Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2D3V4Y7

Protein Details
Accession A0A2D3V4Y7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPKRRRERDRPKTGPESLYNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-9RRRERD
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MPKRRRERDRPKTGPESLYNPNKRVLLSYASDDEEEEEAAVDNAPDQTKSDAAEAVIDDRAIANYQMTEYPDSENEVELGATGDEDVGASDGKDEDVEEVGDDADDDGAEEDTGPSSTPQDKVTDDWAPPTKKDPVTHQRPTLGPVSFGQDEDDEEDYDPETEEAMAYLRAVRSERQTIPEILSAPRQLQVDADQLQDTNQRNPDEPPIENDAIVSSDTFVQATPVNSEPTPLEGDATDPQKVFTRLLIERFMEQRTQLHLPPSMHKLAELPDSCPISFPRGNNRALAEWYHVLSEKAPLPAQLRSMDQDSIFNLLGLLQEHYLTKVCELNKVTSAWIWSLLARLDDVGTMNNDEVFPLRELGKRAVFLLLSFSSPELAAGLESLGQDAPSIASTEANQAEIAPQAPTDNTLATLDMMLVVIGHVFGQKDLLEFRPKWTVTEKPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.75
3 0.7
4 0.68
5 0.7
6 0.67
7 0.61
8 0.58
9 0.53
10 0.48
11 0.45
12 0.4
13 0.35
14 0.31
15 0.33
16 0.32
17 0.31
18 0.31
19 0.28
20 0.26
21 0.21
22 0.18
23 0.13
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.07
29 0.07
30 0.09
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.13
35 0.14
36 0.15
37 0.16
38 0.14
39 0.14
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.12
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.11
54 0.13
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.17
59 0.21
60 0.2
61 0.18
62 0.16
63 0.14
64 0.13
65 0.1
66 0.1
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.09
104 0.11
105 0.13
106 0.14
107 0.16
108 0.17
109 0.19
110 0.23
111 0.24
112 0.22
113 0.26
114 0.32
115 0.32
116 0.32
117 0.34
118 0.37
119 0.37
120 0.39
121 0.43
122 0.46
123 0.54
124 0.59
125 0.59
126 0.56
127 0.52
128 0.53
129 0.49
130 0.38
131 0.3
132 0.24
133 0.26
134 0.22
135 0.21
136 0.19
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.16
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.1
160 0.14
161 0.2
162 0.21
163 0.24
164 0.26
165 0.26
166 0.27
167 0.27
168 0.24
169 0.2
170 0.2
171 0.17
172 0.15
173 0.17
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.2
188 0.21
189 0.22
190 0.23
191 0.28
192 0.25
193 0.24
194 0.24
195 0.26
196 0.25
197 0.24
198 0.22
199 0.17
200 0.14
201 0.14
202 0.1
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.11
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.1
220 0.09
221 0.07
222 0.09
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.15
229 0.16
230 0.15
231 0.13
232 0.16
233 0.17
234 0.19
235 0.21
236 0.19
237 0.2
238 0.22
239 0.22
240 0.17
241 0.16
242 0.16
243 0.18
244 0.2
245 0.19
246 0.19
247 0.22
248 0.23
249 0.26
250 0.28
251 0.26
252 0.23
253 0.22
254 0.21
255 0.19
256 0.24
257 0.21
258 0.18
259 0.2
260 0.22
261 0.22
262 0.22
263 0.21
264 0.2
265 0.22
266 0.23
267 0.29
268 0.33
269 0.35
270 0.35
271 0.36
272 0.32
273 0.3
274 0.29
275 0.23
276 0.18
277 0.18
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.14
283 0.13
284 0.14
285 0.14
286 0.16
287 0.17
288 0.18
289 0.21
290 0.19
291 0.18
292 0.19
293 0.21
294 0.2
295 0.18
296 0.18
297 0.16
298 0.17
299 0.16
300 0.13
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.09
312 0.1
313 0.14
314 0.14
315 0.2
316 0.22
317 0.24
318 0.25
319 0.26
320 0.26
321 0.22
322 0.23
323 0.18
324 0.16
325 0.14
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.11
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.14
347 0.16
348 0.19
349 0.24
350 0.26
351 0.24
352 0.24
353 0.24
354 0.22
355 0.19
356 0.21
357 0.17
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.08
379 0.07
380 0.08
381 0.09
382 0.15
383 0.15
384 0.15
385 0.14
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.14
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.12
398 0.12
399 0.13
400 0.12
401 0.12
402 0.1
403 0.08
404 0.08
405 0.06
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.08
415 0.09
416 0.11
417 0.14
418 0.18
419 0.25
420 0.26
421 0.3
422 0.38
423 0.38
424 0.4
425 0.42