FuNGI

J3NPW5

Protein Details

Accession

J3NPW5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
408-440	IPDVVLVKKHWQRKRRNRTRNWRLKRMAKDEGE	Hydrophilic
470-492	ATLALYKSSKKSKRQPEADAMSI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
415-436	KKHWQRKRRNRTRNWRLKRMAK

Subcellular Location(s)

cyto 13, nucl 10, pero 2, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MDVSMDLDAPVVINPHMGGTAQTGATILCCNCGAPIDGTTAAGALCYDCIKTTVDISQGIQREAVLHFCRDCDRWLLPPASWVLAPPESRELLALCLKKLKGLHKVRIIDASFVWTEPHSRRVRVKLTIQDAVQDGVLLQQSFEVIYIVSYQQCPDCAKSYTANVWRASVQVRQKVLHKRTFLFLEQLILKHGAHRDTINIKEVKDGIDFFFAARNQAEKFVDFLSSSVPIRMKKSQELISQDVHTSTKSYKFTFSVELIPICKEDLVVLPIKLAKQVGNISPLVLCHRVGTAVNFMDPSTLQTAEVPASIYWRHPFHSIAESKDLVEFIIMDIEPLGTQKGKWILGEATVARASDLGVNDKTYFARTHLSGLLQAGDSVLGYMLTGTNFNNEEFQALEDSHAYGSTIPDVVLVKKHWQRKRRNRTRNWRLKRMAKDEGELLPKKADQERLDAEYEQFLRDVEEDDELRATLALYKSSKKSKRQPEADAMSIAETEMTMGDDDDAPKVNMAELLDDMDELAIEDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.08
3	0.09
4	0.08
5	0.09
6	0.1
7	0.13
8	0.12
9	0.12
10	0.11
11	0.11
12	0.12
13	0.14
14	0.12
15	0.11
16	0.11
17	0.11
18	0.12
19	0.13
20	0.14
21	0.13
22	0.14
23	0.15
24	0.16
25	0.16
26	0.15
27	0.14
28	0.12
29	0.1
30	0.08
31	0.05
32	0.06
33	0.07
34	0.07
35	0.07
36	0.09
37	0.11
38	0.12
39	0.14
40	0.16
41	0.18
42	0.19
43	0.2
44	0.25
45	0.26
46	0.25
47	0.23
48	0.2
49	0.19
50	0.19
51	0.24
52	0.2
53	0.21
54	0.21
55	0.22
56	0.26
57	0.26
58	0.27
59	0.25
60	0.25
61	0.27
62	0.33
63	0.34
64	0.3
65	0.32
66	0.32
67	0.28
68	0.25
69	0.21
70	0.19
71	0.21
72	0.22
73	0.21
74	0.23
75	0.22
76	0.22
77	0.22
78	0.18
79	0.18
80	0.24
81	0.23
82	0.2
83	0.25
84	0.25
85	0.28
86	0.32
87	0.35
88	0.39
89	0.46
90	0.54
91	0.56
92	0.6
93	0.58
94	0.61
95	0.55
96	0.47
97	0.38
98	0.33
99	0.25
100	0.22
101	0.21
102	0.14
103	0.18
104	0.18
105	0.27
106	0.27
107	0.31
108	0.38
109	0.45
110	0.51
111	0.52
112	0.58
113	0.56
114	0.58
115	0.57
116	0.51
117	0.45
118	0.4
119	0.34
120	0.26
121	0.18
122	0.12
123	0.1
124	0.11
125	0.08
126	0.07
127	0.06
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.05
132	0.04
133	0.04
134	0.06
135	0.07
136	0.08
137	0.08
138	0.09
139	0.09
140	0.12
141	0.14
142	0.15
143	0.17
144	0.18
145	0.2
146	0.22
147	0.24
148	0.3
149	0.34
150	0.37
151	0.34
152	0.33
153	0.31
154	0.31
155	0.3
156	0.29
157	0.28
158	0.29
159	0.31
160	0.32
161	0.39
162	0.47
163	0.52
164	0.53
165	0.51
166	0.46
167	0.47
168	0.49
169	0.43
170	0.36
171	0.29
172	0.25
173	0.23
174	0.21
175	0.19
176	0.17
177	0.15
178	0.15
179	0.17
180	0.15
181	0.15
182	0.15
183	0.18
184	0.21
185	0.23
186	0.26
187	0.25
188	0.24
189	0.25
190	0.25
191	0.23
192	0.19
193	0.18
194	0.13
195	0.13
196	0.13
197	0.11
198	0.13
199	0.12
200	0.12
201	0.11
202	0.12
203	0.11
204	0.14
205	0.14
206	0.12
207	0.13
208	0.12
209	0.12
210	0.11
211	0.11
212	0.09
213	0.1
214	0.1
215	0.11
216	0.12
217	0.13
218	0.17
219	0.22
220	0.24
221	0.25
222	0.3
223	0.33
224	0.35
225	0.38
226	0.37
227	0.35
228	0.33
229	0.3
230	0.26
231	0.21
232	0.17
233	0.13
234	0.12
235	0.15
236	0.17
237	0.18
238	0.19
239	0.19
240	0.21
241	0.22
242	0.22
243	0.19
244	0.18
245	0.17
246	0.16
247	0.15
248	0.14
249	0.11
250	0.09
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.1
262	0.08
263	0.09
264	0.12
265	0.12
266	0.14
267	0.14
268	0.14
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.12
273	0.11
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.1
279	0.11
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.08
295	0.06
296	0.08
297	0.08
298	0.1
299	0.12
300	0.13
301	0.15
302	0.15
303	0.17
304	0.17
305	0.25
306	0.25
307	0.25
308	0.27
309	0.26
310	0.25
311	0.24
312	0.22
313	0.14
314	0.11
315	0.08
316	0.05
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.05
326	0.05
327	0.08
328	0.12
329	0.13
330	0.13
331	0.15
332	0.14
333	0.15
334	0.18
335	0.15
336	0.13
337	0.13
338	0.13
339	0.11
340	0.1
341	0.1
342	0.09
343	0.1
344	0.11
345	0.12
346	0.13
347	0.14
348	0.15
349	0.15
350	0.14
351	0.14
352	0.12
353	0.15
354	0.14
355	0.17
356	0.18
357	0.18
358	0.17
359	0.17
360	0.16
361	0.13
362	0.12
363	0.09
364	0.07
365	0.06
366	0.05
367	0.04
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.04
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.08
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.12
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.1
388	0.09
389	0.09
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.08
397	0.1
398	0.1
399	0.13
400	0.15
401	0.22
402	0.28
403	0.38
404	0.44
405	0.53
406	0.63
407	0.72
408	0.81
409	0.84
410	0.89
411	0.91
412	0.94
413	0.96
414	0.96
415	0.95
416	0.94
417	0.92
418	0.91
419	0.89
420	0.86
421	0.84
422	0.76
423	0.68
424	0.61
425	0.57
426	0.56
427	0.48
428	0.41
429	0.34
430	0.32
431	0.34
432	0.34
433	0.37
434	0.3
435	0.36
436	0.39
437	0.4
438	0.42
439	0.39
440	0.35
441	0.33
442	0.32
443	0.25
444	0.21
445	0.17
446	0.15
447	0.15
448	0.16
449	0.12
450	0.15
451	0.14
452	0.15
453	0.16
454	0.14
455	0.14
456	0.12
457	0.11
458	0.12
459	0.13
460	0.17
461	0.19
462	0.25
463	0.32
464	0.42
465	0.5
466	0.55
467	0.65
468	0.71
469	0.79
470	0.82
471	0.83
472	0.83
473	0.82
474	0.75
475	0.67
476	0.56
477	0.46
478	0.37
479	0.29
480	0.18
481	0.11
482	0.08
483	0.06
484	0.06
485	0.05
486	0.06
487	0.07
488	0.09
489	0.1
490	0.12
491	0.14
492	0.13
493	0.14
494	0.14
495	0.13
496	0.14
497	0.13
498	0.13
499	0.12
500	0.13
501	0.12
502	0.12
503	0.11
504	0.09
505	0.08

J3NPW5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer