FuNGI

J3PKW4

Protein Details

Accession

J3PKW4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
345-371	TTKPEHSPAKGKRDRKRKRGDEGQDDG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
347-364	KPEHSPAKGKRDRKRKRG

Subcellular Location(s)

cyto 16, cyto_nucl 11.5, nucl 5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001678 MeTrfase_RsmB/NOP2 IPR023267 RCMT IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0003723 F:RNA binding GO:0009383 F:rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity GO:0070475 P:rRNA base methylation
Pfam	View protein in Pfam PF01189 Methyltr_RsmB-F
PROSITE	View protein in PROSITE PS51686 SAM_MT_RSMB_NOP

Amino Acid Sequences

MSLYHETAAVLASSEGGSLKARVFRLKTLKSAPSQVYALAFETCKWSPVLKEVVENAQLLQHERKLTPVLALLLAHDLLLAKGGVALPASHGLRQSAERHKARLTAELTRARIRRKAPSLDALRAEVDEAASPDAGHPRWIRINTLKTSIATELESTFAGFTKVASIPDLLARSKPDGIYMDEHIPNLIAVSRRVDMIKKEAYKSGAIILQDKASCFPAYLLDPRPEDGEVVDACAAPGNKTTHLAAVLKSRRAASGFAGPLRIHAFEKDPVRAMTLEKMVKLAGSDGFTCLNKGKDFLKANPDDALYANVGALLLDPSCSGSGIVGRDDAPELRLPNAPGVKGTTKPEHSPAKGKRDRKRKRGDEGQDDGGIKEGESDGAGQTLVDDDGKTTVVSSEADLKARLAALSSFQCSLLVHALGFPVARRVTYSTCSVHAEENEHVVLAALRSEVARERGWRILTRAEQVDGMRRWPVRGRVEFCGGDKGDAHAEAVAEGCIRAYKGDSQGVMGFFVAALVRDGGAAGPDTARPMIQTTASDSRADMDDSEESDWGGFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.07
3	0.08
4	0.09
5	0.1
6	0.13
7	0.18
8	0.21
9	0.28
10	0.31
11	0.38
12	0.47
13	0.5
14	0.55
15	0.57
16	0.62
17	0.59
18	0.63
19	0.57
20	0.52
21	0.48
22	0.42
23	0.36
24	0.3
25	0.27
26	0.22
27	0.19
28	0.16
29	0.21
30	0.19
31	0.19
32	0.19
33	0.19
34	0.19
35	0.25
36	0.31
37	0.26
38	0.3
39	0.32
40	0.35
41	0.35
42	0.34
43	0.28
44	0.24
45	0.24
46	0.24
47	0.24
48	0.24
49	0.25
50	0.25
51	0.28
52	0.28
53	0.28
54	0.26
55	0.24
56	0.22
57	0.19
58	0.19
59	0.16
60	0.14
61	0.14
62	0.12
63	0.09
64	0.08
65	0.06
66	0.07
67	0.06
68	0.04
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.07
75	0.12
76	0.13
77	0.13
78	0.14
79	0.15
80	0.17
81	0.21
82	0.27
83	0.32
84	0.41
85	0.43
86	0.46
87	0.47
88	0.5
89	0.48
90	0.48
91	0.43
92	0.4
93	0.45
94	0.47
95	0.48
96	0.51
97	0.54
98	0.51
99	0.53
100	0.5
101	0.52
102	0.54
103	0.58
104	0.56
105	0.61
106	0.62
107	0.61
108	0.58
109	0.5
110	0.43
111	0.35
112	0.3
113	0.21
114	0.15
115	0.1
116	0.09
117	0.09
118	0.08
119	0.08
120	0.08
121	0.12
122	0.12
123	0.16
124	0.16
125	0.2
126	0.26
127	0.27
128	0.32
129	0.35
130	0.42
131	0.4
132	0.44
133	0.41
134	0.36
135	0.37
136	0.33
137	0.26
138	0.2
139	0.18
140	0.13
141	0.13
142	0.12
143	0.1
144	0.09
145	0.08
146	0.08
147	0.07
148	0.06
149	0.09
150	0.1
151	0.1
152	0.11
153	0.11
154	0.11
155	0.14
156	0.16
157	0.13
158	0.13
159	0.15
160	0.16
161	0.18
162	0.17
163	0.17
164	0.16
165	0.18
166	0.2
167	0.21
168	0.23
169	0.22
170	0.22
171	0.2
172	0.18
173	0.15
174	0.12
175	0.12
176	0.08
177	0.08
178	0.1
179	0.11
180	0.12
181	0.13
182	0.15
183	0.15
184	0.2
185	0.26
186	0.27
187	0.28
188	0.3
189	0.31
190	0.29
191	0.28
192	0.24
193	0.2
194	0.17
195	0.17
196	0.15
197	0.16
198	0.16
199	0.15
200	0.14
201	0.14
202	0.13
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.12
207	0.16
208	0.18
209	0.19
210	0.2
211	0.2
212	0.21
213	0.19
214	0.17
215	0.13
216	0.13
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.08
221	0.07
222	0.09
223	0.09
224	0.07
225	0.1
226	0.11
227	0.11
228	0.13
229	0.13
230	0.12
231	0.14
232	0.15
233	0.12
234	0.19
235	0.22
236	0.22
237	0.23
238	0.23
239	0.22
240	0.22
241	0.22
242	0.15
243	0.18
244	0.18
245	0.17
246	0.19
247	0.18
248	0.18
249	0.18
250	0.17
251	0.12
252	0.11
253	0.13
254	0.15
255	0.18
256	0.17
257	0.17
258	0.16
259	0.17
260	0.17
261	0.16
262	0.14
263	0.16
264	0.16
265	0.15
266	0.15
267	0.13
268	0.13
269	0.12
270	0.1
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.11
280	0.1
281	0.12
282	0.12
283	0.18
284	0.21
285	0.23
286	0.3
287	0.29
288	0.3
289	0.3
290	0.29
291	0.22
292	0.2
293	0.18
294	0.1
295	0.09
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.04
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.08
316	0.09
317	0.09
318	0.08
319	0.09
320	0.1
321	0.11
322	0.13
323	0.13
324	0.16
325	0.17
326	0.16
327	0.15
328	0.18
329	0.18
330	0.19
331	0.23
332	0.24
333	0.25
334	0.27
335	0.33
336	0.36
337	0.37
338	0.44
339	0.47
340	0.53
341	0.58
342	0.65
343	0.68
344	0.72
345	0.8
346	0.81
347	0.85
348	0.83
349	0.85
350	0.86
351	0.86
352	0.84
353	0.79
354	0.71
355	0.63
356	0.55
357	0.45
358	0.36
359	0.27
360	0.17
361	0.13
362	0.09
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.14
385	0.15
386	0.16
387	0.16
388	0.16
389	0.16
390	0.16
391	0.15
392	0.08
393	0.07
394	0.1
395	0.12
396	0.13
397	0.13
398	0.13
399	0.14
400	0.13
401	0.14
402	0.13
403	0.11
404	0.1
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.08
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.12
414	0.15
415	0.18
416	0.21
417	0.25
418	0.22
419	0.25
420	0.28
421	0.27
422	0.27
423	0.26
424	0.26
425	0.23
426	0.24
427	0.21
428	0.18
429	0.16
430	0.13
431	0.12
432	0.08
433	0.08
434	0.05
435	0.05
436	0.06
437	0.07
438	0.1
439	0.13
440	0.15
441	0.17
442	0.21
443	0.26
444	0.3
445	0.31
446	0.32
447	0.36
448	0.38
449	0.4
450	0.39
451	0.35
452	0.34
453	0.32
454	0.38
455	0.31
456	0.3
457	0.3
458	0.28
459	0.31
460	0.34
461	0.41
462	0.42
463	0.49
464	0.52
465	0.52
466	0.57
467	0.56
468	0.51
469	0.51
470	0.42
471	0.35
472	0.3
473	0.27
474	0.23
475	0.21
476	0.2
477	0.13
478	0.13
479	0.11
480	0.11
481	0.09
482	0.07
483	0.07
484	0.06
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.1
489	0.14
490	0.19
491	0.23
492	0.23
493	0.25
494	0.28
495	0.28
496	0.26
497	0.21
498	0.16
499	0.11
500	0.11
501	0.09
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.08
513	0.08
514	0.11
515	0.11
516	0.11
517	0.11
518	0.13
519	0.15
520	0.16
521	0.17
522	0.22
523	0.28
524	0.3
525	0.29
526	0.27
527	0.27
528	0.27
529	0.27
530	0.2
531	0.17
532	0.17
533	0.19
534	0.2
535	0.18
536	0.16
537	0.15

J3PKW4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer