FuNGI

J3PDP6

Protein Details

Accession

J3PDP6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-39	DGGADGSVRKRQRRRETEIKPDSDD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
312-324	AKNKKKEAEGKLK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MPPSRRRSRSVVDGDGGADGSVRKRQRRRETEIKPDSDDGEDEFHSFAQDGDERAGSSQRASAIVAAAQNDYQPGAILRVTVDNFVTYEHAEFYPGPNLNMVIGPNGTGKSSLVCAICLGLGYNTNVLGRATSYAEFVKHGKDRATIEVELQKRPDDRRNPIIKLRINREDNTRQFRLNDQQCALKDIQKLMSKFRIQIDNLCQFLPQDKVAEFAGLSPIELLGKTLQAAAPEIMMRQQEQLRGMYSKQKEYQRQGQDETERLRIMATKQQGLQPDVERLRERGEIEKSIKTWERALILCSYQEARHRHTEAKNKKKEAEGKLKRFQQGAGPAMQAVNAKEEYARAVQACIPPLKRKVADGQRTARQLTDKISNLDEQLKDVNNQRSALRNGIQRKKADVGVHKAKIGELQREMNKKVPTFDAADWNTRIREKEHQWRERDGESRRLEVEAGEVWAAGREKSRMKTVVQGQIQALDTREGQELNRLEQQFPDVAAGYKWLTEHKNEFQKEVFAPPALSCAIKDQAYSDLVQSLLQNDDYLCFVTQCKEDHTKLSDQFYRTMGLSVSIRTCSSPLDSFRSPMSSNDIRRLGLDGFAIDYVDGPEPVLAMLCADKGLHKFGVGRRDITEQQYDQLIQTESIGSFAAGGVSYRTTRRAEYGPQAVSTTTSQIRQGMFWTNQPVDSVEQQRLKAEYSEIITELKALGEQKSRLDSQKTAAEESKRMLDDEMKTLRDAKSAQQSEFNKWKAIPKQIEDEQAKEAQKRRELADVLGKIDGLSDQLDEVAVKLAEAVLELRNHVTQMEEAYNEVLQAQLRALEAESDAAALRDKNREVHQLLEEGKRVIAELSAQQQQVKEEAQGLQREVADALQGQGDEERAQLEELYHGKTAEDVSNELEAQRSRLEYVHAANPEVLHEYDRRAKEMGKLQERMAQREGQTVQLAGEIGRVRGEWEPRLDELIGRINEAFSYNFEQISCAGEVSVHKDEDDFDRWAIEIRVKFRPGEALQILDQHRQSGGERSVSTIFYLMSLQSMAQAPFRVVDEINQGMDPRNERMVHERMVDIACDEHSSQYFLITPKLLTGLRYHPRMKVLCIASGPHVPAGNRKVDFGSFVKIKRRLLAAAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.43
3	0.35
4	0.24
5	0.17
6	0.12
7	0.12
8	0.19
9	0.26
10	0.34
11	0.43
12	0.54
13	0.65
14	0.74
15	0.8
16	0.84
17	0.86
18	0.88
19	0.89
20	0.84
21	0.77
22	0.7
23	0.62
24	0.53
25	0.45
26	0.35
27	0.29
28	0.24
29	0.2
30	0.18
31	0.16
32	0.15
33	0.14
34	0.12
35	0.13
36	0.14
37	0.14
38	0.16
39	0.17
40	0.17
41	0.18
42	0.21
43	0.17
44	0.16
45	0.17
46	0.16
47	0.16
48	0.17
49	0.16
50	0.15
51	0.16
52	0.17
53	0.15
54	0.15
55	0.14
56	0.14
57	0.13
58	0.12
59	0.1
60	0.09
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.1
66	0.15
67	0.16
68	0.16
69	0.16
70	0.15
71	0.15
72	0.15
73	0.16
74	0.13
75	0.13
76	0.14
77	0.13
78	0.15
79	0.15
80	0.17
81	0.23
82	0.22
83	0.22
84	0.2
85	0.21
86	0.19
87	0.2
88	0.18
89	0.12
90	0.11
91	0.12
92	0.13
93	0.13
94	0.13
95	0.12
96	0.12
97	0.11
98	0.13
99	0.16
100	0.14
101	0.14
102	0.14
103	0.13
104	0.13
105	0.12
106	0.11
107	0.08
108	0.09
109	0.1
110	0.11
111	0.11
112	0.11
113	0.12
114	0.11
115	0.11
116	0.09
117	0.1
118	0.12
119	0.12
120	0.14
121	0.15
122	0.16
123	0.18
124	0.18
125	0.23
126	0.25
127	0.28
128	0.28
129	0.32
130	0.34
131	0.38
132	0.41
133	0.35
134	0.35
135	0.4
136	0.4
137	0.39
138	0.37
139	0.35
140	0.35
141	0.4
142	0.45
143	0.47
144	0.52
145	0.59
146	0.66
147	0.68
148	0.71
149	0.74
150	0.71
151	0.71
152	0.71
153	0.71
154	0.68
155	0.65
156	0.66
157	0.67
158	0.69
159	0.69
160	0.63
161	0.56
162	0.53
163	0.56
164	0.57
165	0.54
166	0.52
167	0.45
168	0.48
169	0.46
170	0.49
171	0.45
172	0.4
173	0.36
174	0.33
175	0.38
176	0.38
177	0.39
178	0.4
179	0.47
180	0.44
181	0.45
182	0.47
183	0.47
184	0.43
185	0.49
186	0.5
187	0.49
188	0.47
189	0.43
190	0.37
191	0.31
192	0.32
193	0.27
194	0.2
195	0.16
196	0.15
197	0.17
198	0.17
199	0.17
200	0.14
201	0.12
202	0.14
203	0.11
204	0.11
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.06
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.09
215	0.09
216	0.11
217	0.09
218	0.1
219	0.1
220	0.1
221	0.11
222	0.12
223	0.12
224	0.14
225	0.17
226	0.19
227	0.21
228	0.22
229	0.22
230	0.23
231	0.25
232	0.3
233	0.31
234	0.35
235	0.4
236	0.47
237	0.52
238	0.58
239	0.66
240	0.66
241	0.67
242	0.65
243	0.64
244	0.6
245	0.58
246	0.53
247	0.47
248	0.38
249	0.33
250	0.29
251	0.25
252	0.24
253	0.25
254	0.25
255	0.25
256	0.27
257	0.3
258	0.33
259	0.33
260	0.33
261	0.28
262	0.33
263	0.31
264	0.33
265	0.32
266	0.29
267	0.3
268	0.3
269	0.3
270	0.28
271	0.3
272	0.32
273	0.35
274	0.37
275	0.34
276	0.37
277	0.39
278	0.34
279	0.33
280	0.29
281	0.29
282	0.26
283	0.28
284	0.24
285	0.21
286	0.2
287	0.19
288	0.18
289	0.16
290	0.23
291	0.25
292	0.27
293	0.33
294	0.36
295	0.42
296	0.48
297	0.57
298	0.61
299	0.68
300	0.72
301	0.7
302	0.7
303	0.71
304	0.72
305	0.71
306	0.71
307	0.71
308	0.71
309	0.74
310	0.77
311	0.72
312	0.64
313	0.56
314	0.51
315	0.47
316	0.41
317	0.34
318	0.28
319	0.25
320	0.24
321	0.24
322	0.19
323	0.12
324	0.12
325	0.11
326	0.1
327	0.1
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.13
332	0.1
333	0.11
334	0.14
335	0.16
336	0.19
337	0.21
338	0.23
339	0.27
340	0.3
341	0.35
342	0.33
343	0.33
344	0.39
345	0.45
346	0.5
347	0.53
348	0.55
349	0.55
350	0.57
351	0.56
352	0.48
353	0.4
354	0.34
355	0.3
356	0.3
357	0.27
358	0.26
359	0.27
360	0.26
361	0.25
362	0.28
363	0.25
364	0.19
365	0.2
366	0.19
367	0.2
368	0.25
369	0.29
370	0.27
371	0.28
372	0.28
373	0.31
374	0.32
375	0.34
376	0.31
377	0.32
378	0.39
379	0.46
380	0.5
381	0.46
382	0.47
383	0.46
384	0.46
385	0.45
386	0.42
387	0.42
388	0.45
389	0.45
390	0.43
391	0.4
392	0.36
393	0.36
394	0.33
395	0.28
396	0.22
397	0.27
398	0.31
399	0.36
400	0.38
401	0.39
402	0.39
403	0.35
404	0.35
405	0.31
406	0.27
407	0.27
408	0.26
409	0.29
410	0.27
411	0.3
412	0.29
413	0.29
414	0.28
415	0.25
416	0.25
417	0.2
418	0.26
419	0.3
420	0.39
421	0.48
422	0.54
423	0.56
424	0.6
425	0.6
426	0.56
427	0.56
428	0.49
429	0.48
430	0.43
431	0.41
432	0.37
433	0.34
434	0.3
435	0.23
436	0.21
437	0.12
438	0.1
439	0.07
440	0.07
441	0.06
442	0.07
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.09
447	0.13
448	0.15
449	0.2
450	0.2
451	0.21
452	0.28
453	0.33
454	0.39
455	0.36
456	0.36
457	0.32
458	0.32
459	0.32
460	0.25
461	0.2
462	0.12
463	0.11
464	0.11
465	0.12
466	0.1
467	0.09
468	0.14
469	0.14
470	0.16
471	0.21
472	0.21
473	0.2
474	0.2
475	0.22
476	0.16
477	0.16
478	0.14
479	0.08
480	0.08
481	0.07
482	0.09
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.1
487	0.11
488	0.13
489	0.18
490	0.23
491	0.31
492	0.31
493	0.33
494	0.3
495	0.32
496	0.3
497	0.27
498	0.22
499	0.14
500	0.14
501	0.12
502	0.13
503	0.11
504	0.1
505	0.08
506	0.09
507	0.11
508	0.11
509	0.11
510	0.1
511	0.11
512	0.12
513	0.12
514	0.1
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.08
531	0.1
532	0.1
533	0.14
534	0.18
535	0.19
536	0.21
537	0.24
538	0.27
539	0.28
540	0.32
541	0.31
542	0.28
543	0.29
544	0.27
545	0.25
546	0.2
547	0.18
548	0.14
549	0.11
550	0.1
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.08
556	0.09
557	0.08
558	0.1
559	0.11
560	0.13
561	0.18
562	0.18
563	0.19
564	0.19
565	0.21
566	0.19
567	0.18
568	0.22
569	0.22
570	0.23
571	0.27
572	0.28
573	0.26
574	0.25
575	0.27
576	0.2
577	0.15
578	0.14
579	0.09
580	0.08
581	0.07
582	0.07
583	0.05
584	0.04
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.04
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.05
600	0.06
601	0.08
602	0.08
603	0.09
604	0.12
605	0.15
606	0.23
607	0.23
608	0.23
609	0.23
610	0.28
611	0.29
612	0.29
613	0.3
614	0.22
615	0.22
616	0.21
617	0.2
618	0.15
619	0.15
620	0.13
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.08
625	0.08
626	0.07
627	0.05
628	0.05
629	0.04
630	0.04
631	0.03
632	0.04
633	0.04
634	0.05
635	0.06
636	0.07
637	0.1
638	0.11
639	0.12
640	0.15
641	0.17
642	0.21
643	0.25
644	0.3
645	0.28
646	0.27
647	0.27
648	0.24
649	0.23
650	0.19
651	0.17
652	0.12
653	0.13
654	0.13
655	0.15
656	0.16
657	0.14
658	0.16
659	0.18
660	0.18
661	0.19
662	0.23
663	0.2
664	0.2
665	0.2
666	0.2
667	0.16
668	0.19
669	0.2
670	0.21
671	0.23
672	0.24
673	0.25
674	0.24
675	0.23
676	0.19
677	0.18
678	0.14
679	0.13
680	0.13
681	0.12
682	0.12
683	0.11
684	0.1
685	0.09
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.09
690	0.12
691	0.13
692	0.14
693	0.18
694	0.2
695	0.22
696	0.25
697	0.24
698	0.24
699	0.28
700	0.27
701	0.27
702	0.29
703	0.28
704	0.26
705	0.26
706	0.27
707	0.22
708	0.21
709	0.19
710	0.2
711	0.19
712	0.24
713	0.26
714	0.22
715	0.22
716	0.25
717	0.25
718	0.23
719	0.22
720	0.21
721	0.28
722	0.3
723	0.3
724	0.35
725	0.37
726	0.41
727	0.48
728	0.45
729	0.37
730	0.35
731	0.41
732	0.39
733	0.46
734	0.44
735	0.39
736	0.45
737	0.46
738	0.53
739	0.48
740	0.44
741	0.38
742	0.38
743	0.37
744	0.35
745	0.38
746	0.35
747	0.38
748	0.39
749	0.38
750	0.38
751	0.38
752	0.36
753	0.38
754	0.34
755	0.3
756	0.28
757	0.26
758	0.19
759	0.18
760	0.15
761	0.07
762	0.06
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.05
767	0.05
768	0.05
769	0.06
770	0.05
771	0.05
772	0.05
773	0.05
774	0.05
775	0.05
776	0.06
777	0.07
778	0.07
779	0.08
780	0.09
781	0.1
782	0.1
783	0.1
784	0.1
785	0.08
786	0.1
787	0.11
788	0.1
789	0.1
790	0.11
791	0.11
792	0.1
793	0.09
794	0.08
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.06
799	0.06
800	0.07
801	0.07
802	0.07
