FuNGI

A0A2D3VDB0

Protein Details

Accession

A0A2D3VDB0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
107-127	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
407-409	RRE
411-433	EVRTAARNKXRDERENRGNKRAR

Subcellular Location(s)

cyto 13, nucl 6, pero 3, cysk 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFXWLSKKYPKIISPVVEEQAREVENDDGTTTTIPIDARGPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPETEEEMMIAVFEYTERVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAAEKDAEAAEFHRRMVANGERVDEGHALKKTWDSNSITPGTPFMDLLAASLRYWVSYKLSTDPAWEKLKVVISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSSPDHDPNSRHVMYGLDADLIMLGIATHEPHFRILREDXFANDTKPGHCRKCNQPGHMAANCQGLVKPDENVVKPPKPFIWLXVGILREYLAVEMSVPDQGFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIREDGIDTLIAIWRDNIPVMGGYVTKDGHVDLARAQLILAGLAKQEDAIFKRRRETEVRTAARNKXRDERENRGNKRARWSNGGAPTGFDETIVRRGPKGGIIRGEAAPDPNALPTFAPGAAQTKSDPRYTAGLTHADVVGGKAALDKANQDNRSAAAVLREKLLGSKKPADNQKAGVEALFASGGADGGSQPSPVLGKRARDMVDDAAADEASSNPSTPGRNTPDKEIADPLNRGTSGALGGNSKNTSEEMPEDTVKLWEDGYQGRYYEQKFHVSPHDIEFRHSVARCYVEGLAWVLLYYFQGCPSWTWYYPHHYAPFAADFVDMEKQVVNFEKGKPFHPYEQLMGVMPAASNHTLPAVFHPLMTEDDSPIKEFYPEDFEVDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKKLLDAMATKYPLLSKDEQRRNAFGEEALIFSTKHPLYHDVVSNFYGKKATEGKFKINAKVSEGLSGKASKDESYVPNSELKFPFPTSDEQDHQFGDLEMDESVKISYHMPVLKSVHKSMLLPGVKFSEPVLDYNDVETTRNRANKSGRSFGGVQLSQHGDRSDGRRINYAAGDRGGHNNNNNRGGYGGNGYGGNGGYGGRGNDQYASRAAEALSNLPPHLAAQAAQHGVYPPQQGGGRPPPGYPPLPPQGYPPANYGQGRGPPPPPQNGYGGHQNGYGGRGGYGGGQGTYDQRGGYNQGYGGGGGGGYGQDSNGYSYQGGRGGGRGGRRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.54
3	0.55
4	0.54
5	0.54
6	0.56
7	0.56
8	0.51
9	0.47
10	0.41
11	0.38
12	0.34
13	0.26
14	0.22
15	0.2
16	0.18
17	0.19
18	0.18
19	0.13
20	0.14
21	0.14
22	0.12
23	0.1
24	0.11
25	0.11
26	0.11
27	0.15
28	0.18
29	0.2
30	0.28
31	0.3
32	0.31
33	0.33
34	0.35
35	0.33
36	0.3
37	0.29
38	0.25
39	0.26
40	0.22
41	0.2
42	0.18
43	0.15
44	0.14
45	0.12
46	0.09
47	0.07
48	0.08
49	0.08
50	0.09
51	0.1
52	0.12
53	0.18
54	0.21
55	0.23
56	0.29
57	0.36
58	0.4
59	0.44
60	0.44
61	0.43
62	0.41
63	0.41
64	0.35
65	0.29
66	0.24
67	0.2
68	0.16
69	0.11
70	0.1
71	0.08
72	0.06
73	0.04
74	0.06
75	0.06
76	0.07
77	0.08
78	0.09
79	0.1
80	0.16
81	0.26
82	0.33
83	0.36
84	0.37
85	0.39
86	0.41
87	0.41
88	0.39
89	0.32
90	0.29
91	0.27
92	0.25
93	0.24
94	0.21
95	0.2
96	0.18
97	0.15
98	0.1
99	0.13
100	0.19
101	0.26
102	0.37
103	0.46
104	0.55
105	0.66
106	0.74
107	0.8
108	0.82
109	0.79
110	0.76
111	0.76
112	0.73
113	0.7
114	0.71
115	0.63
116	0.59
117	0.56
118	0.48
119	0.39
120	0.31
121	0.24
122	0.15
123	0.14
124	0.18
125	0.17
126	0.17
127	0.21
128	0.21
129	0.21
130	0.28
131	0.33
132	0.32
133	0.33
134	0.35
135	0.31
136	0.31
137	0.33
138	0.28
139	0.24
140	0.23
141	0.22
142	0.21
143	0.21
144	0.25
145	0.27
146	0.27
147	0.32
148	0.32
149	0.34
150	0.4
151	0.42
152	0.38
153	0.35
154	0.33
155	0.28
156	0.23
157	0.19
158	0.13
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.12
163	0.11
164	0.1
165	0.12
166	0.11
167	0.11
168	0.12
169	0.13
170	0.14
171	0.16
172	0.18
173	0.21
174	0.25
175	0.24
176	0.29
177	0.31
178	0.34
179	0.36
180	0.34
181	0.31
182	0.31
183	0.36
184	0.3
185	0.29
186	0.25
187	0.22
188	0.24
189	0.24
190	0.21
191	0.16
192	0.15
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.1
197	0.1
198	0.09
199	0.13
200	0.15
201	0.16
202	0.18
203	0.23
204	0.3
205	0.32
206	0.33
207	0.36
208	0.39
209	0.45
210	0.48
211	0.53
212	0.52
213	0.56
214	0.58
215	0.57
216	0.61
217	0.54
218	0.47
219	0.37
220	0.31
221	0.26
222	0.24
223	0.19
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.09
228	0.08
229	0.06
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.07
237	0.08
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.19
242	0.19
243	0.24
244	0.25
245	0.26
246	0.26
247	0.28
248	0.3
249	0.26
250	0.26
251	0.23
252	0.27
253	0.34
254	0.38
255	0.4
256	0.44
257	0.54
258	0.63
259	0.68
260	0.67
261	0.66
262	0.66
263	0.68
264	0.63
265	0.55
266	0.47
267	0.42
268	0.38
269	0.31
270	0.24
271	0.19
272	0.19
273	0.18
274	0.16
275	0.17
276	0.21
277	0.22
278	0.28
279	0.32
280	0.34
281	0.34
282	0.37
283	0.34
284	0.32
285	0.32
286	0.27
287	0.27
288	0.26
289	0.27
290	0.27
291	0.26
292	0.23
293	0.22
294	0.2
295	0.14
296	0.1
297	0.09
298	0.05
299	0.04
300	0.05
301	0.05
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.1
310	0.09
311	0.11
312	0.12
313	0.13
314	0.14
315	0.16
316	0.15
317	0.13
318	0.13
319	0.11
320	0.1
321	0.09
322	0.08
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.09
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.11
337	0.12
338	0.12
339	0.11
340	0.12
341	0.12
342	0.11
343	0.11
344	0.07
345	0.05
346	0.05
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.09
367	0.1
368	0.09
369	0.09
370	0.12
371	0.12
372	0.12
373	0.11
374	0.1
375	0.09
376	0.09
377	0.08
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.07
385	0.1
386	0.18
387	0.24
388	0.25
389	0.32
390	0.34
391	0.38
392	0.42
393	0.47
394	0.49
395	0.54
396	0.55
397	0.55
398	0.61
399	0.63
400	0.64
401	0.63
402	0.57
403	0.53
404	0.59
405	0.6
406	0.61
407	0.66
408	0.69
409	0.69
410	0.76
411	0.76
412	0.7
413	0.73
414	0.71
415	0.63
416	0.59
417	0.55
418	0.53
419	0.52
420	0.51
421	0.41
422	0.34
423	0.32
424	0.28
425	0.23
426	0.16
427	0.11
428	0.1
429	0.15
430	0.16
431	0.15
432	0.13
433	0.15
434	0.15
435	0.2
436	0.22
437	0.2
438	0.21
439	0.22
440	0.24
441	0.23
442	0.24
443	0.19
444	0.16
445	0.13
446	0.12
447	0.1
448	0.08
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.09
458	0.09
459	0.1
460	0.1
461	0.14
462	0.17
463	0.17
464	0.18
465	0.17
466	0.19
467	0.19
468	0.2
469	0.17
470	0.17
471	0.16
472	0.16
473	0.14
474	0.12
475	0.11
476	0.09
477	0.07
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.05
483	0.06
484	0.07
485	0.12
486	0.19
487	0.2
488	0.2
489	0.2
490	0.2
491	0.21
492	0.2
493	0.15
494	0.13
495	0.15
496	0.14
497	0.15
498	0.14
499	0.13
500	0.15
501	0.19
502	0.17
503	0.18
504	0.25
505	0.26
506	0.32
507	0.39
508	0.4
509	0.39
510	0.39
511	0.36
512	0.31
513	0.29
514	0.23
515	0.16
516	0.12
517	0.1
518	0.07
519	0.05
520	0.03
521	0.03
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.03
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.05
532	0.05
533	0.1
534	0.11
535	0.13
536	0.14
537	0.19
538	0.19
539	0.19
540	0.21
541	0.17
542	0.17
543	0.15
544	0.14
545	0.1
546	0.09
547	0.08
548	0.06
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.05
554	0.07
555	0.08
556	0.09
557	0.15
558	0.2
559	0.26
560	0.28
561	0.32
562	0.38
563	0.38
564	0.38
565	0.34
566	0.31
567	0.27
568	0.27
569	0.23
570	0.17
571	0.16
572	0.15
573	0.12
574	0.1
575	0.08
576	0.08
577	0.08
578	0.07
579	0.08
580	0.09
581	0.09
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.09
586	0.09
587	0.1
588	0.11
589	0.13
590	0.13
591	0.13
592	0.13
593	0.13
594	0.12
595	0.11
596	0.09
597	0.08
598	0.09
599	0.11
600	0.13
601	0.13
602	0.13
603	0.13
604	0.17
605	0.17
606	0.22
607	0.22
608	0.25
609	0.24
610	0.26
611	0.31
612	0.31
613	0.31
614	0.29
615	0.34
616	0.29
617	0.31
618	0.3
619	0.26
620	0.27
621	0.26
622	0.23
623	0.17
624	0.19
625	0.17
626	0.17
627	0.16
628	0.12
629	0.12
630	0.11
631	0.1
632	0.07
633	0.07
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.06
638	0.05
639	0.05
640	0.06
641	0.07
642	0.07
643	0.12
644	0.16
645	0.16
646	0.19
647	0.21
648	0.27
649	0.3
650	0.33
651	0.31
652	0.27
653	0.27
654	0.26
655	0.25
656	0.18
657	0.15
658	0.11
659	0.09
660	0.1
661	0.11
662	0.09
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.09
667	0.11
668	0.12
669	0.13
670	0.15
671	0.22
672	0.23
673	0.25
674	0.29
675	0.31
676	0.33
677	0.36
678	0.35
679	0.3
680	0.31
681	0.29
682	0.24
683	0.2
684	0.16
685	0.11
686	0.08
687	0.07
688	0.07
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.07
693	0.07
694	0.07
695	0.1
696	0.14
697	0.13
698	0.13
699	0.13
700	0.14
701	0.16
702	0.18
703	0.16
704	0.11
705	0.14
706	0.15
707	0.16
708	0.15
709	0.14
710	0.12
711	0.12
712	0.12
713	0.16
714	0.16
715	0.17
716	0.17
717	0.17
718	0.17
719	0.19
720	0.19
721	0.13
722	0.13
723	0.11
724	0.11
725	0.12
726	0.12
727	0.12
728	0.1
729	0.11
730	0.14
731	0.16
732	0.15
733	0.14
734	0.13
735	0.12
736	0.12
737	0.12
738	0.08
739	0.07
740	0.09
741	0.1
742	0.09
743	0.09
744	0.12
745	0.14
746	0.19
747	0.19
748	0.17
749	0.17
750	0.18
751	0.19
752	0.21
753	0.23
754	0.27
755	0.36
756	0.45
757	0.53
758	0.55
759	0.56
760	0.55
761	0.51
762	0.44
763	0.33
764	0.28
765	0.2
766	0.17
767	0.15
768	0.13
769	0.11
770	0.11
771	0.17
772	0.14
773	0.15
774	0.16
775	0.19
776	0.22
777	0.26
778	0.31
779	0.25
780	0.27
781	0.28
782	0.3
783	0.27
784	0.24
785	0.22
786	0.16
787	0.19
788	0.25
789	0.26
790	0.32
791	0.35
792	0.4
793	0.47
794	0.5
795	0.52
796	0.52
797	0.5
798	0.45
799	0.47
800	0.41
801	0.39
802	0.37
803	0.31
804	0.26
805	0.27
806	0.23
807	0.2
808	0.21
809	0.14
810	0.15
811	0.19
812	0.2
813	0.24
814	0.26
815	0.25
816	0.29
817	0.29
818	0.34
819	0.3
820	0.3
821	0.28
822	0.27
823	0.27
824	0.24
825	0.28
826	0.28
827	0.33
828	0.33
829	0.32
830	0.34
831	0.32
832	0.3
833	0.27
834	0.2
835	0.15
836	0.12
837	0.1
838	0.08
839	0.08
840	0.07
841	0.07
842	0.07
843	0.06
844	0.07
845	0.07
846	0.08
847	0.12
848	0.16
849	0.16
850	0.21
851	0.25
852	0.3
853	0.34
854	0.34
855	0.34
856	0.32
857	0.32
858	0.3
859	0.35
860	0.32
861	0.28
862	0.28
863	0.28
864	0.27
865	0.27
866	0.24
867	0.21
868	0.19
869	0.2
870	0.22
871	0.21
872	0.21
873	0.22
874	0.24
875	0.19
876	0.19
877	0.19
878	0.19
879	0.23
880	0.28
881	0.29
882	0.33
883	0.4
884	0.47
885	0.54
886	0.57
887	0.51
888	0.51
889	0.51
890	0.47
891	0.49
892	0.41
893	0.34
894	0.31
895	0.34
896	0.3
897	0.3
898	0.27
899	0.2
900	0.24
901	0.28
902	0.33
903	0.33
904	0.34
905	0.37
906	0.38
907	0.4
908	0.4
909	0.38
910	0.32
911	0.29
912	0.29
913	0.25
914	0.31
915	0.32
916	0.32
917	0.35
918	0.41
919	0.45
920	0.5
921	0.49
922	0.42
923	0.38
924	0.35
925	0.3
926	0.25
927	0.19
928	0.14
929	0.13
930	0.13
931	0.14
932	0.13
933	0.11
934	0.08
935	0.07
936	0.06
937	0.08
938	0.09
939	0.1
940	0.11
941	0.12
942	0.15
943	0.16
944	0.18
945	0.19
946	0.21
947	0.19
948	0.19
949	0.18
950	0.17
951	0.17
952	0.18
953	0.19
954	0.18
955	0.17
956	0.17
957	0.16
958	0.14
959	0.14
960	0.11
961	0.09
962	0.1
963	0.16
964	0.17
965	0.17
966	0.17
967	0.17
968	0.19
969	0.21
970	0.21
971	0.15
972	0.18
973	0.2
974	0.21
975	0.27
976	0.34
977	0.38
978	0.36
979	0.37
980	0.39
981	0.43
982	0.44
983	0.39
984	0.38
985	0.41
986	0.43
987	0.43
988	0.42
989	0.47
990	0.49
991	0.47
992	0.43
993	0.39
994	0.42
995	0.42
996	0.39
997	0.35
998	0.38
999	0.39
1000	0.4
1001	0.39
1002	0.42
1003	0.47
1004	0.52
1005	0.51
1006	0.47
1007	0.48
1008	0.47
1009	0.48
1010	0.49
1011	0.47
1012	0.39
1013	0.36
1014	0.34
1015	0.31
1016	0.29
1017	0.25
1018	0.16
1019	0.13
1020	0.12
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.11
1025	0.09
1026	0.09
1027	0.1
1028	0.13
1029	0.15
1030	0.15
1031	0.13
1032	0.13
1033	0.15
1034	0.19
1035	0.2
1036	0.2
1037	0.18
1038	0.19
1039	0.19
1040	0.18
1041	0.16
1042	0.12
1043	0.1
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.05
1047	0.05
1048	0.05
1049	0.05
1050	0.06
1051	0.07
1052	0.11
1053	0.11
1054	0.13
1055	0.13
1056	0.14
1057	0.17
1058	0.19
1059	0.19
1060	0.17
1061	0.17
1062	0.21
1063	0.24

A0A2D3VDB0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer