Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2B7YRS1

Protein Details
Accession A0A2B7YRS1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
265-286RGVPLPKKKPVGPRSRRDEEPFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
267-280VPLPKKKPVGPRSR
Subcellular Location(s) mito 10, extr 6, nucl 4, cyto 4, cyto_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036505  Amidase/PGRP_sf  
IPR002502  Amidase_domain  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
IPR015510  PGRP  
IPR006619  PGRP_domain_met/bac  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0008745  F:N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0009253  P:peptidoglycan catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
cd06583  PGRP  
Amino Acid Sequences MASSLPLVGPAMVGPIASRIMKAASKLFILLTIITYLSLIPGVSSMLFVPRKKWNARSPKPGIESMKNAKGVKIHYLGSYFAGSTSHADCKKVMQRTQNKHMDKEKWDDIGYNLAVCQHGYVFEGRGRGKKSAANGNKDLNSKHYAVLVFLGKLGVNKPSQNQIHGIQDAIAYLRRHSAGNQIKGHKDGYRKSQCPGTKLYGMVKSGALNPGTLWNGGNYKVKAGDTLRAISINKNVPQRYIIKINKLKKPYTLKVGKMIYIPARGVPLPKKKPVGPRSRRDEEPFEIEHLAAED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.13
8 0.15
9 0.18
10 0.2
11 0.19
12 0.2
13 0.21
14 0.2
15 0.17
16 0.17
17 0.14
18 0.12
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.05
27 0.04
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.12
34 0.17
35 0.18
36 0.22
37 0.3
38 0.38
39 0.44
40 0.52
41 0.55
42 0.62
43 0.71
44 0.77
45 0.76
46 0.77
47 0.75
48 0.73
49 0.69
50 0.63
51 0.62
52 0.58
53 0.57
54 0.54
55 0.5
56 0.44
57 0.42
58 0.39
59 0.37
60 0.33
61 0.28
62 0.24
63 0.25
64 0.24
65 0.22
66 0.2
67 0.14
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.12
73 0.17
74 0.17
75 0.19
76 0.19
77 0.25
78 0.31
79 0.36
80 0.38
81 0.42
82 0.51
83 0.59
84 0.69
85 0.72
86 0.68
87 0.67
88 0.7
89 0.66
90 0.61
91 0.59
92 0.52
93 0.45
94 0.42
95 0.37
96 0.3
97 0.28
98 0.23
99 0.16
100 0.13
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.09
111 0.13
112 0.14
113 0.18
114 0.2
115 0.21
116 0.22
117 0.23
118 0.25
119 0.31
120 0.36
121 0.38
122 0.38
123 0.4
124 0.42
125 0.42
126 0.38
127 0.32
128 0.29
129 0.24
130 0.22
131 0.2
132 0.17
133 0.15
134 0.16
135 0.13
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.19
147 0.19
148 0.2
149 0.23
150 0.22
151 0.24
152 0.23
153 0.22
154 0.15
155 0.14
156 0.13
157 0.1
158 0.12
159 0.09
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.22
166 0.26
167 0.33
168 0.38
169 0.41
170 0.41
171 0.43
172 0.44
173 0.38
174 0.36
175 0.33
176 0.38
177 0.44
178 0.44
179 0.44
180 0.5
181 0.49
182 0.47
183 0.47
184 0.42
185 0.35
186 0.35
187 0.38
188 0.34
189 0.32
190 0.3
191 0.25
192 0.21
193 0.2
194 0.21
195 0.17
196 0.13
197 0.13
198 0.15
199 0.15
200 0.14
201 0.13
202 0.11
203 0.13
204 0.16
205 0.21
206 0.18
207 0.19
208 0.2
209 0.2
210 0.22
211 0.22
212 0.24
213 0.21
214 0.23
215 0.22
216 0.23
217 0.23
218 0.22
219 0.26
220 0.27
221 0.3
222 0.35
223 0.35
224 0.34
225 0.38
226 0.39
227 0.39
228 0.43
229 0.43
230 0.46
231 0.54
232 0.61
233 0.65
234 0.68
235 0.65
236 0.64
237 0.69
238 0.65
239 0.66
240 0.66
241 0.62
242 0.64
243 0.64
244 0.57
245 0.49
246 0.48
247 0.42
248 0.37
249 0.34
250 0.26
251 0.27
252 0.25
253 0.3
254 0.33
255 0.4
256 0.44
257 0.51
258 0.56
259 0.59
260 0.69
261 0.73
262 0.76
263 0.75
264 0.78
265 0.8
266 0.81
267 0.82
268 0.79
269 0.76
270 0.71
271 0.67
272 0.59
273 0.53
274 0.47
275 0.39