Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2D3VHE7

Protein Details
Accession A0A2D3VHE7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-250LPSHDDRSSQPRKPKRKRRRIIKSDKLLASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-245PRKPKRKRRRIIK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 7.5, cyto_mito 6.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MRLDTLTRAISPPPTRRVRTTDDDEDKPSIAAIEAGKARIGDHLSYFVTRLSAVARPSIDCPRIGLHDFEDLYTRNQHQHGNHFVVHQHDHPIAGVHYDLRIQFSETSTISFAIPYGLPGNPNSIRPNRIGIETRVHNLWNNLXESASHATGSLLIWDTGEYEVLQRPVKKQPXTDDEMSEEEVHPSTESQSERLFAAFQSRHIRLRLHGTRLPSNYTVVLRLPSHDDRSSQPRKPKRKRRRIIKSDKLLASGSDSESVNLVHENAEENEKENIEAAMASEDEEEVMRINNAYPGSFNTIGSVHQRHWFITLDRTLSGFRKENGASRWTGDWEAFHVLGREHERSIVTGRLADEVMADDGVVKFVGRKMWRPIIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.57
3 0.62
4 0.66
5 0.66
6 0.66
7 0.67
8 0.68
9 0.66
10 0.65
11 0.63
12 0.59
13 0.51
14 0.43
15 0.34
16 0.24
17 0.17
18 0.16
19 0.12
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.2
28 0.16
29 0.16
30 0.18
31 0.19
32 0.2
33 0.2
34 0.17
35 0.15
36 0.13
37 0.12
38 0.12
39 0.14
40 0.14
41 0.17
42 0.18
43 0.19
44 0.23
45 0.3
46 0.29
47 0.26
48 0.27
49 0.26
50 0.29
51 0.29
52 0.27
53 0.21
54 0.25
55 0.25
56 0.24
57 0.24
58 0.2
59 0.21
60 0.24
61 0.24
62 0.23
63 0.25
64 0.3
65 0.31
66 0.38
67 0.42
68 0.42
69 0.42
70 0.39
71 0.38
72 0.37
73 0.36
74 0.3
75 0.27
76 0.22
77 0.21
78 0.2
79 0.19
80 0.15
81 0.13
82 0.12
83 0.08
84 0.08
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.17
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.15
97 0.13
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.16
108 0.16
109 0.19
110 0.23
111 0.25
112 0.27
113 0.28
114 0.32
115 0.27
116 0.3
117 0.3
118 0.27
119 0.3
120 0.3
121 0.3
122 0.27
123 0.26
124 0.24
125 0.22
126 0.22
127 0.16
128 0.15
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.1
151 0.12
152 0.12
153 0.16
154 0.23
155 0.3
156 0.3
157 0.31
158 0.33
159 0.38
160 0.4
161 0.37
162 0.33
163 0.28
164 0.29
165 0.27
166 0.23
167 0.17
168 0.14
169 0.13
170 0.1
171 0.09
172 0.07
173 0.09
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.08
182 0.14
183 0.13
184 0.16
185 0.21
186 0.23
187 0.25
188 0.27
189 0.28
190 0.22
191 0.32
192 0.33
193 0.34
194 0.34
195 0.35
196 0.39
197 0.4
198 0.42
199 0.33
200 0.29
201 0.25
202 0.23
203 0.2
204 0.15
205 0.16
206 0.13
207 0.13
208 0.18
209 0.18
210 0.22
211 0.22
212 0.23
213 0.24
214 0.34
215 0.41
216 0.4
217 0.47
218 0.53
219 0.64
220 0.73
221 0.81
222 0.83
223 0.87
224 0.91
225 0.93
226 0.95
227 0.95
228 0.95
229 0.94
230 0.92
231 0.89
232 0.8
233 0.71
234 0.6
235 0.48
236 0.4
237 0.32
238 0.23
239 0.17
240 0.15
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.09
251 0.12
252 0.11
253 0.13
254 0.15
255 0.14
256 0.14
257 0.13
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.19
281 0.19
282 0.19
283 0.17
284 0.17
285 0.19
286 0.24
287 0.24
288 0.2
289 0.24
290 0.25
291 0.24
292 0.26
293 0.28
294 0.24
295 0.29
296 0.3
297 0.27
298 0.26
299 0.27
300 0.28
301 0.28
302 0.31
303 0.28
304 0.25
305 0.3
306 0.31
307 0.36
308 0.37
309 0.38
310 0.34
311 0.33
312 0.34
313 0.3
314 0.3
315 0.25
316 0.21
317 0.21
318 0.23
319 0.21
320 0.19
321 0.18
322 0.16
323 0.21
324 0.26
325 0.25
326 0.22
327 0.24
328 0.24
329 0.25
330 0.28
331 0.26
332 0.22
333 0.22
334 0.22
335 0.22
336 0.21
337 0.19
338 0.16
339 0.14
340 0.13
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.07
348 0.08
349 0.11
350 0.19
351 0.22
352 0.28
353 0.36