Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2B7YFP1

Protein Details
Accession A0A2B7YFP1    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-186SSEDEKPKKEQKKPAASPKKSBasic
245-267DSSSPSKSSKKEKKKFSAKEAAKHydrophilic
408-436LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-39KAVKAKSKSAASKAATVGKKGADKKTATGKAK
171-190KPKKEQKKPAASPKKSLKRK
251-263KSSKKEKKKFSAK
414-429KGFTKEKNKKKRGSYR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAGSKAVKAVKAKSKSAASKAATVGKKGADKKTATGKAKVSKTTATADKDAPSPALLAAIGNFLSHHGFAKTSKTFASEQDSKGTSKAKSGDTPSLVEMFESWDKNRSSAEPKKTESEDSDSDSDSSSSDSSDSDVDMKDDSSSSSSSSSSSSSSSESESSDESDSSEDEKPKKEQKKPAASPKKSLKRKLQDDSSSSSSGSESEDERPTTKRAKIEDKKKASSDSSSSSSSDSDSSSDSDSDSDSSSPSKSSKKEKKKFSAKEAAKVPLPESDADSDSSDSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSDSESESKLEAPAKTRKGSSSSDSSGSSASSATISSEPPAKEQQNGVSTSNTNSTPASTPSNNEAAPRNHHRGAKPTPLAIASEQPHDHLPSNSYIPYAYAERAFKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGPGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.62
3 0.64
4 0.64
5 0.57
6 0.56
7 0.57
8 0.59
9 0.52
10 0.47
11 0.44
12 0.4
13 0.45
14 0.46
15 0.48
16 0.47
17 0.47
18 0.51
19 0.58
20 0.63
21 0.6
22 0.6
23 0.61
24 0.62
25 0.66
26 0.65
27 0.58
28 0.52
29 0.5
30 0.5
31 0.5
32 0.46
33 0.44
34 0.42
35 0.4
36 0.39
37 0.37
38 0.31
39 0.24
40 0.19
41 0.15
42 0.13
43 0.11
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.1
55 0.11
56 0.13
57 0.21
58 0.22
59 0.22
60 0.22
61 0.24
62 0.25
63 0.27
64 0.35
65 0.33
66 0.33
67 0.37
68 0.39
69 0.36
70 0.37
71 0.38
72 0.3
73 0.29
74 0.32
75 0.3
76 0.34
77 0.38
78 0.42
79 0.39
80 0.41
81 0.37
82 0.34
83 0.29
84 0.24
85 0.19
86 0.17
87 0.18
88 0.18
89 0.18
90 0.22
91 0.23
92 0.24
93 0.25
94 0.25
95 0.31
96 0.38
97 0.46
98 0.47
99 0.49
100 0.54
101 0.55
102 0.54
103 0.48
104 0.46
105 0.39
106 0.37
107 0.35
108 0.3
109 0.28
110 0.25
111 0.22
112 0.15
113 0.14
114 0.1
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.12
154 0.15
155 0.17
156 0.19
157 0.22
158 0.27
159 0.36
160 0.44
161 0.49
162 0.55
163 0.61
164 0.7
165 0.75
166 0.81
167 0.83
168 0.77
169 0.78
170 0.78
171 0.79
172 0.76
173 0.76
174 0.75
175 0.73
176 0.79
177 0.77
178 0.75
179 0.7
180 0.66
181 0.63
182 0.57
183 0.47
184 0.39
185 0.32
186 0.23
187 0.18
188 0.16
189 0.12
190 0.09
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.16
195 0.17
196 0.19
197 0.23
198 0.25
199 0.26
200 0.28
201 0.39
202 0.46
203 0.55
204 0.62
205 0.63
206 0.64
207 0.61
208 0.6
209 0.5
210 0.44
211 0.37
212 0.31
213 0.27
214 0.25
215 0.24
216 0.21
217 0.2
218 0.18
219 0.16
220 0.12
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.12
237 0.16
238 0.2
239 0.31
240 0.4
241 0.51
242 0.59
243 0.68
244 0.76
245 0.82
246 0.84
247 0.82
248 0.83
249 0.74
250 0.73
251 0.68
252 0.6
253 0.51
254 0.45
255 0.37
256 0.29
257 0.27
258 0.2
259 0.17
260 0.16
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.14
265 0.12
266 0.12
267 0.1
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.16
297 0.15
298 0.19
299 0.26
300 0.31
301 0.33
302 0.34
303 0.34
304 0.35
305 0.38
306 0.37
307 0.36
308 0.35
309 0.34
310 0.34
311 0.32
312 0.27
313 0.24
314 0.19
315 0.12
316 0.1
317 0.08
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.15
324 0.15
325 0.18
326 0.25
327 0.25
328 0.26
329 0.28
330 0.33
331 0.32
332 0.35
333 0.33
334 0.29
335 0.29
336 0.28
337 0.29
338 0.24
339 0.2
340 0.17
341 0.18
342 0.18
343 0.2
344 0.23
345 0.21
346 0.24
347 0.26
348 0.3
349 0.28
350 0.29
351 0.32
352 0.31
353 0.37
354 0.43
355 0.46
356 0.47
357 0.53
358 0.53
359 0.56
360 0.59
361 0.61
362 0.56
363 0.5
364 0.47
365 0.42
366 0.42
367 0.35
368 0.34
369 0.26
370 0.28
371 0.27
372 0.26
373 0.27
374 0.28
375 0.28
376 0.24
377 0.24
378 0.23
379 0.25
380 0.24
381 0.22
382 0.2
383 0.18
384 0.2
385 0.19
386 0.18
387 0.2
388 0.21
389 0.22
390 0.25
391 0.25
392 0.22
393 0.25
394 0.26
395 0.27
396 0.34
397 0.34
398 0.33
399 0.38
400 0.39
401 0.41
402 0.46
403 0.5
404 0.53
405 0.62
406 0.71
407 0.76
408 0.85
409 0.87
410 0.9
411 0.91
412 0.9
413 0.9
414 0.89
415 0.88
416 0.88
417 0.82
418 0.72
419 0.62
420 0.61
421 0.53
422 0.47
423 0.37
424 0.3
425 0.28