Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PCE9

Protein Details
Accession J3PCE9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-48VESKARFAERQKKEHRRPPKNYQIVTKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-38RQKKEHRRP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10, cyto 10, cysk 3, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR006590  RNA_pol_Rpb4/RPC9_core  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
IPR038846  RPC9  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MKILESQNAVLSNYEVYTHLVESKARFAERQKKEHRRPPKNYQIVTKDVMQYFQTYPNPLSQQPPTYDQDSIASLVERLAEFGLSKGEVLMIVNLRPTELPGLYVCVEEMAERYSADQQSRMLDIVVQVLGPFPRAGGEDGGEEGEEPIADSIENGQGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.12
4 0.12
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.17
10 0.21
11 0.23
12 0.22
13 0.24
14 0.31
15 0.41
16 0.47
17 0.55
18 0.61
19 0.68
20 0.78
21 0.85
22 0.87
23 0.88
24 0.89
25 0.89
26 0.89
27 0.88
28 0.81
29 0.8
30 0.74
31 0.68
32 0.61
33 0.53
34 0.47
35 0.38
36 0.35
37 0.27
38 0.24
39 0.21
40 0.24
41 0.23
42 0.2
43 0.21
44 0.23
45 0.25
46 0.23
47 0.25
48 0.22
49 0.24
50 0.25
51 0.29
52 0.27
53 0.27
54 0.26
55 0.23
56 0.21
57 0.19
58 0.17
59 0.12
60 0.1
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.08
101 0.12
102 0.14
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.14
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.06
121 0.07
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07