Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2D3VBI1

Protein Details
Accession A0A2D3VBI1    Localization Confidence High Confidence Score 24.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
381-407AMKDAQSKVKRKERRKDNERKQKETVRBasic
754-787LNARPIKKVREAKARKTLRTARRLEKLKKKSEGLHydrophilic
805-829RMSKMMAKAKKGTKKRNPVKVVFAGHydrophilic
848-870VDSRLKKDVRGLKRAEKKGRVRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-327R
388-402KVKRKERRKDNERKQ
499-506ARAKRARK
747-784IKEKLRALNARPIKKVREAKARKTLRTARRLEKLKKKS
807-870SKMMAKAKKGTKKRNPVKVVFAGGHNKGAGRPRGVKGKYKMVDSRLKKDVRGLKRAEKKGRVRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MGQDKKSAKGRLDKYYYLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKFNFLQNARCLIDLCAAPGSWLQVAAEIMPPKSLIVGVDLTPIKPIPKAISFQGDITTDKCRATIRGHLKTWKADCVIHDGAPNVGTAWVQDAFSQNELVLSSLKLATEFLIPNGTFVTKVFRSKDSAKLEWIFKQLFTKVEQTKPPSSRNVSAETFYVCRGFKAPKHLDPRFLDPTHAFSEIEESAPNNEAKVFNPEIKKRKRDGYEEGDWTQFKECSASDFIQTNDPIAVLGSMNKLHFRQEANGDIAQAALDKLPETTEEVRLCCQDLKVLGRKEFKVLLRWRLKARDRFGFRVKKTAKEEAEAAKPAVDAPQVKEGVEGEEVAVVESMDGEMRLQEEIQAMKDAQSKVKRKERRKDNERKQKETVRMQMGMTTPSEIGIEAGDQGSSEAVFRLKDADKRTDIRQAIMRGRMHTAVEPEKPKEESEEESEDEYGDALEAQLDGMYEQYQERVEDRDTKARAKRARKLARGNDVEEEFEGFGAEDKDPNDSDASSDDGLLEDDDDSLDSDDGEGALTTDLQPKDPMGGGLTRRAASFFEQDIFKGIDGLDEEDEEDEEDEPELDKARDSGVDVESPNLKPATEEEEDDDSEDAMSFASDDDAASETSSIEAVPSNIQPEEEDWEEGTTRPSAPGENPAQPSISIITAEAMTLAHQLATGKVTKQQLLDDNFNKYTLRDVDGLPEWFLDDENKHSRLARPVSGEAAAAIKEKLRALNARPIKKVREAKARKTLRTARRLEKLKKKSEGLAEQDGEGGGEAGRDAMERMSKMMAKAKKGTKKRNPVKVVFAGGHNKGAGRPRGVKGKYKMVDSRLKKDVRGLKRAEKKGRVRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.64
3 0.62
4 0.58
5 0.54
6 0.49
7 0.5
8 0.55
9 0.6
10 0.55
11 0.57
12 0.55
13 0.61
14 0.59
15 0.58
16 0.55
17 0.52
18 0.57
19 0.57
20 0.63
21 0.6
22 0.66
23 0.59
24 0.61
25 0.59
26 0.54
27 0.58
28 0.52
29 0.56
30 0.56
31 0.6
32 0.55
33 0.52
34 0.47
35 0.39
36 0.39
37 0.3
38 0.23
39 0.18
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.17
44 0.12
45 0.12
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.15
55 0.14
56 0.14
57 0.13
58 0.09
59 0.1
60 0.12
61 0.11
62 0.17
63 0.18
64 0.18
65 0.19
66 0.2
67 0.18
68 0.17
69 0.19
70 0.19
71 0.22
72 0.25
73 0.27
74 0.33
75 0.33
76 0.33
77 0.34
78 0.3
79 0.27
80 0.26
81 0.27
82 0.22
83 0.21
84 0.22
85 0.2
86 0.22
87 0.25
88 0.34
89 0.39
90 0.46
91 0.51
92 0.57
93 0.6
94 0.64
95 0.63
96 0.59
97 0.52
98 0.46
99 0.42
100 0.43
101 0.41
102 0.34
103 0.32
104 0.27
105 0.25
106 0.22
107 0.21
108 0.13
109 0.1
110 0.09
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.11
116 0.13
117 0.15
118 0.16
119 0.16
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.1
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.12
133 0.13
134 0.12
135 0.17
136 0.16
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.13
141 0.13
142 0.19
143 0.17
144 0.23
145 0.25
146 0.27
147 0.33
148 0.37
149 0.46
150 0.46
151 0.45
152 0.46
153 0.48
154 0.49
155 0.47
156 0.48
157 0.4
158 0.34
159 0.36
160 0.32
161 0.29
162 0.29
163 0.33
164 0.33
165 0.38
166 0.44
167 0.46
168 0.53
169 0.56
170 0.57
171 0.57
172 0.57
173 0.57
174 0.54
175 0.54
176 0.47
177 0.43
178 0.39
179 0.34
180 0.29
181 0.24
182 0.23
183 0.17
184 0.16
185 0.18
186 0.22
187 0.23
188 0.32
189 0.38
190 0.43
191 0.53
192 0.55
193 0.6
194 0.59
195 0.63
196 0.6
197 0.53
198 0.49
199 0.4
200 0.42
201 0.36
202 0.34
203 0.26
204 0.19
205 0.22
206 0.19
207 0.18
208 0.14
209 0.12
210 0.12
211 0.15
212 0.15
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.13
217 0.18
218 0.19
219 0.23
220 0.3
221 0.38
222 0.46
223 0.54
224 0.61
225 0.6
226 0.67
227 0.67
228 0.67
229 0.68
230 0.66
231 0.64
232 0.61
233 0.58
234 0.53
235 0.46
236 0.4
237 0.34
238 0.26
239 0.19
240 0.16
241 0.14
242 0.14
243 0.18
244 0.18
245 0.18
246 0.2
247 0.2
248 0.23
249 0.23
250 0.2
251 0.15
252 0.14
253 0.12
254 0.1
255 0.09
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.09
260 0.09
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.16
265 0.17
266 0.19
267 0.21
268 0.24
269 0.26
270 0.26
271 0.24
272 0.21
273 0.19
274 0.15
275 0.11
276 0.08
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.09
284 0.11
285 0.16
286 0.18
287 0.18
288 0.2
289 0.2
290 0.21
291 0.18
292 0.16
293 0.13
294 0.14
295 0.19
296 0.25
297 0.29
298 0.33
299 0.37
300 0.38
301 0.38
302 0.41
303 0.37
304 0.39
305 0.4
306 0.44
307 0.46
308 0.49
309 0.51
310 0.55
311 0.62
312 0.61
313 0.61
314 0.6
315 0.59
316 0.61
317 0.66
318 0.66
319 0.59
320 0.62
321 0.58
322 0.57
323 0.56
324 0.59
325 0.51
326 0.43
327 0.46
328 0.39
329 0.41
330 0.34
331 0.29
332 0.21
333 0.19
334 0.17
335 0.15
336 0.12
337 0.1
338 0.11
339 0.16
340 0.16
341 0.16
342 0.17
343 0.16
344 0.15
345 0.14
346 0.12
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.15
371 0.15
372 0.19
373 0.27
374 0.33
375 0.41
376 0.5
377 0.58
378 0.63
379 0.72
380 0.78
381 0.81
382 0.85
383 0.88
384 0.9
385 0.92
386 0.9
387 0.87
388 0.82
389 0.78
390 0.75
391 0.71
392 0.67
393 0.6
394 0.53
395 0.47
396 0.43
397 0.36
398 0.29
399 0.22
400 0.16
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.07
405 0.06
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.08
421 0.1
422 0.14
423 0.18
424 0.22
425 0.25
426 0.27
427 0.3
428 0.34
429 0.32
430 0.3
431 0.31
432 0.31
433 0.31
434 0.35
435 0.34
436 0.27
437 0.29
438 0.28
439 0.24
440 0.2
441 0.2
442 0.18
443 0.21
444 0.22
445 0.22
446 0.23
447 0.23
448 0.22
449 0.22
450 0.2
451 0.19
452 0.2
453 0.22
454 0.21
455 0.21
456 0.21
457 0.18
458 0.15
459 0.13
460 0.08
461 0.05
462 0.04
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.04
473 0.04
474 0.05
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.09
479 0.11
480 0.17
481 0.2
482 0.26
483 0.28
484 0.34
485 0.38
486 0.43
487 0.5
488 0.51
489 0.57
490 0.61
491 0.68
492 0.7
493 0.75
494 0.75
495 0.77
496 0.72
497 0.66
498 0.58
499 0.49
500 0.41
501 0.32
502 0.25
503 0.15
504 0.12
505 0.09
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.09
513 0.09
514 0.1
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.11
520 0.09
521 0.09
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.03
541 0.03
542 0.04
543 0.04
544 0.1
545 0.11
546 0.11
547 0.12
548 0.12
549 0.13
550 0.13
551 0.13
552 0.08
553 0.12
554 0.12
555 0.16
556 0.18
557 0.17
558 0.17
559 0.17
560 0.17
561 0.16
562 0.18
563 0.15
564 0.16
565 0.16
566 0.16
567 0.17
568 0.17
569 0.14
570 0.11
571 0.1
572 0.09
573 0.09
574 0.1
575 0.08
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.07
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.08
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.08
593 0.08
594 0.09
595 0.11
596 0.11
597 0.13
598 0.14
599 0.15
600 0.18
601 0.18
602 0.19
603 0.16
604 0.14
605 0.12
606 0.14
607 0.18
608 0.16
609 0.17
610 0.18
611 0.21
612 0.21
613 0.22
614 0.2
615 0.14
616 0.12
617 0.11
618 0.08
619 0.05
620 0.05
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.05
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.07
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.06
638 0.08
639 0.08
640 0.1
641 0.1
642 0.11
643 0.11
644 0.12
645 0.15
646 0.15
647 0.15
648 0.14
649 0.15
650 0.15
651 0.15
652 0.16
653 0.12
654 0.11
655 0.11
656 0.12
657 0.13
658 0.13
659 0.21
660 0.24
661 0.28
662 0.3
663 0.3
664 0.3
665 0.28
666 0.28
667 0.22
668 0.18
669 0.12
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.08
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.05
680 0.06
681 0.06
682 0.07
683 0.09
684 0.11
685 0.11
686 0.16
687 0.2
688 0.22
689 0.23
690 0.26
691 0.31
692 0.35
693 0.42
694 0.4
695 0.43
696 0.41
697 0.41
698 0.37
699 0.3
700 0.3
701 0.24
702 0.24
703 0.2
704 0.2
705 0.24
706 0.27
707 0.28
708 0.23
709 0.21
710 0.18
711 0.16
712 0.16
713 0.14
714 0.12
715 0.17
716 0.23
717 0.24
718 0.25
719 0.27
720 0.31
721 0.37
722 0.41
723 0.39
724 0.38
725 0.39
726 0.4
727 0.38
728 0.34
729 0.26
730 0.22
731 0.17
732 0.13
733 0.12
734 0.11
735 0.12
736 0.14
737 0.15
738 0.19
739 0.24
740 0.27
741 0.37
742 0.44
743 0.49
744 0.55
745 0.59
746 0.59
747 0.64
748 0.68
749 0.67
750 0.69
751 0.72
752 0.74
753 0.79
754 0.82
755 0.77
756 0.78
757 0.8
758 0.78
759 0.79
760 0.78
761 0.76
762 0.77
763 0.83
764 0.83
765 0.84
766 0.84
767 0.84
768 0.83
769 0.78
770 0.75
771 0.75
772 0.73
773 0.69
774 0.66
775 0.58
776 0.5
777 0.46
778 0.39
779 0.3
780 0.21
781 0.15
782 0.06
783 0.05
784 0.05
785 0.04
786 0.05
787 0.05
788 0.06
789 0.08
790 0.11
791 0.12
792 0.13
793 0.17
794 0.19
795 0.22
796 0.3
797 0.33
798 0.36
799 0.45
800 0.53
801 0.59
802 0.67
803 0.76
804 0.78
805 0.84
806 0.88
807 0.9
808 0.9
809 0.86
810 0.85
811 0.8
812 0.75
813 0.66
814 0.62
815 0.58
816 0.51
817 0.47
818 0.39
819 0.33
820 0.31
821 0.37
822 0.36
823 0.36
824 0.41
825 0.44
826 0.54
827 0.58
828 0.63
829 0.62
830 0.67
831 0.64
832 0.65
833 0.66
834 0.64
835 0.69
836 0.67
837 0.68
838 0.67
839 0.66
840 0.6
841 0.62
842 0.64
843 0.63
844 0.66
845 0.66
846 0.67
847 0.74
848 0.83
849 0.84
850 0.84