSFEFNEPRYKKMCTEVAAHKLGRIVRVTHRDVYNDGFLVDGKSPGADAVFLDLPKPWEALPHLSRRRYKSAATPNQDEGDSMDAAQKAVDETFVSPLNPNKSTHLCTFSPCIEQVSRTVSMMRQLGWMDIETVEIANKRIHVMREKVGLTVATDKGMAQAPVDVSEAVERLRRIEERVREHQKAIHDPDVDDVEEHLKENFDDDAAVESNKLPPFMQGRLVTRPESEMRSHTSYLTFAVLPREWTAEDEAAALASWPCGQEKQVIGSLDKAARKQQKREMLESKKGKKKGKTNGGGGKEAAAAVGEDTVMGDATATPEYGAQHAKRDLEKDEVTEQGATPKRPKQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.24
4 0.2
5 0.19
6 0.16
7 0.13
8 0.12
9 0.12
10 0.13
11 0.15
12 0.19
13 0.22
14 0.26
15 0.28
16 0.27
17 0.28
18 0.27
19 0.27
20 0.31
21 0.29
22 0.25
23 0.22
24 0.21
25 0.22
26 0.21
27 0.17
28 0.1
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.06
34 0.05
35 0.05
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.16
44 0.17
45 0.18
46 0.21
47 0.22
48 0.23
49 0.24
50 0.26
51 0.28
52 0.25
53 0.24
54 0.26
55 0.28
56 0.27
57 0.27
58 0.26
59 0.21
60 0.23
61 0.25
62 0.24
63 0.22
64 0.24
65 0.23
66 0.26
67 0.25
68 0.26
69 0.31
70 0.36
71 0.44
72 0.53
73 0.63
74 0.71
75 0.79
76 0.85
77 0.9
78 0.91
79 0.91
80 0.9
81 0.89
82 0.87
83 0.78
84 0.69
85 0.58
86 0.47
87 0.38
88 0.28
89 0.17
90 0.09
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.06
105 0.09
106 0.1
107 0.12
108 0.14
109 0.13
110 0.15
111 0.16
112 0.19
113 0.17
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.16
118 0.15
119 0.13
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.13
131 0.18
132 0.26
133 0.25
134 0.27
135 0.28
136 0.28
137 0.28
138 0.32
139 0.32
140 0.27
141 0.28
142 0.27
143 0.26
144 0.27
145 0.26
146 0.21
147 0.2
148 0.19
149 0.24
150 0.28
151 0.31
152 0.36
153 0.43
154 0.43
155 0.41
156 0.47
157 0.46
158 0.41
159 0.38
160 0.32
161 0.27
162 0.26
163 0.22
164 0.14
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.24
204 0.23
205 0.25
206 0.26
207 0.25
208 0.25
209 0.29
210 0.32
211 0.26
212 0.31
213 0.34
214 0.37
215 0.4
216 0.38
217 0.33
218 0.32
219 0.31
220 0.27
221 0.22
222 0.19
223 0.21
224 0.28
225 0.3
226 0.32
227 0.32
228 0.31
229 0.31
230 0.3
231 0.25
232 0.19
233 0.16
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.03
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.07
255 0.08
256 0.1
257 0.16
258 0.19
259 0.27
260 0.33
261 0.38
262 0.44
263 0.47
264 0.52
265 0.48
266 0.46
267 0.46
268 0.51
269 0.54
270 0.54
271 0.52
272 0.48
273 0.46
274 0.44
275 0.35
276 0.25
277 0.18
278 0.13
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.04
289 0.05
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.12
295 0.16
296 0.17
297 0.17
298 0.2
299 0.23
300 0.26
301 0.27
302 0.29
303 0.26
304 0.26
305 0.28
306 0.26
307 0.25
308 0.21
309 0.21
310 0.17
311 0.17
312 0.16
313 0.18
314 0.17
315 0.15
316 0.16
317 0.13
318 0.17
319 0.17
320 0.16
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.1
337 0.12
338 0.15
339 0.2
340 0.23
341 0.25
342 0.3
343 0.3
344 0.29
345 0.27
346 0.24
347 0.2
348 0.2
349 0.17
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.13
355 0.12
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.1
367 0.09
368 0.1
369 0.13
370 0.14
371 0.18
372 0.25
373 0.33
374 0.38
375 0.48
376 0.55
377 0.54
378 0.55
379 0.54
380 0.52
381 0.52
382 0.5
383 0.46
384 0.39
385 0.37
386 0.37
387 0.36
388 0.3
389 0.22
390 0.17
391 0.14
392 0.13
393 0.13
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.09
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.14
408 0.15
409 0.15
410 0.13
411 0.16
412 0.19
413 0.21
414 0.27
415 0.26
416 0.29
417 0.35
418 0.38
419 0.36
420 0.33
421 0.35
422 0.32
423 0.31
424 0.3
425 0.27
426 0.3
427 0.34
428 0.34
429 0.31
430 0.29
431 0.26
432 0.24
433 0.23
434 0.17
435 0.14
436 0.17
437 0.17
438 0.18
439 0.18
440 0.19
441 0.17
442 0.18
443 0.21
444 0.16
445 0.16
446 0.15
447 0.13
448 0.11
449 0.11
450 0.09
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.1
458 0.15
459 0.17
460 0.2
461 0.24
462 0.26
463 0.25
464 0.27
465 0.3
466 0.31
467 0.31
468 0.29
469 0.34
470 0.42
471 0.49
472 0.55
473 0.6
474 0.65
475 0.68
476 0.75
477 0.77
478 0.76
479 0.78
480 0.8
481 0.81
482 0.8
483 0.83
484 0.82
485 0.81
486 0.82
487 0.82
488 0.83
489 0.82
490 0.83
491 0.84
492 0.8
493 0.74
494 0.65
495 0.55
496 0.44
497 0.35
498 0.25
499 0.16
500 0.1
501 0.07
502 0.07
503 0.05
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.09
516 0.1
517 0.13
518 0.2
519 0.2
520 0.26
521 0.3
522 0.35
523 0.38
524 0.4
525 0.41
526 0.41
527 0.42
528 0.39
529 0.39
530 0.36
531 0.33
532 0.31
533 0.28
534 0.29
535 0.33
536 0.33
537 0.38