803	0.07
804	0.07
805	0.07
806	0.06
807	0.06
808	0.06
809	0.07
810	0.07
811	0.1
812	0.13
813	0.15
814	0.19
815	0.22
816	0.29
817	0.29
818	0.32
819	0.32
820	0.32
821	0.35
822	0.34
823	0.32
824	0.26
825	0.24
826	0.2
827	0.19
828	0.14
829	0.11
830	0.09
831	0.1
832	0.14
833	0.18
834	0.19
835	0.2
836	0.2
837	0.21
838	0.22
839	0.2
840	0.16
841	0.14
842	0.17
843	0.21
844	0.22
845	0.22
846	0.22
847	0.21
848	0.21
849	0.19
850	0.15
851	0.11
852	0.09
853	0.09
854	0.07
855	0.07
856	0.07
857	0.07
858	0.08
859	0.07
860	0.07
861	0.07
862	0.07
863	0.08
864	0.08
865	0.08
866	0.11
867	0.12
868	0.14
869	0.15
870	0.14
871	0.14
872	0.14
873	0.16
874	0.15
875	0.15
876	0.13
877	0.14
878	0.16
879	0.16
880	0.15
881	0.16
882	0.13
883	0.14
884	0.15
885	0.14
886	0.14
887	0.14
888	0.17
889	0.17
890	0.21
891	0.25
892	0.24
893	0.24
894	0.23
895	0.23
896	0.21
897	0.21
898	0.18
899	0.14
900	0.14
901	0.18
902	0.26
903	0.27
904	0.28
905	0.27
906	0.28
907	0.33
908	0.41
909	0.46
910	0.46
911	0.47
912	0.46
913	0.51
914	0.52
915	0.5
916	0.45
917	0.4
918	0.33
919	0.37
920	0.37
921	0.33
922	0.31
923	0.26
924	0.23
925	0.19
926	0.18
927	0.11
928	0.14
929	0.12
930	0.11
931	0.11
932	0.11
933	0.12
934	0.16
935	0.21
936	0.2
937	0.24
938	0.27
939	0.27
940	0.3
941	0.28
942	0.25
943	0.23
944	0.28
945	0.24
946	0.22
947	0.21
948	0.18
949	0.19
950	0.19
951	0.17
952	0.12
953	0.17
954	0.17
955	0.17
956	0.17
957	0.18
958	0.17
959	0.19
960	0.17
961	0.11
962	0.1
963	0.11
964	0.12
965	0.18
966	0.21
967	0.18
968	0.17
969	0.18
970	0.2
971	0.23
972	0.26
973	0.22
974	0.18
975	0.19
976	0.19
977	0.21
978	0.21
979	0.22
980	0.22
981	0.25
982	0.32
983	0.33
984	0.33
985	0.32
986	0.39
987	0.34
988	0.38
989	0.35
990	0.31
991	0.3
992	0.36
993	0.38
994	0.35
995	0.34
996	0.27
997	0.26
998	0.24
999	0.25
1000	0.26
1001	0.27
1002	0.27
1003	0.27
1004	0.3
1005	0.31
1006	0.3
1007	0.29
1008	0.22
1009	0.18
1010	0.14
1011	0.14
1012	0.1
1013	0.09
1014	0.09
1015	0.08
1016	0.1
1017	0.13
1018	0.13
1019	0.14
1020	0.15
1021	0.15
1022	0.16
1023	0.17
1024	0.17
1025	0.14
1026	0.16
1027	0.19
1028	0.21
1029	0.21
1030	0.2
1031	0.2
1032	0.21
1033	0.25
1034	0.25
1035	0.23
1036	0.28
1037	0.27
1038	0.3
1039	0.36
1040	0.38
1041	0.38
1042	0.37
1043	0.34
1044	0.31
1045	0.31
1046	0.29
1047	0.23
1048	0.18
1049	0.15
1050	0.16
1051	0.16
1052	0.15
1053	0.15
1054	0.17
1055	0.16
1056	0.16
1057	0.19
1058	0.18
1059	0.2
1060	0.19
1061	0.18
1062	0.17
1063	0.21
1064	0.21
1065	0.19
1066	0.22
1067	0.29
1068	0.35
1069	0.42
1070	0.44
1071	0.44
1072	0.52
1073	0.53
1074	0.52
1075	0.52
1076	0.47
1077	0.43
1078	0.42
1079	0.4
1080	0.36
1081	0.38
1082	0.35
1083	0.29
1084	0.29
1085	0.26
1086	0.32
1087	0.35
1088	0.39
1089	0.36
1090	0.36
1091	0.36
1092	0.34
1093	0.38
1094	0.32
1095	0.35
1096	0.33
1097	0.38
1098	0.45
1099	0.49
1100	0.51
1101	0.51
1102	0.53

J3PDP6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer