Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NTX0

Protein Details
Accession J3NTX0    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-26VAVFKKRGAKAKANIRKRAAHydrophilic
44-69SSEDETGQRVKRRKRNKHGAAATTFPHydrophilic
310-335NNAKRLQKLLDRKRERAAKRRGEAGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-24KKRGAKAKANIRKR
53-61VKRRKRNKH
319-331LDRKRERAAKRRG
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MEAPAPVAVFKKRGAKAKANIRKRAATLAAATAADGSESSDYSSSEDETGQRVKRRKRNKHGAAATTFPGPGPRGSSSSDDDLSATVFRADRSVPITDSNDATKQSNWFDEDDADDALSAKNLLGSTRARSGDSRQADDGLYRGLANKASFVQKNPDAPSRTVGPIKAPTNIRTVTVTDFAPDVCKDYKQTGFCGFGDNCKYLHAREDYKAGWQLDREWENVAQGKKNMGGTVVASAADRGKNNKAKDDDDDDDALLESIPFACIICRESYKQPVVTRCGHYFCEPCALKRYRRDPTCAACGSGTNGVFNNAKRLQKLLDRKRERAAKRRGEAGEEVGDEEEEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.57
3 0.63
4 0.72
5 0.78
6 0.78
7 0.82
8 0.79
9 0.77
10 0.7
11 0.68
12 0.6
13 0.53
14 0.45
15 0.38
16 0.34
17 0.28
18 0.25
19 0.18
20 0.15
21 0.11
22 0.09
23 0.07
24 0.06
25 0.07
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.13
35 0.16
36 0.23
37 0.26
38 0.33
39 0.4
40 0.5
41 0.58
42 0.68
43 0.75
44 0.8
45 0.86
46 0.89
47 0.91
48 0.9
49 0.88
50 0.81
51 0.73
52 0.63
53 0.53
54 0.43
55 0.32
56 0.26
57 0.19
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.18
62 0.21
63 0.25
64 0.26
65 0.28
66 0.28
67 0.24
68 0.22
69 0.2
70 0.18
71 0.14
72 0.11
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.14
80 0.15
81 0.15
82 0.18
83 0.2
84 0.2
85 0.21
86 0.22
87 0.21
88 0.2
89 0.21
90 0.19
91 0.19
92 0.2
93 0.21
94 0.2
95 0.19
96 0.18
97 0.18
98 0.17
99 0.16
100 0.14
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.04
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.08
112 0.1
113 0.12
114 0.17
115 0.18
116 0.18
117 0.2
118 0.24
119 0.3
120 0.31
121 0.31
122 0.27
123 0.27
124 0.26
125 0.24
126 0.21
127 0.12
128 0.1
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.21
140 0.22
141 0.26
142 0.28
143 0.32
144 0.3
145 0.3
146 0.31
147 0.28
148 0.28
149 0.25
150 0.23
151 0.19
152 0.22
153 0.22
154 0.24
155 0.23
156 0.23
157 0.26
158 0.26
159 0.24
160 0.2
161 0.2
162 0.17
163 0.17
164 0.15
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.15
175 0.19
176 0.19
177 0.21
178 0.22
179 0.24
180 0.23
181 0.27
182 0.24
183 0.23
184 0.25
185 0.23
186 0.2
187 0.2
188 0.2
189 0.15
190 0.2
191 0.21
192 0.21
193 0.21
194 0.25
195 0.23
196 0.26
197 0.3
198 0.26
199 0.23
200 0.2
201 0.21
202 0.24
203 0.25
204 0.23
205 0.2
206 0.19
207 0.2
208 0.24
209 0.24
210 0.2
211 0.19
212 0.2
213 0.2
214 0.2
215 0.18
216 0.14
217 0.13
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.11
226 0.12
227 0.14
228 0.22
229 0.28
230 0.3
231 0.37
232 0.39
233 0.39
234 0.43
235 0.47
236 0.41
237 0.38
238 0.37
239 0.3
240 0.26
241 0.24
242 0.19
243 0.12
244 0.09
245 0.05
246 0.04
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.08
253 0.11
254 0.14
255 0.18
256 0.23
257 0.31
258 0.35
259 0.4
260 0.43
261 0.46
262 0.49
263 0.51
264 0.52
265 0.49
266 0.48
267 0.45
268 0.44
269 0.41
270 0.36
271 0.4
272 0.35
273 0.33
274 0.39
275 0.43
276 0.45
277 0.53
278 0.61
279 0.61
280 0.65
281 0.7
282 0.68
283 0.69
284 0.71
285 0.63
286 0.55
287 0.45
288 0.41
289 0.37
290 0.35
291 0.28
292 0.21
293 0.2
294 0.21
295 0.24
296 0.23
297 0.29
298 0.29
299 0.33
300 0.32
301 0.35
302 0.36
303 0.43
304 0.53
305 0.56
306 0.61
307 0.66
308 0.69
309 0.76
310 0.81
311 0.81
312 0.8
313 0.81
314 0.8
315 0.77
316 0.81
317 0.74
318 0.69
319 0.63
320 0.58
321 0.51
322 0.41
323 0.37
324 0.28