Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P9Q5

Protein Details
Accession J3P9Q5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
307-327DAVQRRFRKRLTKKEVKDKEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
83-110RPPPSSAPSNMKTKSGRVMKPSAKKRAK
314-317RKRL
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, cyto 12.5, nucl 10.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MTDTPERKDGASPAPSRPILKLRIGSQALSSITRSPASSAPASTPTAMAETPTASAKIRVKLKSSRPPTPAIEAGPPIFGPPRPPPSSAPSNMKTKSGRVMKPSAKKRAKDDALSDVETSTPSTIKRIKLTKSAAPSPAVKLKFRRTGNAPHHPPGDGYDSELEDRETDPVIEEQFILRYEGGVEEDLDYLAQMVDQNRIGLPPNGHGKEGRTPAEFAIKWLSAERRALVRIRSNFYAAVLVDFPTITESMKTWDKKNLMKTADICQMLLIFAKVANEQEAKTVPLPAPTNETDFRWPHGLTPPMHDAVQRRFRKRLTKKEVKDKEAELNRLLEADRQAADVRYELVNIGHDGKEKIGEYPDDEQDAEGEDDEEMDGGAQANGDSHGDLFDDDGEDDGEPDADLLNELEDVLAGDMLGEEDGPTQDAPAMPSANGDETNTPAAQAESGAEDDGEDDDDDDDDDDDDDREDVDEDAEGEAADQDDTNEAIAEAERQVKKIEGDLALIANRLLRTRVETQLKNAKKHLADLMKRKAGDQDEEDDDEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.51
3 0.49
4 0.49
5 0.49
6 0.45
7 0.49
8 0.49
9 0.44
10 0.51
11 0.51
12 0.46
13 0.4
14 0.39
15 0.34
16 0.3
17 0.29
18 0.22
19 0.23
20 0.23
21 0.22
22 0.21
23 0.21
24 0.25
25 0.25
26 0.24
27 0.24
28 0.27
29 0.28
30 0.26
31 0.24
32 0.19
33 0.2
34 0.18
35 0.16
36 0.13
37 0.12
38 0.13
39 0.14
40 0.14
41 0.13
42 0.19
43 0.24
44 0.3
45 0.37
46 0.39
47 0.44
48 0.52
49 0.61
50 0.66
51 0.68
52 0.7
53 0.66
54 0.68
55 0.66
56 0.64
57 0.57
58 0.49
59 0.45
60 0.39
61 0.36
62 0.31
63 0.26
64 0.21
65 0.2
66 0.18
67 0.2
68 0.24
69 0.32
70 0.34
71 0.38
72 0.4
73 0.46
74 0.53
75 0.54
76 0.55
77 0.51
78 0.57
79 0.55
80 0.57
81 0.52
82 0.47
83 0.5
84 0.5
85 0.51
86 0.48
87 0.56
88 0.59
89 0.67
90 0.73
91 0.75
92 0.74
93 0.74
94 0.74
95 0.76
96 0.73
97 0.68
98 0.63
99 0.6
100 0.57
101 0.54
102 0.47
103 0.36
104 0.3
105 0.25
106 0.22
107 0.14
108 0.11
109 0.09
110 0.15
111 0.2
112 0.24
113 0.31
114 0.37
115 0.4
116 0.47
117 0.52
118 0.52
119 0.54
120 0.56
121 0.51
122 0.48
123 0.46
124 0.42
125 0.44
126 0.41
127 0.38
128 0.39
129 0.45
130 0.5
131 0.5
132 0.52
133 0.49
134 0.57
135 0.62
136 0.66
137 0.64
138 0.6
139 0.59
140 0.53
141 0.48
142 0.41
143 0.36
144 0.26
145 0.22
146 0.19
147 0.18
148 0.19
149 0.19
150 0.16
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.15
191 0.22
192 0.23
193 0.24
194 0.24
195 0.25
196 0.29
197 0.33
198 0.31
199 0.24
200 0.24
201 0.24
202 0.31
203 0.28
204 0.22
205 0.22
206 0.19
207 0.18
208 0.2
209 0.21
210 0.16
211 0.18
212 0.18
213 0.16
214 0.18
215 0.2
216 0.21
217 0.27
218 0.29
219 0.32
220 0.31
221 0.31
222 0.28
223 0.26
224 0.24
225 0.17
226 0.13
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.09
238 0.15
239 0.17
240 0.18
241 0.23
242 0.28
243 0.32
244 0.38
245 0.41
246 0.37
247 0.38
248 0.39
249 0.37
250 0.39
251 0.35
252 0.28
253 0.21
254 0.2
255 0.17
256 0.15
257 0.1
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.13
273 0.14
274 0.13
275 0.17
276 0.17
277 0.2
278 0.19
279 0.21
280 0.22
281 0.22
282 0.23
283 0.21
284 0.21
285 0.19
286 0.23
287 0.26
288 0.22
289 0.25
290 0.27
291 0.25
292 0.25
293 0.25
294 0.24
295 0.27
296 0.36
297 0.39
298 0.4
299 0.44
300 0.49
301 0.58
302 0.64
303 0.67
304 0.68
305 0.72
306 0.76
307 0.82
308 0.85
309 0.79
310 0.73
311 0.65
312 0.63
313 0.58
314 0.53
315 0.43
316 0.36
317 0.31
318 0.28
319 0.25
320 0.18
321 0.13
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.1
329 0.11
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.11
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.14
347 0.18
348 0.18
349 0.18
350 0.17
351 0.16
352 0.14
353 0.15
354 0.12
355 0.08
356 0.08
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.04
362 0.03
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.04
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.1
418 0.11
419 0.12
420 0.12
421 0.12
422 0.13
423 0.11
424 0.13
425 0.16
426 0.15
427 0.14
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.1
432 0.09
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.08
478 0.09
479 0.18
480 0.18
481 0.19
482 0.21
483 0.23
484 0.24
485 0.25
486 0.29
487 0.21
488 0.22
489 0.23
490 0.23
491 0.22
492 0.21
493 0.18
494 0.15
495 0.15
496 0.14
497 0.14
498 0.14
499 0.19
500 0.24
501 0.33
502 0.4
503 0.42
504 0.49
505 0.58
506 0.64
507 0.64
508 0.63
509 0.62
510 0.55
511 0.56
512 0.57
513 0.57
514 0.59
515 0.63
516 0.68
517 0.67
518 0.66
519 0.62
520 0.6
521 0.55
522 0.53
523 0.47
524 0.43
525 0.41