FuNGI

J3P9C1

Protein Details

Accession

J3P9C1

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
45-73	VGPAPAPKGTKRKRRSREKDDGRRAQQEV	Basic
103-130	ASGKSAKDGDDKKKKKQKKADSDASTTE	Hydrophilic
163-189	RPEAEEDGKKKKKKRKKLSKGEGEAAT	Basic
606-625	DVSKKDRKTLRERGVESRRS	Basic
628-652	AKARITSKSTWERRRENNRRGAIEG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
50-65	APKGTKRKRRSREKDD
111-121	GDDKKKKKQKK
170-183	GKKKKKKRKKLSKG
609-658	KKDRKTLRERGVESRRSGAAKARITSKSTWERRRENNRRGAIEGSKKRKK

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044764 DDX52/Rok1_DEADc IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1
CDD	cd17957 DEADc_DDX52

Amino Acid Sequences

MDILKVLSRGTKLQSKRPSGSAAPARADLPSAGVETNPQLYHDDVGPAPAPKGTKRKRRSREKDDGRRAQQEVDGETDEDEEQLSDIDFFAPKNRPGQGDDAASGKSAKDGDDKKKKKQKKADSDASTTEPLELDECKHIMRSHRLKFTLLRLQQPEKESASRPEAEEDGKKKKKKRKKLSKGEGEAATAPPLSDEKKQICPQPLVSFSELRRTYRISPRLADNLARDGYKVPTEVQLGSLPLLLRPEFALGCCEGVAVDGCGVHFLAVAPTGSGKTLSFLIPAINGVLKRRAERGGGDGDGGDRHALEAIVVAPTRELASQIANEGRKLAAGTGVRVVLMRKGMRVAASAAQGASADGEDLFESEAESSSGEEDEQQDESGSRPKKAAGAARNPTKADVLVTTPMLLLNFISEGGSSKKLPDVRSLILDEADVLLDPLFRDQTVGIWSACRNPELRVTFWSATMPSSIEVLMFDRLRAHHSDSGSNDSTTAPPLVRLVVGLKDTAVPNISHRLIYTATEAGKLLAIRQLLHPSSFSSSSPTQGSSGAAAAAAAADAPLRPPFLVFTQTSVANVIALSEKQAAAGSGVGAGAGAGAQKWLLDSLPDVSKKDRKTLRERGVESRRSGAAKARITSKSTWERRRENNRRGAIEGSKKRKKALLDDASAEHDDGEEWGGIDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.61
3	0.63
4	0.63
5	0.64
6	0.58
7	0.62
8	0.61
9	0.57
10	0.51
11	0.48
12	0.45
13	0.38
14	0.37
15	0.27
16	0.2
17	0.15
18	0.14
19	0.12
20	0.12
21	0.13
22	0.14
23	0.18
24	0.16
25	0.16
26	0.17
27	0.18
28	0.2
29	0.19
30	0.2
31	0.16
32	0.19
33	0.2
34	0.19
35	0.18
36	0.18
37	0.2
38	0.24
39	0.35
40	0.42
41	0.51
42	0.6
43	0.71
44	0.79
45	0.88
46	0.92
47	0.92
48	0.93
49	0.94
50	0.95
51	0.95
52	0.94
53	0.91
54	0.87
55	0.78
56	0.7
57	0.61
58	0.53
59	0.44
60	0.38
61	0.31
62	0.24
63	0.23
64	0.21
65	0.18
66	0.15
67	0.13
68	0.09
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.06
73	0.06
74	0.07
75	0.08
76	0.08
77	0.14
78	0.18
79	0.21
80	0.25
81	0.28
82	0.3
83	0.32
84	0.38
85	0.36
86	0.34
87	0.33
88	0.3
89	0.27
90	0.25
91	0.22
92	0.16
93	0.14
94	0.12
95	0.12
96	0.19
97	0.27
98	0.37
99	0.48
100	0.54
101	0.63
102	0.73
103	0.81
104	0.83
105	0.86
106	0.87
107	0.87
108	0.91
109	0.91
110	0.87
111	0.83
112	0.76
113	0.69
114	0.6
115	0.48
116	0.38
117	0.28
118	0.21
119	0.17
120	0.14
121	0.12
122	0.13
123	0.14
124	0.13
125	0.16
126	0.18
127	0.24
128	0.33
129	0.41
130	0.46
131	0.53
132	0.55
133	0.56
134	0.57
135	0.59
136	0.58
137	0.53
138	0.52
139	0.5
140	0.54
141	0.56
142	0.54
143	0.5
144	0.44
145	0.44
146	0.39
147	0.38
148	0.38
149	0.35
150	0.33
151	0.31
152	0.29
153	0.29
154	0.33
155	0.34
156	0.4
157	0.46
158	0.52
159	0.59
160	0.67
161	0.75
162	0.79
163	0.84
164	0.85
165	0.88
166	0.93
167	0.95
168	0.95
169	0.92
170	0.87
171	0.77
172	0.67
173	0.57
174	0.46
175	0.36
176	0.25
177	0.17
178	0.11
179	0.12
180	0.12
181	0.13
182	0.18
183	0.21
184	0.29
185	0.33
186	0.38
187	0.42
188	0.43
189	0.43
190	0.43
191	0.43
192	0.39
193	0.37
194	0.36
195	0.31
196	0.38
197	0.36
198	0.32
199	0.31
200	0.31
201	0.36
202	0.41
203	0.47
204	0.41
205	0.42
206	0.45
207	0.47
208	0.45
209	0.41
210	0.34
211	0.32
212	0.29
213	0.26
214	0.22
215	0.19
216	0.19
217	0.17
218	0.16
219	0.12
220	0.14
221	0.15
222	0.15
223	0.15
224	0.14
225	0.13
226	0.13
227	0.13
228	0.1
229	0.09
230	0.11
231	0.09
232	0.08
233	0.08
234	0.1
235	0.08
236	0.08
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.13
276	0.14
277	0.15
278	0.18
279	0.19
280	0.19
281	0.19
282	0.21
283	0.19
284	0.18
285	0.17
286	0.15
287	0.13
288	0.12
289	0.11
290	0.07
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.03
296	0.04
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.04
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.08
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.1
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.1
326	0.07
327	0.1
328	0.1
329	0.09
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.11
334	0.11
335	0.1
336	0.11
337	0.1
338	0.1
339	0.09
340	0.08
341	0.08
342	0.06
343	0.04
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.04
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.15
369	0.15
370	0.15
371	0.15
372	0.16
373	0.18
374	0.22
375	0.27
376	0.27
377	0.35
378	0.41
379	0.47
380	0.49
381	0.47
382	0.44
383	0.38
384	0.31
385	0.22
386	0.16
387	0.12
388	0.11
389	0.11
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.07
395	0.05
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.05
402	0.07
403	0.1
404	0.09
405	0.1
406	0.14
407	0.17
408	0.19
409	0.23
410	0.25
411	0.25
412	0.27
413	0.28
414	0.24
415	0.21
416	0.2
417	0.14
418	0.1
419	0.08
420	0.06
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.06
429	0.05
430	0.07
431	0.09
432	0.1
433	0.1
434	0.11
435	0.12
436	0.15
437	0.16
438	0.16
439	0.15
440	0.15
441	0.23
442	0.24
443	0.26
444	0.24
445	0.3
446	0.29
447	0.28
448	0.28
449	0.21
450	0.18
451	0.17
452	0.15
453	0.09
454	0.09
455	0.08
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.11
460	0.1
461	0.1
462	0.11
463	0.12
464	0.15
465	0.17
466	0.21
467	0.22
468	0.23
469	0.27
470	0.28
471	0.34
472	0.33
473	0.3
474	0.26
475	0.22
476	0.21
477	0.19
478	0.18
479	0.11
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.1
487	0.11
488	0.1
489	0.1
490	0.12
491	0.12
492	0.13
493	0.13
494	0.11
495	0.12
496	0.18
497	0.19
498	0.17
499	0.17
500	0.18
501	0.17
502	0.18
503	0.19
504	0.16
505	0.15
506	0.16
507	0.16
508	0.14
509	0.15
510	0.13
511	0.11
512	0.11
513	0.11
514	0.12
515	0.14
516	0.2
517	0.19
518	0.2
519	0.2
520	0.19
521	0.23
522	0.23
523	0.21
524	0.21
525	0.21
526	0.23
527	0.24
528	0.23
529	0.2
530	0.19
531	0.19
532	0.14
533	0.14
534	0.11
535	0.09
536	0.07
537	0.06
538	0.05
539	0.04
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.05
545	0.06
546	0.07
547	0.07
548	0.08
549	0.1
550	0.12
551	0.17
552	0.16
553	0.19
554	0.2
555	0.21
556	0.21
557	0.2
558	0.18
559	0.13
560	0.12
561	0.1
562	0.09
563	0.09
564	0.1
565	0.11
566	0.11
567	0.11
568	0.11
569	0.1
570	0.09
571	0.1
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.05
576	0.05
577	0.04
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.03
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.11
591	0.18
592	0.21
593	0.23
594	0.29
595	0.37
596	0.39
597	0.47
598	0.5
599	0.53
600	0.61
601	0.69
602	0.73
603	0.75
604	0.77
605	0.78
606	0.81
607	0.79
608	0.72
609	0.66
610	0.6
611	0.52
612	0.49
613	0.47
614	0.45
615	0.44
616	0.45
617	0.48
618	0.47
619	0.49
620	0.5
621	0.52
622	0.54
623	0.58
624	0.64
625	0.66
626	0.71
627	0.78
628	0.87
629	0.88
630	0.88
631	0.88
632	0.87
633	0.81
634	0.75
635	0.71
636	0.69
637	0.68
638	0.68
639	0.69
640	0.7
641	0.68
642	0.69
643	0.68
644	0.65
645	0.64
646	0.65
647	0.64
648	0.6
649	0.62
650	0.59
651	0.59
652	0.53
653	0.44
654	0.32
655	0.23
656	0.17
657	0.14
658	0.13
659	0.09

J3P9C1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer