Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PJN4

Protein Details
Accession J3PJN4    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-84EYSSKKSHEEFKKHRAKKGLBasic
171-198SEEDKKARKAKKAEKPQAKRPLKRKAPSBasic
418-446LIITKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGRIDTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-83KKHRAKKG
175-196KKARKAKKAEKPQAKRPLKRKA
423-440GKGFTKEKNKKKKGSYRG
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MTGSAPPAWLFGDNNTSVAIDTTSGPPNKTAMAATKDKKAPKPAPAAESHPPAQLLDLVEVFLEEYSSKKSHEEFKKHRAKKGLPPTAPGPAIATSLVAVFQVWKTAQNGDSPAIDDSNSSSSSSSSSESSSSESESESGSESEGAANADVNMMDLMDIEAEEADSESSDSEEDKKARKAKKAEKPQAKRPLKRKAPSSSSSSASSSDSSDSSSEGERPQIKKQKTVKAASPPSSSSASSSSSSSSSSSSEAEAEADAKADSDSGSSSSSSSSSSDSDSDSDSGSEAQAAASKVPLPGSDSDSSSDSSSSSDSSDDDSAEPSTQVKKEAKAAAAKSGSDSSVTVGKTSPQVFPVSEFAPLPPDPVVKTNNRGKKGGDGPKAPNVPFSRIRKDISVDPRLRSNAFNPADEWGQKAHEDLIITKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGRIDTSARNGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.19
4 0.17
5 0.17
6 0.15
7 0.09
8 0.11
9 0.14
10 0.21
11 0.23
12 0.24
13 0.24
14 0.25
15 0.25
16 0.24
17 0.23
18 0.23
19 0.27
20 0.35
21 0.37
22 0.45
23 0.5
24 0.56
25 0.61
26 0.64
27 0.64
28 0.64
29 0.71
30 0.68
31 0.67
32 0.64
33 0.64
34 0.61
35 0.6
36 0.53
37 0.44
38 0.39
39 0.33
40 0.3
41 0.26
42 0.2
43 0.16
44 0.14
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.08
50 0.07
51 0.05
52 0.06
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.16
57 0.19
58 0.29
59 0.39
60 0.49
61 0.53
62 0.63
63 0.73
64 0.77
65 0.8
66 0.8
67 0.77
68 0.77
69 0.79
70 0.79
71 0.7
72 0.68
73 0.64
74 0.61
75 0.54
76 0.44
77 0.34
78 0.25
79 0.24
80 0.19
81 0.16
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.06
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.15
94 0.17
95 0.18
96 0.21
97 0.19
98 0.2
99 0.19
100 0.18
101 0.15
102 0.14
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.14
112 0.13
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.07
159 0.11
160 0.14
161 0.17
162 0.24
163 0.31
164 0.37
165 0.44
166 0.52
167 0.58
168 0.66
169 0.74
170 0.78
171 0.81
172 0.83
173 0.85
174 0.86
175 0.86
176 0.83
177 0.81
178 0.82
179 0.8
180 0.79
181 0.77
182 0.74
183 0.72
184 0.67
185 0.65
186 0.57
187 0.5
188 0.46
189 0.39
190 0.32
191 0.26
192 0.23
193 0.17
194 0.15
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.09
203 0.13
204 0.18
205 0.2
206 0.28
207 0.35
208 0.36
209 0.43
210 0.5
211 0.55
212 0.57
213 0.58
214 0.55
215 0.56
216 0.61
217 0.56
218 0.5
219 0.43
220 0.38
221 0.36
222 0.31
223 0.23
224 0.19
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.07
273 0.05
274 0.05
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.15
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.18
290 0.19
291 0.17
292 0.16
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.14
310 0.14
311 0.19
312 0.21
313 0.22
314 0.28
315 0.31
316 0.34
317 0.36
318 0.36
319 0.38
320 0.36
321 0.34
322 0.3
323 0.28
324 0.24
325 0.18
326 0.17
327 0.12
328 0.15
329 0.15
330 0.13
331 0.12
332 0.14
333 0.18
334 0.2
335 0.2
336 0.17
337 0.2
338 0.19
339 0.21
340 0.23
341 0.19
342 0.18
343 0.17
344 0.16
345 0.18
346 0.18
347 0.17
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.19
352 0.25
353 0.25
354 0.33
355 0.4
356 0.48
357 0.5
358 0.51
359 0.48
360 0.52
361 0.57
362 0.59
363 0.57
364 0.56
365 0.57
366 0.63
367 0.67
368 0.58
369 0.56
370 0.49
371 0.48
372 0.5
373 0.53
374 0.52
375 0.51
376 0.54
377 0.5
378 0.51
379 0.53
380 0.54
381 0.57
382 0.54
383 0.52
384 0.55
385 0.55
386 0.53
387 0.47
388 0.41
389 0.41
390 0.39
391 0.37
392 0.32
393 0.32
394 0.34
395 0.31
396 0.3
397 0.22
398 0.21
399 0.2
400 0.2
401 0.18
402 0.16
403 0.17
404 0.16
405 0.21
406 0.25
407 0.25
408 0.26
409 0.29
410 0.3
411 0.36
412 0.4
413 0.42
414 0.49
415 0.59
416 0.68
417 0.75
418 0.82
419 0.84
420 0.9
421 0.91
422 0.91
423 0.91
424 0.91
425 0.91
426 0.91
427 0.88
428 0.79
429 0.72
430 0.68
431 0.62
432 0.58
433 0.55
434 0.46
435 0.42