FuNGI

J3NL31

Protein Details

Accession

J3NL31

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-25	SGSVAKRKRPQAAAERPPKRARS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-24	KRKRPQAAAERPPKRAR

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005612 CCAAT-binding_factor IPR027193 Noc4
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030692 C:Noc4p-Nop14p complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF03914 CBF

Amino Acid Sequences

MASGSVAKRKRPQAAAERPPKRARSENRDESDDDQQAQILLLENGIVESKKNYNNIAALLTYAQKDDDEDGTDLVASVSLCRVFIRLLAQGALRRKKGGSEKDAVVVTWLKDRLSEYKAVLQRLMLQEDASSTALTLAMRLLKAEAAATSSESEEYSFPRQFMTQIVAAAVSKGAGAGELRAELAENFVNVYDDVRFYTFKGISETLAAQSPDAPPSFDAVLELLVSVEAVPESNDDIGEFYLDPPKKKSHSMYSVAQHKRPAQDAWVKLLNLGLDKEQRKRVLAVISTHVAPWFTKPEMLMDFLTDSFNEGGSVSLLALSGVFYLIQERNLDYPEFYNKLYSLLDADLLHSKHRSRFFRLLDTFLSSSHLPAQLVASFIKRLARLCLNAPPSAIVVVVPWFYNLFKKHPLCTFMMHHEVRTDEERELLENGGMDDPFLPDEKDPMETQAIESCLWEIVQLQSHYHPNVATIAKIISEQFTKQFYNVEDFLDHSYASLLDGELSKEIKRSPVVEFQIPKRVLLPHDRESGQQDSLLVKLWDFQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.8
3	0.82
4	0.82
5	0.81
6	0.83
7	0.79
8	0.75
9	0.74
10	0.74
11	0.73
12	0.77
13	0.79
14	0.77
15	0.76
16	0.72
17	0.66
18	0.63
19	0.57
20	0.47
21	0.37
22	0.31
23	0.27
24	0.24
25	0.2
26	0.13
27	0.1
28	0.08
29	0.08
30	0.07
31	0.07
32	0.08
33	0.08
34	0.07
35	0.11
36	0.17
37	0.22
38	0.25
39	0.27
40	0.29
41	0.31
42	0.31
43	0.3
44	0.23
45	0.2
46	0.19
47	0.19
48	0.16
49	0.14
50	0.13
51	0.11
52	0.13
53	0.14
54	0.14
55	0.15
56	0.15
57	0.15
58	0.15
59	0.14
60	0.13
61	0.1
62	0.1
63	0.06
64	0.06
65	0.08
66	0.08
67	0.08
68	0.08
69	0.09
70	0.09
71	0.11
72	0.13
73	0.14
74	0.15
75	0.16
76	0.18
77	0.22
78	0.31
79	0.36
80	0.35
81	0.35
82	0.34
83	0.4
84	0.47
85	0.51
86	0.5
87	0.49
88	0.49
89	0.51
90	0.51
91	0.43
92	0.36
93	0.29
94	0.23
95	0.22
96	0.21
97	0.17
98	0.18
99	0.21
100	0.23
101	0.24
102	0.27
103	0.24
104	0.31
105	0.35
106	0.36
107	0.34
108	0.29
109	0.31
110	0.31
111	0.31
112	0.22
113	0.19
114	0.17
115	0.17
116	0.19
117	0.13
118	0.1
119	0.08
120	0.08
121	0.09
122	0.08
123	0.08
124	0.07
125	0.08
126	0.08
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.08
131	0.09
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.09
139	0.08
140	0.09
141	0.09
142	0.12
143	0.16
144	0.16
145	0.16
146	0.17
147	0.17
148	0.17
149	0.18
150	0.18
151	0.14
152	0.13
153	0.13
154	0.12
155	0.12
156	0.11
157	0.09
158	0.06
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.03
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.07
177	0.06
178	0.07
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.09
183	0.09
184	0.09
185	0.14
186	0.15
187	0.15
188	0.18
189	0.18
190	0.17
191	0.18
192	0.18
193	0.13
194	0.15
195	0.14
196	0.1
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.09
203	0.11
204	0.11
205	0.09
206	0.09
207	0.07
208	0.07
209	0.06
210	0.06
211	0.04
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.02
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.12
230	0.14
231	0.15
232	0.17
233	0.21
234	0.23
235	0.27
236	0.31
237	0.32
238	0.38
239	0.42
240	0.44
241	0.46
242	0.54
243	0.53
244	0.51
245	0.46
246	0.42
247	0.4
248	0.37
249	0.31
250	0.26
251	0.3
252	0.29
253	0.3
254	0.29
255	0.27
256	0.25
257	0.25
258	0.2
259	0.13
260	0.13
261	0.1
262	0.14
263	0.16
264	0.2
265	0.24
266	0.25
267	0.25
268	0.26
269	0.27
270	0.25
271	0.25
272	0.23
273	0.22
274	0.22
275	0.21
276	0.2
277	0.17
278	0.13
279	0.11
280	0.1
281	0.11
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.13
286	0.13
287	0.15
288	0.13
289	0.11
290	0.11
291	0.11
292	0.11
293	0.09
294	0.09
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.06
313	0.06
314	0.08
315	0.08
316	0.09
317	0.1
318	0.12
319	0.12
320	0.1
321	0.12
322	0.15
323	0.16
324	0.15
325	0.16
326	0.14
327	0.16
328	0.15
329	0.14
330	0.11
331	0.09
332	0.11
333	0.09
334	0.11
335	0.13
336	0.13
337	0.14
338	0.15
339	0.18
340	0.22
341	0.3
342	0.33
343	0.37
344	0.45
345	0.47
346	0.54
347	0.54
348	0.52
349	0.45
350	0.45
351	0.38
352	0.29
353	0.29
354	0.19
355	0.18
356	0.17
357	0.17
358	0.12
359	0.12
360	0.14
361	0.11
362	0.13
363	0.13
364	0.11
365	0.1
366	0.11
367	0.14
368	0.14
369	0.14
370	0.17
371	0.21
372	0.22
373	0.24
374	0.3
375	0.3
376	0.29
377	0.29
378	0.25
379	0.21
380	0.19
381	0.16
382	0.09
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.13
391	0.15
392	0.18
393	0.27
394	0.3
395	0.34
396	0.37
397	0.41
398	0.38
399	0.4
400	0.4
401	0.37
402	0.43
403	0.39
404	0.36
405	0.33
406	0.32
407	0.3
408	0.3
409	0.26
410	0.18
411	0.2
412	0.2
413	0.19
414	0.2
415	0.17
416	0.13
417	0.11
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.09
422	0.08
423	0.08
424	0.09
425	0.09
426	0.09
427	0.08
428	0.11
429	0.11
430	0.14
431	0.14
432	0.16
433	0.18
434	0.17
435	0.18
436	0.19
437	0.2
438	0.17
439	0.17
440	0.14
441	0.12
442	0.12
443	0.11
444	0.08
445	0.09
446	0.15
447	0.15
448	0.17
449	0.2
450	0.25
451	0.26
452	0.26
453	0.23
454	0.19
455	0.24
456	0.22
457	0.19
458	0.16
459	0.15
460	0.14
461	0.15
462	0.15
463	0.12
464	0.14
465	0.16
466	0.18
467	0.22
468	0.22
469	0.22
470	0.25
471	0.25
472	0.29
473	0.28
474	0.26
475	0.23
476	0.23
477	0.26
478	0.23
479	0.21
480	0.14
481	0.14
482	0.12
483	0.12
484	0.11
485	0.07
486	0.08
487	0.09
488	0.1
489	0.11
490	0.13
491	0.13
492	0.15
493	0.17
494	0.2
495	0.23
496	0.24
497	0.27
498	0.35
499	0.39
500	0.45
501	0.5
502	0.5
503	0.57
504	0.55
505	0.5
506	0.44
507	0.43
508	0.41
509	0.45
510	0.47
511	0.44
512	0.51
513	0.51
514	0.51
515	0.52
516	0.51
517	0.42
518	0.35
519	0.3
520	0.24
521	0.24
522	0.25
523	0.2

J3NL31

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer