Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P385

Protein Details
Accession J3P385    Localization Confidence Low Confidence Score 5.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-48ASESRPRSRSRSPTRTQFAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 21, mito_nucl 12.833, cyto_mito 12.333, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013961  RAI1  
IPR039039  RAI1-like_fam  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140432  F:5'-hydroxyl dinucleotide hydrolase  
GO:0019003  F:GDP binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0034353  F:mRNA 5'-diphosphatase activity  
GO:1990174  F:phosphodiesterase decapping endonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0110152  F:RNA NAD-cap (NAD-forming) hydrolase activity  
GO:0110155  P:NAD-cap decapping  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08652  RAI1  
Amino Acid Sequences MLTRPPLRFHPKPTLVLQRKPPPTVRTMASESRPRSRSRSPTRTQFAVHPIARFAGESQPVRRPKEFACFSYDPNHEFRLDGSSMKWYYPPRLGADLSGGFGTFDKLDDAATDEHIDSLLKTIMAHEQSTGQKIDAQIVTWRGIMTKLMSAPYENEDGFDLNATLYQGCVFIEEDFKCRMDARRAQDAQPWKAPIPREMYTYWGYKFETLATLPKPWGEISRDYIEGRESQQVSNKEQYCSVVRTGLGKTTLCLGGEVDAIWDSKPEHGQPINWVELKTTAEVRNERDAMRQDGKLLKWWIQSFMLGVPKIIVGHRSRNGILVRVEEMQTAEIPNLVQSRSKGRSWDGNTCINFCSAVLECEWFCW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.69
3 0.71
4 0.74
5 0.73
6 0.73
7 0.74
8 0.73
9 0.67
10 0.64
11 0.61
12 0.54
13 0.51
14 0.51
15 0.52
16 0.52
17 0.56
18 0.55
19 0.59
20 0.6
21 0.57
22 0.58
23 0.61
24 0.64
25 0.67
26 0.72
27 0.71
28 0.78
29 0.81
30 0.78
31 0.71
32 0.66
33 0.62
34 0.61
35 0.54
36 0.45
37 0.39
38 0.36
39 0.34
40 0.28
41 0.23
42 0.2
43 0.23
44 0.26
45 0.28
46 0.36
47 0.42
48 0.47
49 0.47
50 0.45
51 0.42
52 0.5
53 0.51
54 0.44
55 0.46
56 0.43
57 0.44
58 0.48
59 0.48
60 0.4
61 0.38
62 0.38
63 0.29
64 0.27
65 0.25
66 0.23
67 0.21
68 0.19
69 0.17
70 0.21
71 0.22
72 0.22
73 0.25
74 0.22
75 0.26
76 0.3
77 0.32
78 0.29
79 0.32
80 0.31
81 0.28
82 0.29
83 0.25
84 0.21
85 0.18
86 0.14
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.09
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.07
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.11
111 0.12
112 0.13
113 0.11
114 0.15
115 0.17
116 0.2
117 0.19
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.19
122 0.15
123 0.14
124 0.14
125 0.16
126 0.16
127 0.15
128 0.14
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.09
147 0.07
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.17
167 0.2
168 0.26
169 0.28
170 0.37
171 0.38
172 0.39
173 0.43
174 0.46
175 0.42
176 0.39
177 0.36
178 0.27
179 0.29
180 0.29
181 0.28
182 0.28
183 0.25
184 0.25
185 0.24
186 0.27
187 0.26
188 0.28
189 0.24
190 0.2
191 0.2
192 0.17
193 0.17
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.14
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.15
205 0.15
206 0.16
207 0.2
208 0.22
209 0.24
210 0.23
211 0.23
212 0.21
213 0.19
214 0.18
215 0.2
216 0.18
217 0.18
218 0.24
219 0.27
220 0.29
221 0.36
222 0.36
223 0.31
224 0.3
225 0.32
226 0.29
227 0.28
228 0.25
229 0.19
230 0.17
231 0.2
232 0.2
233 0.2
234 0.19
235 0.16
236 0.16
237 0.17
238 0.17
239 0.14
240 0.14
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.09
252 0.11
253 0.12
254 0.17
255 0.18
256 0.2
257 0.24
258 0.28
259 0.31
260 0.3
261 0.29
262 0.24
263 0.25
264 0.26
265 0.22
266 0.22
267 0.2
268 0.24
269 0.27
270 0.31
271 0.35
272 0.36
273 0.35
274 0.36
275 0.37
276 0.39
277 0.4
278 0.36
279 0.34
280 0.37
281 0.37
282 0.39
283 0.38
284 0.36
285 0.38
286 0.38
287 0.37
288 0.33
289 0.32
290 0.26
291 0.27
292 0.28
293 0.22
294 0.2
295 0.17
296 0.17
297 0.18
298 0.17
299 0.19
300 0.17
301 0.26
302 0.29
303 0.34
304 0.33
305 0.38
306 0.39
307 0.38
308 0.36
309 0.3
310 0.29
311 0.28
312 0.28
313 0.23
314 0.22
315 0.18
316 0.17
317 0.15
318 0.13
319 0.11
320 0.1
321 0.12
322 0.14
323 0.14
324 0.16
325 0.17
326 0.26
327 0.3
328 0.33
329 0.34
330 0.37
331 0.46
332 0.5
333 0.57
334 0.53
335 0.57
336 0.57
337 0.55
338 0.51
339 0.42
340 0.35
341 0.25
342 0.25
343 0.17
344 0.17
345 0.15
346 0.18