FuNGI

J3PHA2

Protein Details

Accession

J3PHA2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
218-237	GAAGRKRKKRWDVSSEETVA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
221-227	GRKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 18, nucl 4.5, cyto_nucl 4, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFEQIKKLQQERNAAAATKKGSKTFDPASQRADSSTKIKLSEASDTSLYDRADGADKFAGYHTTLPANDGDDDDDMADAGGRSLVGQYTATRAQIDEFARGSGVEEEDILAGRGERSNRITDRETDYQKRRFDRALTPTRADPFAAGRQAGAAEGNSYRKVMEEREIEREEERVRRAIETKAKDATDGDDTVMEDHRPLLKDSEGDREDGSADGAAGRKRKKRWDVSSEETVAPPPAPEAAKPKRSRWDQAPAPAAPGAADTTKKRSRWDQAPSATPVGPQGLATPIHPSAAGADLPVGFGPDMHRAIMVLSDEELDAMLPGPEEGYKILEPPPGYAPVRAPAHKLMQTPAPATGFVMQDPNSGRVSSQQMPKEIPGVGDLQFFKPEDMAYFGKLTDGTNEESLSVEELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARNFGAGPLFNQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDMVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLQAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKRLVDCIGPNLNDEQTKVRTVTSLAIAALAEAANPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVVSQCAGTEGVTAGYLKEHVLDEFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDIGQKVGAGEILERIVVNLKDESEPYRKMTVETVEKIVASLGAADVGERLEERLIDGILHAFQEQSVEDIIMLNGFGSVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGISQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVNTAVAIGIIAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFMFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIIEAIEAIRMAVGPGLVLNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVQGADAMVPYYPNLEEDGLDRGELGIIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.53
3	0.57
4	0.56
5	0.51
6	0.47
7	0.46
8	0.44
9	0.43
10	0.42
11	0.4
12	0.41
13	0.42
14	0.47
15	0.48
16	0.52
17	0.52
18	0.53
19	0.54
20	0.53
21	0.5
22	0.46
23	0.44
24	0.39
25	0.34
26	0.37
27	0.35
28	0.33
29	0.33
30	0.34
31	0.35
32	0.39
33	0.36
34	0.33
35	0.31
36	0.31
37	0.32
38	0.32
39	0.29
40	0.21
41	0.19
42	0.17
43	0.21
44	0.2
45	0.21
46	0.2
47	0.2
48	0.2
49	0.21
50	0.21
51	0.18
52	0.2
53	0.19
54	0.2
55	0.2
56	0.21
57	0.21
58	0.21
59	0.2
60	0.19
61	0.18
62	0.15
63	0.15
64	0.13
65	0.12
66	0.09
67	0.09
68	0.08
69	0.06
70	0.06
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.06
75	0.07
76	0.07
77	0.08
78	0.09
79	0.14
80	0.17
81	0.17
82	0.17
83	0.17
84	0.18
85	0.23
86	0.24
87	0.23
88	0.21
89	0.2
90	0.2
91	0.2
92	0.2
93	0.16
94	0.15
95	0.11
96	0.1
97	0.11
98	0.11
99	0.11
100	0.1
101	0.08
102	0.07
103	0.08
104	0.12
105	0.13
106	0.18
107	0.21
108	0.28
109	0.31
110	0.36
111	0.39
112	0.41
113	0.47
114	0.5
115	0.55
116	0.57
117	0.63
118	0.65
119	0.69
120	0.7
121	0.67
122	0.64
123	0.61
124	0.61
125	0.62
126	0.65
127	0.64
128	0.62
129	0.61
130	0.59
131	0.55
132	0.46
133	0.37
134	0.31
135	0.31
136	0.3
137	0.26
138	0.22
139	0.22
140	0.21
141	0.2
142	0.16
143	0.1
144	0.09
145	0.11
146	0.14
147	0.15
148	0.15
149	0.14
150	0.15
151	0.18
152	0.19
153	0.24
154	0.28
155	0.31
156	0.39
157	0.41
158	0.4
159	0.39
160	0.4
161	0.37
162	0.35
163	0.35
164	0.32
165	0.31
166	0.33
167	0.35
168	0.4
169	0.44
170	0.44
171	0.46
172	0.47
173	0.45
174	0.43
175	0.41
176	0.35
177	0.3
178	0.25
179	0.21
180	0.16
181	0.17
182	0.17
183	0.17
184	0.14
185	0.1
186	0.12
187	0.16
188	0.16
189	0.17
190	0.19
191	0.19
192	0.23
193	0.25
194	0.32
195	0.29
196	0.29
197	0.27
198	0.25
199	0.24
200	0.2
201	0.19
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.11
206	0.14
207	0.19
208	0.26
209	0.33
210	0.4
211	0.5
212	0.59
213	0.67
214	0.74
215	0.77
216	0.79
217	0.79
218	0.8
219	0.74
220	0.65
221	0.55
222	0.45
223	0.36
224	0.28
225	0.2
226	0.13
227	0.12
228	0.12
229	0.14
230	0.22
231	0.3
232	0.39
233	0.44
234	0.5
235	0.56
236	0.62
237	0.67
238	0.65
239	0.67
240	0.63
241	0.67
242	0.67
243	0.57
244	0.53
245	0.46
246	0.39
247	0.28
248	0.22
249	0.16
250	0.11
251	0.14
252	0.14
253	0.22
254	0.29
255	0.31
256	0.35
257	0.41
258	0.48
259	0.54
260	0.61
261	0.62
262	0.61
263	0.65
264	0.64
265	0.59
266	0.51
267	0.42
268	0.34
269	0.26
270	0.21
271	0.15
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.14
277	0.13
278	0.13
279	0.13
280	0.12
281	0.1
282	0.12
283	0.11
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.07
290	0.05
291	0.06
292	0.08
293	0.11
294	0.12
295	0.12
296	0.12
297	0.11
298	0.12
299	0.13
300	0.11
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.05
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.05
316	0.05
317	0.08
318	0.08
319	0.1
320	0.12
321	0.14
322	0.15
323	0.16
324	0.18
325	0.2
326	0.21
327	0.21
328	0.21
329	0.25
330	0.29
331	0.28
332	0.29
333	0.27
334	0.32
335	0.34
336	0.34
337	0.29
338	0.3
339	0.31
340	0.29
341	0.27
342	0.22
343	0.19
344	0.18
345	0.19
346	0.15
347	0.13
348	0.15
349	0.13
350	0.15
351	0.17
352	0.18
353	0.16
354	0.16
355	0.15
356	0.17
357	0.22
358	0.25
359	0.3
360	0.31
361	0.32
362	0.34
363	0.34
364	0.33
365	0.27
366	0.22
367	0.16
368	0.15
369	0.14
370	0.16
371	0.16
372	0.15
373	0.16
374	0.16
375	0.15
376	0.13
377	0.12
378	0.1
379	0.13
380	0.13
381	0.13
382	0.13
383	0.13
384	0.13
385	0.13
386	0.13
387	0.1
388	0.12
389	0.12
390	0.12
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.12
395	0.11
396	0.09
397	0.07
398	0.1
399	0.11
400	0.12
401	0.16
402	0.16
403	0.17
404	0.2
405	0.25
406	0.26
407	0.35
408	0.41
409	0.43
410	0.49
411	0.49
412	0.47
413	0.48
414	0.48
415	0.45
416	0.44
417	0.42
418	0.42
419	0.45
420	0.44
421	0.42
422	0.48
423	0.5
424	0.45
425	0.43
426	0.41
427	0.46
428	0.52
429	0.5
430	0.41
431	0.33
432	0.31
433	0.3
434	0.27
435	0.19
436	0.12
437	0.1
438	0.11
439	0.12
440	0.11
441	0.11
442	0.1
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.1
451	0.12
452	0.13
453	0.13
454	0.13
455	0.16
456	0.17
457	0.18
458	0.16
459	0.15
460	0.14
461	0.18
462	0.2
463	0.17
464	0.18
465	0.18
466	0.18
467	0.18
468	0.18
469	0.13
470	0.13
471	0.14
472	0.14
473	0.15
474	0.17
475	0.16
476	0.16
477	0.18
478	0.18
479	0.16
480	0.14
481	0.13
482	0.13
483	0.14
484	0.13
485	0.12
486	0.09
487	0.09
488	0.09
489	0.08
490	0.06
491	0.04
492	0.03
493	0.04
494	0.05
495	0.05
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.09
501	0.1
502	0.12
503	0.12
504	0.14
505	0.14
506	0.14
507	0.13
508	0.11
509	0.1
510	0.07
511	0.06
512	0.04
513	0.04
514	0.03
515	0.03
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.05
523	0.06
524	0.07
525	0.09
526	0.1
527	0.11
528	0.13
529	0.14
530	0.15
531	0.15
532	0.14
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.11
537	0.1
538	0.1
539	0.09
540	0.08
541	0.09
542	0.08
543	0.07
544	0.06
545	0.05
546	0.04
547	0.04
548	0.03
549	0.03
550	0.03
551	0.03
552	0.02
553	0.02
554	0.03
555	0.03
556	0.05
557	0.06
558	0.09
559	0.13
560	0.15
561	0.17
562	0.2
563	0.29
564	0.38
565	0.45
566	0.48
567	0.53
568	0.56
569	0.62
570	0.61
571	0.57
572	0.49
573	0.45
574	0.44
575	0.37
576	0.33
577	0.26
578	0.24
579	0.19
580	0.17
581	0.13
582	0.08
583	0.06
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.06
588	0.07
589	0.07
590	0.09
591	0.1
592	0.1
593	0.12
594	0.14
595	0.14
596	0.14
597	0.16
598	0.17
599	0.17
600	0.17
601	0.16
602	0.15
603	0.13
604	0.14
605	0.14
606	0.12
607	0.13
608	0.13
609	0.12
610	0.12
611	0.12
612	0.13
613	0.11
614	0.1
615	0.08
616	0.08
617	0.08
618	0.07
619	0.06
620	0.05
621	0.04
622	0.03
623	0.03
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.03
629	0.04
630	0.04
631	0.05
632	0.05
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.05
639	0.05
640	0.06
641	0.08
642	0.13
643	0.22
644	0.24
645	0.25
646	0.31
647	0.34
648	0.36
649	0.36
650	0.37
651	0.32
652	0.3
653	0.3
654	0.24
655	0.2
656	0.18
657	0.15
658	0.08
659	0.05
660	0.04
661	0.03
662	0.04
663	0.03
664	0.04
665	0.05
666	0.05
667	0.04
668	0.07
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.08
674	0.08
675	0.08
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.09
687	0.09
688	0.1
689	0.13
690	0.13
691	0.13
692	0.14
693	0.16
694	0.13
695	0.15
696	0.14
697	0.13
698	0.16
699	0.19
700	0.19
701	0.17
702	0.17
703	0.16
704	0.16
705	0.14
706	0.11
707	0.07
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.05
712	0.04
713	0.05
714	0.05
715	0.05
716	0.06
717	0.05
718	0.07
719	0.08
720	0.1
721	0.1
722	0.1
723	0.1
724	0.11
725	0.12
726	0.16
727	0.2
728	0.18
729	0.2
730	0.28
731	0.34
732	0.41
733	0.48
734	0.51
735	0.5
736	0.58
737	0.57
738	0.5
739	0.46
740	0.4
741	0.36
742	0.31
743	0.27
744	0.2
745	0.21
746	0.2
747	0.17
748	0.15
749	0.1
750	0.09
751	0.08
752	0.06
753	0.05
754	0.04
755	0.05
756	0.05
757	0.05
758	0.05
759	0.05
760	0.05
761	0.08
762	0.08
763	0.09
764	0.09
765	0.1
766	0.11
767	0.12
768	0.16
769	0.18
770	0.2
771	0.21
772	0.24
773	0.23
774	0.23
775	0.25
776	0.26
777	0.27
778	0.27
779	0.26
780	0.24
781	0.23
782	0.22
783	0.19
784	0.14
785	0.08
786	0.06
787	0.04
788	0.04
789	0.03
790	0.03
791	0.04
792	0.04
793	0.04
794	0.04
795	0.04
796	0.04
797	0.04
798	0.05
799	0.06
800	0.06
801	0.06
802	0.06
803	0.06
804	0.06
805	0.07
806	0.06
807	0.05
808	0.05
809	0.06
810	0.06
811	0.06
812	0.06
813	0.05
814	0.05
815	0.06
816	0.06
817	0.05
818	0.05
819	0.04
820	0.03
821	0.03
822	0.03
823	0.03
824	0.03
825	0.03
826	0.04
827	0.04
828	0.04
829	0.08
830	0.09
831	0.12
832	0.12
833	0.13
834	0.14
835	0.2
836	0.3
837	0.29
838	0.31
839	0.3
840	0.33
841	0.33
842	0.32
843	0.29
844	0.22
845	0.22
846	0.21
847	0.22
848	0.25
849	0.26
850	0.27
851	0.3
852	0.32
853	0.37
854	0.41
855	0.39
856	0.33
857	0.33
858	0.33
859	0.29
860	0.26
861	0.19
862	0.15
863	0.12
864	0.12
865	0.1
866	0.1
867	0.09
868	0.08
869	0.1
870	0.1
871	0.11
872	0.11
873	0.11
874	0.11
875	0.1
876	0.11
877	0.09
878	0.09
879	0.08
880	0.08
881	0.09
882	0.08
883	0.07
884	0.06
885	0.05
886	0.04
887	0.05
888	0.06
889	0.06
890	0.06
891	0.06
892	0.06
893	0.06
894	0.06
895	0.05
896	0.05
897	0.04
898	0.04
899	0.04
900	0.04
901	0.05
902	0.04
903	0.04
904	0.04
905	0.04
906	0.04
907	0.04
908	0.04
909	0.03
910	0.03
911	0.04
912	0.05
913	0.05
914	0.06
915	0.09
916	0.12
917	0.13
918	0.13
919	0.15
920	0.17
921	0.18
922	0.2
923	0.2
924	0.23
925	0.25
926	0.26
927	0.28
928	0.29
929	0.33
930	0.37
931	0.46
932	0.45
933	0.51
934	0.53
935	0.59
936	0.62
937	0.64
938	0.61
939	0.61
940	0.57
941	0.53
942	0.5
943	0.42
944	0.35
945	0.28
946	0.23
947	0.14
948	0.11
949	0.08
950	0.08
951	0.08
952	0.09
953	0.1
954	0.11
955	0.14
956	0.17
957	0.2
958	0.22
959	0.23
960	0.23
961	0.26
962	0.25
963	0.24
964	0.24
965	0.22
966	0.21
967	0.19
968	0.18
969	0.19
970	0.19
971	0.19
972	0.15
973	0.18
974	0.22
975	0.22
976	0.24
977	0.22
978	0.27
979	0.33
980	0.43
981	0.49
982	0.51
983	0.59
984	0.65
985	0.72
986	0.67
987	0.6
988	0.51
989	0.41
990	0.36
991	0.28
992	0.2
993	0.11
994	0.13
995	0.13
996	0.12
997	0.11
998	0.11
999	0.11
1000	0.1
1001	0.1
1002	0.07
1003	0.07
1004	0.08
1005	0.1
1006	0.12
1007	0.12
1008	0.13
1009	0.14
1010	0.16
1011	0.19
1012	0.26
1013	0.29
1014	0.35
1015	0.37
1016	0.42
1017	0.42
1018	0.43
1019	0.4
1020	0.32
1021	0.28
1022	0.2
1023	0.17
1024	0.11
1025	0.09
1026	0.06
1027	0.06
1028	0.05
1029	0.04
1030	0.04
1031	0.04
1032	0.05
1033	0.05
1034	0.06
1035	0.09
1036	0.1
1037	0.1
1038	0.11
1039	0.16
1040	0.16
1041	0.18
1042	0.18
1043	0.17
1044	0.18
1045	0.18
1046	0.19
1047	0.2
1048	0.23
1049	0.25
1050	0.26
1051	0.25
1052	0.28
1053	0.27
1054	0.26
1055	0.2
1056	0.17
1057	0.14
1058	0.14
1059	0.15
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.13
1065	0.12
1066	0.13
1067	0.11
1068	0.11
1069	0.11
1070	0.1
1071	0.1
1072	0.09
1073	0.08
1074	0.07
1075	0.08
1076	0.08
1077	0.08
1078	0.08
1079	0.08
1080	0.08
1081	0.07
1082	0.06
1083	0.07
1084	0.1
1085	0.1
1086	0.1
1087	0.11
1088	0.14
1089	0.19
1090	0.21
1091	0.23
1092	0.2
1093	0.2
1094	0.22
1095	0.27
1096	0.3
1097	0.27
1098	0.27
1099	0.26
1100	0.26
1101	0.25
1102	0.23
1103	0.18
1104	0.11
1105	0.1
1106	0.08
1107	0.06
1108	0.05
1109	0.05
1110	0.05
1111	0.04
1112	0.04
1113	0.04
1114	0.03
1115	0.05
1116	0.05
1117	0.05
1118	0.06
1119	0.06
1120	0.07
1121	0.09
1122	0.09
1123	0.08
1124	0.08
1125	0.1
1126	0.11
1127	0.11
1128	0.1
1129	0.14
1130	0.21
1131	0.23
1132	0.24
1133	0.23
1134	0.21
1135	0.22
1136	0.24
1137	0.21
1138	0.14
1139	0.11
1140	0.11
1141	0.11
1142	0.11
1143	0.1
1144	0.08
1145	0.06
1146	0.05
1147	0.06
1148	0.06
1149	0.05
1150	0.05
1151	0.05
1152	0.06
1153	0.06
1154	0.06
1155	0.06
1156	0.06
1157	0.06
1158	0.06
1159	0.06
1160	0.06
1161	0.12
1162	0.16
1163	0.17
1164	0.25
1165	0.31
1166	0.36
1167	0.43
1168	0.49
1169	0.52
1170	0.59
1171	0.65
1172	0.66
1173	0.7
1174	0.7
1175	0.68
1176	0.66
1177	0.65
1178	0.58
1179	0.55
1180	0.47
1181	0.36
1182	0.32
1183	0.27
1184	0.22
1185	0.14
1186	0.11
1187	0.08
1188	0.07
1189	0.07
1190	0.07
1191	0.08
1192	0.09
1193	0.1
1194	0.11
1195	0.12
1196	0.12
1197	0.13
1198	0.18
1199	0.16
1200	0.15
1201	0.15
1202	0.13

J3PHA2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer